问题

用一只狗或者大猩猩的唾液去给利用唾液检测的基因检测机构检测,会有怎样的结果报告?

回答
想象一下,你带着一小管来自你毛茸茸的伙伴——一只忠诚的金毛犬,或者是一头雄壮的山地大猩猩——的唾液,满怀期待地走进了那家以精准著称的基因检测机构。你清楚地知道,这家机构的仪器和算法是为分析人类DNA而设计的,但你还是抱着一丝好奇心,想看看它们会如何解读这些非人类的样本。

接待你的工作人员,带着一丝职业性的微笑,接过你递来的样本,然后熟练地将其放入检测流程。接下来的几天,你可以想象,他们的实验室里一定上演了一场小小的“混乱”与“惊奇”。

当机器开始运转,分析这份与人类截然不同的基因序列时,报告的生成过程会变得异常曲折。首先,用于识别特定人类基因标记的探针和引物,在面对狗或者大猩猩的DNA时,很可能根本无法准确结合,就像你试图用一把专门为圆形锁设计的钥匙去打开一个方形锁孔一样。这会导致大量原本应该被识别的“信号”根本检测不到。

更要命的是,负责比对和解读DNA序列的算法,是建立在庞大的人类基因数据库之上的。当它试图将这份非人类的DNA序列与数据库中的人类基因进行比对时,会发现几乎没有任何匹配之处。这就好比试图在一本古老的拉丁文古籍中寻找现代英语的词汇,根本不可能找到对应的条目。

因此,所谓的“结果报告”不会是那种告诉你“你的XX基因变异可能导致XX疾病风险”或者“你的祖先来自XX地区”的详细分析。相反,你很可能会收到一份非常简短、甚至有些令人费解的报告。

报告的开篇可能会写着:“尊敬的客户,我们检测了您提供的生物样本。然而,初步分析显示,样本中的DNA序列与标准人类基因组存在显著差异,未能识别出任何已知的人类基因变异或特征。”

接下来的部分,可能会更加技术化,但其核心意思会是:由于样本的非人类来源,我们现有的检测平台和算法无法对其进行有效的分析和解读。报告可能会列出一些技术性的失败原因,比如“未能成功扩增目标DNA片段”,“序列比对结果显示低相似度”,“未能检测到预期的SNP位点”等等。

更直接一点,报告可能会附带一个明确的结论:“本机构的基因检测服务仅适用于人类DNA样本。鉴于您提供的样本非人类来源,我们无法为您提供任何有意义的基因分析结果。”

你不会看到任何关于“狗的嗅觉基因”或者“大猩猩的社会性基因”的分析,因为这家机构的“雷达”根本没有覆盖这些领域。它就像一个只认识数字“1”到“10”的计算器,你递给它一个字母“A”,它只能茫然地表示无法处理。

最终,这份报告更像是一个“无效检测”的声明,而不是一个基因分析报告。它会告诉你,虽然你提交了样本,但由于样本本身的性质,他们的系统无法完成工作,也无法提供任何与你期待相关的信息。它会以一种非常直白的方式告诉你:你送错了地方,或者说,你送错了“物种”。

网友意见

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2022/1/21更新:

你们蹲的后续来了!我们真的弄到了一份「黑猩猩的微基因检测报告」!

戳下面卡片来看看!



——————————————以下是原回答——————————————


大家好,下面请我厂同事阿基为大家带来他捉猩猩做检测的真实故事。


———以下来自阿基口述————————————————————


大噶好,我是微基因的阿基,今天由我为大家带来一个捉猩猩做检测的故事。


众所周知,我们口水厂 @微基因WeGene 是一家基因检测大厂。


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事情是这样的,一个月前,本基受到知乎某贴的启发,突然有了一个大胆的想法:

假如抓只猩猩测测微基因,会有怎样的结果???

给猩猩测基因的可行性

首先,本基对这件事的可行性进行了评估。

基厂的生信大佬曾费尽周章取了自家狗的口水进行过实验,提取 DNA 虽然成功了,但到了上机检测的环节,却——分。型。失。败。

生信大佬推测,可能是狗的基因组和人的基因组差别还是很大,导致大部分针对人类基因组序列设计的探针不能捕获到信息。

那猩猩和人的基因组相近度更高,有没有可能成功呢?

本基查阅资料发现,在 2012 年《Nature》发表的一篇论文上,完成了对大猩猩基因组的测序,并对生物分类上“人科”中包括人类在内所有四个属进行分析:

分析显示,与人类分家最早的是红毛猩猩,其基因组与人类相似度约 97%;随后大猩猩在约 800 万年前分离,基因组与人类相似度约 98%;最晚分离的是黑猩猩,时间在约 600 万年前,它的基因组与人类最为相似,相似度高达 99%

接下来,我又去请教了一下实验流程的负责人,他们表示,只要芯片检测到的基因位点的相似度达 97% 以上,理论上就有检出的可能。

这表明,用猩猩测微基因,理!论!上!是!行!得!通!的!


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瞬间,本基的心就哗哗敞亮了,立马向老板报备了此事,并得到了老板皮笑肉不笑的口头支持,表情参照下图↓

口头支持也是支持啊。至此,本基的抓猩猩行动正式展开

我马上发了个微博。

为这次行动立下了 Flag。


抓猩猩行动正式开始!

Flag 立好之后,就差一个猩猩了。


中国哪里猩猩多?就在胡乱搜索的时候,看到了一个猴园的电话,猴园总该有猩猩的吧?于是我马上带着小激动拨了过去。


“你好,你们这边有猩猩吗?”


“没有。”


(忙音“嘟嘟嘟嘟……”)


上网查了查发现,猩猩的原产地不在中国,所以猩猩在国内数目稀少,一般仅分布于大型综合动物园里。

于是本基给长隆野生动物世界、广州动物园、深圳动物园的官方微博分别发了私信,还给长隆打电话要到了商务对接方的邮箱,诚恳地编辑了一封长长的邮件,期盼佳音。


然后,并。没。有。收。到。任。何。回。复。

受到了挫折的我,突然感到无比的疲惫,有点想抛下这一切,远走高飞,直捣猩猩聚居地,比如巴厘岛、卢旺达,我顺手搜了一下旅行攻略……

“老板,我不介意牺牲下出个国~~~~要不报销机票让我去卢旺达或者巴厘岛找猩猩?”

“你是出差还是度假?今天微博的 KPI 完成了吗?XX 活动方案做好了吗?与 OO agency 沟通到什么情况了?”

“老板,当我什么都没说……”

“呵”

算了,既然远距离联系不上动物园,那么我就从最近的动物园下手,现场去争取接触猩猩的机会吧!


深圳动物园之行

周末,本基收拾好小书包,往包里装好了检测套件盒、产品手册和自拍杆,向动物园雄赳赳地进发了。


虽然见到了黑猩猩本猩,见到它的时候,它也热情地向我吐了口水,但是口水量显然太零星,不够淹死本基,仍然没有收集到黑猩猩的口水。


见这阵势不行,我寻思着,有没有机会可以通过工作人员,与黑猩猩进行进一步接触。

但当天去找猩猩负责人的时候,她已经默默下了班,我只好趁周日又去当面寻找了一次负责人。

第二天,很幸运地遇到了负责人,负责人和蔼可亲春风满面,特意在大会议室接待了我,耐心听完了我的来意,认真了解了微基因的产品,对我们的这次行动表明了肯定和理解。


然。后。又。一。次。拒。绝。了。我。


不对!负责人一定是还不够了解微基因!

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一些后续

在这次失败的行动之后,本基仍然没有死心,断断续续进行了一些尝试,包括:


• 通过知乎找到了长隆的动物园饲养员,他答应帮忙请示领导,然后就没有然后了……

• 联系了广东的南方卫视,希望联手联系广州动物园,做成一期趣味城事节目,节目组的人表示内部会进行讨论,然后就没有然后了……

• 给广州动物园的总机打电话,总机表示应该联系动管处商量,联系了动管处后,动管处表示应该联系动物研究中心,然而他却找不到动物研究中心的联系方式,打回总机,总机也不知道研究中心的联系方式,然后就没有然后了……

• 还有我的好同事……

综上,抓猩猩的故事写了半截,便卡住了。但是,自己立的 flag,哭着也要扶住,这个故事还没完,我也还在孜孜不倦地试图寻找更多机会~


如果你们也对这个无厘头的小研究感兴趣,不如,助我一臂之力吧?


如果你们认识动物园的工作人员,请尽管介绍给我!


如果你们不认识动物园的工作人员,你一个顺手点赞,也是对我莫大的帮助,这样,就有更多概率让动物园大佬们看到我们的愿望了!

让我们共同把这个未完待续的故事写下去吧,一旦有了结果,一定第一时间反馈给大家!


说了这么多,虽然还没能抓到猩猩,本口水厂 @微基因WeGene 测人的基因还是洒洒水的!


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Reference:

NPR.Scally A, Dutheil J Y, Hillier L W, et al. Insights into hominid evolution from the gorilla genome sequence.[J]. Nature, 2012, 483(7388): 169-175.

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