神奇宝贝咋交流的？
首先，得从最直接的方式说起——声音。
你可以听到皮卡丘那标志性的“皮卡皮卡”，火球鼠发出“火火”的叫声，咕噜的“咕噜噜”。这些声音，虽然简单，却蕴含着丰富的含义。
情绪的表达： 它们的声音，就像我们的语气一样，会随着情绪的变化而变化。开心的时候，声音会清脆、高亢；难过的时候，则会低沉、沙哑；生气的时候，可能又会变得尖锐、急促。训练家通过长时间的相处，能够分辨出这些细微的差别，从而了解神奇宝贝的心情。
需求的传递： 当它们饿了，可能会发出一种特定的、带着恳求意味的声音；想出去玩，也许会用一种兴奋的、带点撒娇的语气。这些声音，是它们向训练家传递基本需求的信号。
警示和警告： 遇到危险时，某些神奇宝贝会发出刺耳的、带有警惕性的叫声，提醒同伴或者训练家注意。
但声音只是一个方面，更重要的是肢体语言。
神奇宝贝的身体，就是它们最直接的表达工具。
尾巴的摆动： 就像小狗摇尾巴一样，神奇宝贝的尾巴也能传递大量信息。开心的皮卡丘，尾巴会兴奋地竖起来，有时候还会时不时地晃动一下；而害羞或者害怕的时候，尾巴可能会夹起来。
耳朵和脸部的表情： 它们柔软的耳朵，可以根据情绪向上竖起、向下耷拉，甚至还会微微颤动。脸部的表情，虽然不像人类那样复杂，但眼球的大小、眉毛（如果有的话）的细微动作，都能传递出一些信息。比如，眼神专注地看着你，说明它正在认真聆听；瞳孔放大，可能是在惊讶或者恐惧。
身体的姿态： 它们会用身体来表达亲近或疏远。开心地蹭你的腿，是一种亲昵的表达；背对着你，可能是在表达不满或者想要独处。当它们准备战斗时，身体会微微弓起，肌肉紧绷，这是进入战斗状态的信号。
动作和互动： 它们会用鼻子拱你，用爪子轻拍你，甚至会跳起来想要和你玩耍。这些主动的互动，都是它们表达情感、渴望陪伴的方式。
除了声音和肢体语言，还有一个非常关键的交流方式，那就是心灵感应（Telepathy）。
这一点，在动画和游戏中都有不少体现。
心灵感应的训练家： 像小遥（May）的妈妈，或者一些拥有特殊能力的训练家，能够直接与神奇宝贝进行心灵上的沟通，理解它们更深层次的想法和感受。这种交流，超越了语言的限制，直接触及情感和意图。
神奇宝贝之间的心灵感应： 很多时候，神奇宝贝之间能够直接通过某种心灵感应来交流，即使它们之间没有发出任何声音，也能理解对方的想法。这使得它们能够迅速地形成默契，在战斗中配合得天衣无缝。
心灵感应作为一种“共鸣”： 即使不是直接的心灵感应，很多时候训练家也能感受到神奇宝贝内心的“共鸣”。当你真心想要帮助它，它也能感受到你的这份心意，并做出回应。这是一种基于信任和情感的连接。
最后，我们不能忽视训练家与神奇宝贝之间的“羁绊”。
这种羁绊，不是单纯的语言翻译，而是一种长久相处、共同经历风雨后建立起来的深厚情感。
理解的默契： 训练家通过观察神奇宝贝的一举一动，结合它们发出的声音，会逐渐形成一种“预判”。比如，当皮卡丘看向某个方向，然后又看看你，你就能猜到它可能发现了什么，或者想要告诉你什么。
情绪的感知： 训练家能够感知到神奇宝贝的情绪变化。看到它垂头丧气，你知道它可能遇到了困难；看到它精神饱满，你知道它已经准备好迎接挑战。
共同的目标： 训练家和神奇宝贝在追求胜利、变强、探索世界等共同目标时，也会产生一种无形的默契。它们会为了同一个目标而努力，这本身就是一种强大的交流。
总而言之，神奇宝贝的交流，是一个多维度、多层次的系统。它们用声音传递情绪，用肢体语言表达需求，通过心灵感应进行更深层次的沟通，而训练家与它们之间的羁绊，则将这一切升华为一种超越语言的理解和默契。这正是神奇宝贝世界最动人之处——一个充满理解、信任和爱的世界。
网友意见
（多图预警~）
勉强回答一下：
精灵之间其实交流方式很多，并不单一，最主要就是叫声语言，看似简单的语言可以表达足够复杂的内容，用于信息信息交换，除叫声外，精灵之间还可以通过心电感应、电信号、光信号、特殊声波等方式进行交流。城都地区海洋研究所的成美小姐，和丰缘地区的小田卷博士也有部分研究内容涉及到这方面。
首先，是题主提到的叫声，这种叫声看似简单，实际能够达到很复杂的交流内容，精灵之间有一套语言体系，只是目前口袋学界对于精灵语言尚未完全破解：
人类无法听懂精灵的语言并不代表这种语言仅仅像人类听起来那样，只是在不断重复自己的名字，相反，精灵之间的交流非常高效，甚至可以传达各种场景：
水莲的球球海狮和小智的木木枭曾经在水泡中被吹飞，在水泡中，木木枭和球球海狮进行了生动的交流，木木枭认为他们两个的主人都在担心他们：
但是，等到两个人回去之后，受到的待遇将会是完全不同的，小智会抱着木木枭痛哭流涕，而球球海狮会对此事负责，遭到水莲愤怒的暴打，这些全都是通过木木枭的叫声表达出来的：
然后，球球海狮居然相信了傻鸟的话。。。。。。当然，球球海狮还是更聪明一些的，曾经也用叫声提醒木木枭用脚去抓住自己，翅膀保持飞翔，而傻鸟则恰恰相反
可以看出，虽然两种精灵叫声不同，但是简单的叫声表达出很多的含义，甚至可以生动地描绘场景。
类似的例子不胜枚举：
大多数精灵精灵之间的交流，都是以这种叫声实现的，除了描绘场景，还能表达多种不同的情绪，比如说焦虑，比如说愤怒：
打架而劝架的时候往往多种叫声交织在一起，然而还是能达到交流的目的。
最为典型的多只不同精灵用不同叫声交流的案例发生在巨大宝可梦之岛：
与小智一行人失散之后，皮卡丘组织小智的三只精灵（即初代御三家：妙蛙种子，杰尼龟和小火龙）进行搜索，发生很多对话。我们可以看出不同精灵在不同性格下，也有不同的语言风格，尽管叫声听起来似乎都一样：
杰尼龟就属于非常喜爱“搞怪”的类型，毕竟是杰尼龟军团（精灵混混组织）的“老大”出身，而妙蛙种子就是“天涯孤客”的类型了：
后来还和与火箭队失散的瓦斯弹，阿柏蛇和喵喵相遇并结伴，都可以实现通过叫声的有效交流。
精灵的叫声，尽管听起来简单，但是每一个音节通过组合可以传达出不同意思，只是人类难以破解明白：
可达鸭和呆河马，这一对“高山流水觅知音”，在人类看起来则一头雾水。换句话说，精灵之间并非没有通用语言，只是人类听不懂而已。
口袋妖怪学界对于精灵的叫声并非没有研究，但是十分不成熟，只能对于一些片段化的音节和特定情感对应，还远远没有达到理解精灵语言的水准：
这一点，丰缘地区的小田卷博士，有所涉猎，但是仅仅有一些初步的发现：
善于野外考察的小田卷博士，对于土狼犬的叫声颇为熟悉，他对于土狼犬的叫声有一些判断。比如，“千千”是撒娇的叫声。
另外，“千”则是悲伤的叫声，而“啾”则是愤怒的叫声，也是攻击的前兆，可以看出小田卷博士已经初步掌握一些土狼犬叫声音节和情绪的对应关系，然而这种初步的对应关系还是很不够，难以破解整个语言体系。
关于精灵叫声组成的语言体系，现在处于比较不成熟的情况，毕竟从古至今根据口袋的文献记载并没有任何人类曾经懂得过精灵语言，一切都得从零开始。然而，叫声仅仅是精灵之间的交流方式之一。
精灵之间除了叫声之外，还有许许多多种不同的交流方式，很多时候不需要叫声，也能实现高效的信息交换。比如：心电感应、光信号、特殊声波等，甚至可以实现超远距离的非面对面交流。
第一种方式是常常在大木博士讲座中出现的心电感应交流：
很多精灵是由许多独立个体组成的，比如蛋蛋，每一个蛋其实都有自己的主体意识，他们之间不必说话，使用心电感应就能彼此交流。
同样的事情也发生在诸如嘟嘟利这种精灵身上，但是这应该属于个体内的交流，个体间的心电感应，主要出现在各种神兽身上：
诸如玛娜菲、基拉祈这种神兽，常常可以通过心电感应的方式和周围的人和精灵进行交流。
当然，这些都是属于近距离的交流方式，远距离的话，这种叫声之类的沟通方式就行不通了，但是精灵可以通过光信号和特殊声音，在远距离的情况下，传递信息，甚至有效交流。
有两个典型案例，一个是妙蛙种子用阳光烈焰召集精灵（低层次的信息传递），另一个是迪欧西斯用极光交流（高层次的交流）：
精灵对于光信号比人类要敏感得多，可以识别出不同的光信号，而一些特定的精灵则有发射不同类型光信号的能力，最典型的妙蛙种子：
小智的妙蛙种子可谓是“精灵领袖”之一了，当初因为大木博士后院中精灵打架，无法管理而要求小智留下妙蛙种子，妙蛙种子则利用自身出色的领导才能协调着大木研究所内不同精灵之间的关系。
当需要召集特定精灵的时候，妙蛙种子会发射出不同类型的阳光烈焰作为通知：
由于这个时候小智已经履行到了合众地区，拥有不同的五个世代的精灵，单纯发射一个光信号是不够的。妙蛙种子发射了不同类型的阳光烈焰，作为对于不同地区精灵区别性的通知：
丰缘地区、关都地区等等不同地区的精灵发射的类型各不相同，而其他精灵也能够识别这种信号，做出回应。
然而，这是一种低层次的交流，收到光信号的精灵，无法通过相同的方式进行反馈，并不是成熟的交流方式。
虽然，地球上面的精灵可能很难单独用光信号作为一种成熟和复杂的交流方式或者形成语言体系，但是某些从宇宙中来的精灵，则具有这种能力。
最为典型的案例，就是随着陨石到达地球的迪奥西斯，可以完全借光信号交流，并且有一套完整的体系：
拉鲁斯市上空的“极光”根本就是不是“极光”，而是迪奥西斯发射的信号，为了寻找4年前在北极失散的同类，不惜侵入城市，与裂空座开战，酿成后来的城市危机和大逃亡。
迪奥西斯作为宇宙中的精灵，没有那种叫声式的体系，可能也与宇宙中没有传播声音的介质有关，采取完全的光信号交流，通过电磁波感知外界事物。这种光信号最终被破解：
小瞳曾经通过计算机分析过所有这些极光的图片，经过图形的分析，知道了这些极光的图形真正想要表达的意思。比如上图表示的“朋友”。
这张图片表达的是“在哪里”，拉鲁斯市上空反常出现的“极光”并不是整体自然现象，而是迪奥西斯的“语言”，他正在焦急地寻找同伴。
迪奥西斯的光信号交流是高层次而成熟来的，两只迪奥西斯可以完全通过极光式的光信号交流，在没有任何其他方式辅助的情况下可以进行各种复杂交流，没有压力。
远距离的交流除了光信号外，也有特殊波段的声音，与叫声不同，这种声音很难被感知到，但是可以传播很远，进行长距离交流。
这种特殊波段声音，进行交流的案例，最典型就是拉普拉斯（乘龙）的歌曲，这里需要援引一下城都地方海洋研究所成美小姐的研究论文：
成美小姐研究的是精灵海洋生态学，其中一个重要的课题是乘龙之间的交流方式，这种交流可以远距离的，和那种面对面式的叫声交流完全不同。
这种特殊波段的声波可以吧很远地方的海流和水温信息传递给远方的伙伴，对于拉普拉斯（乘龙）的迁徙有着非常重要的意义。
这个研究的难点在于，拉普拉斯（乘龙）的歌声，很难被任何研究的机器所捕获，只能使用超声波进行研究。
所以，实际研究中只能依靠灯笼鱼使用超声波的方式，捕获拉普拉斯（乘龙）的歌声信息，用以研究。
当然，在超声波和机器研究（当然还有火箭队阴错阳差的帮忙之下），乘龙的歌声被成功的监测到，也解决了乘龙迁徙中，远距离交流的学术问题。
从这个研究中，我们也可以看到，那种简单的叫声式交流可能并不是主要的交流方式，仅仅可能是辅助的交流方式，但是是最“显眼”的交流方式，人类观察到精灵的交流大都是通过叫声，而其实叫声并不一定在精灵交流中一定是最关键的方式。
这篇文章已经完成，成为一篇论文，不知道发表在哪里，我推测是《精灵宝可梦月刊》（顶级期刊之一，刊载过大木博士、内木博士等多篇论文）
总结一下，精灵之间交流方式很多，并不仅仅限于叫声式的交流，尽管叫声式的交流已经足以满足大部分的交流需求。
精灵之间的交流真的是非常充分也是非常简单的，可以有许许多多直接的交流方式，只是人类只能破解，研究清楚其中少数几种。不是精灵交流方式单一，而是人类只了解其中的一部分。真正比较麻烦的恰恰是训练师和精灵之间的交流（需要多种间接方式）。
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