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量子化学软件 Gaussian 为什么要把很多大牛和高校列入禁止使用名单? 第1页

  

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如今bannedbygaussian这个网站已经作古了,只能从archive里看到了。这些年里,我也和Gaussian以及其他各个软件的开发者(包括这场纷争里的诸位主角)有过深入交流,从各个角度了解了整个江湖恩怨的来龙去脉,整个事情在“欺师灭祖”,“利益之争”的背后,更多的是软件开发的路线之争。 希望用这个回答帮大家梳理一下这段讳莫如深的历史吧。

要说Gaussian必然要提到几位很重要的人物:John Pople, Mike Frisch, Martin Head-Gordon,或许再加上Peter Gill。

大家最熟悉的应该是Pople,他是Gaussian之父,诺贝尔奖,他开创了Gaussian基组在电子结构计算中的使用。

Mike Frisch(以下都称他Mike吧)其实是一个电子结构领域的不世天才,虽然大家可能都不知道他,最多也就是知道他(一直以来)作为Gaussian的主席“臭名”。他是在1979年进入Pople门下读phd的,在他加入的时候,Gaussian还是一个免费的软件,有着一些基础的功能,比如可以计算HF和MP2的能量,能够算到d电子。Mike 加入后马上就上手做了很多工作,比如HF和MP2的梯度计算,几何优化,并且成为了Gaussian的leading developer(当时版本大概是G82),当然他在博士期间最著名的工作,应该就是为Pople基组定义了极化函数和扩散函数,也就是后来被广泛使用的6-31g*,6-31+g*等等基组。当然Mike很快也就毕业了,去了Berkeley的Fritz Schaefer那里做博后。可能博后的压力不大吧,博后期间他一直在领导Gaussian的开发,这个期间他结合Jan Almlof 的想法,做了有很多direct, semi-direct algorithm的工作,大大提升了Gaussian软件的效率。同时,他将Berny Schlegel等人的几何构型优化,过渡态优化的工作也结合进了Gaussian (这一些工作的加入当时受到了Pople的一些阻力,但最终Mike还是成功说服了Pople)。等到G86发布的时候,Gaussian已经不仅仅是一个计算能量的量子化学软件了。它可以计算化学反应,化学热力学,红外光谱等等。越来越多的实验化学家开始注意到了Gaussian这个软件,而这个版本的时候Mike的名字已经是在Author list的第一位了。

时间到了1985年左右,Schaefer实在无法忍受加州开放的宗教氛围,决定前往大红州佐治亚去坚守他的神创论思想,Mike大概也就在这个时候离开了Schaefer的组,在一个叫Multiflow computer的电脑公司挂了一份闲差事,并且兼职继续领导Gaussian的开发。在同一年,Martin Head-Gordon (以下都称他为Martin吧)拜入了Pople的 门下。

Mike和Martin和电子结构方法有着一样的热情,天赋,和理想。他们在那个时候一见如故,并且成为Gaussian开发的中流砥柱。在那段时间Martin最重要的工作就是:1)电子积分的HGP Prism极大的提高了ERI的计算效率;2)波函数稳定性的判定,Mike在此基础上极大的优化了Gaussian的SCF模块,这个模块的强大稳定性和收敛能力至今碾压任何其他软件,3)开发了QCISD方法,为Gn系列方法和Pople倡导的Model Chemistry奠定了一块重要基石,当然这些方法的代码都是Mike手把手带着Martin一起码进Gaussian的。而同时期,整个理论化学届也有了一个大爆发,比如Bartlett的CCSD[T]和Raghavachari的CCSD(T),Knowles,Handy,Olsen在CI方向做出了determinant-base algortihm这个重大突破,Roos的二阶梯度MCSCF也在这个时候问世。理论化学一时间风起云涌,各种新颖的理论方法的出现无疑加重了Mike作为主要开发者的工作压力。

这个情况下,Mike觉得 1. 他本人很难在兼职的情况下投入更多的精力来领导Gaussian的开发,2. 当面免费的模式不能可持续的适应软件开发的要求。所以他向Pople提议将Gaussian商业化运作,即用license的收入来进行后续的研发。Pople对此表示同意,于是从1987年开始 Gaussian Inc成立了(最初叫Lorentz Inc),而Mike从公司成立伊始,就是公司的主席。很多人是不是会疑惑为什么Pople不当主席?原因有二, 一是Mike确实是Gaussian开发实际的掌舵人和决策者,二是Pople本人对商业化这个事情对此并不是很在意,他当时忙于他认为更重要的事情,也就是研究和推广DFT,Peter Gill就是在这个时候进入Pople 门下并以DFT作为其研究方向,并且对在Gaussian中实现了很多开创性的工作,比如一直使用至今的高效数值格点。

从软件发展的单一角度来说,Gaussian Inc的成立是起到促进作用的,成立伊始的这段蜜月期Gaussian加入和非常多样的方法(从半经验到CIS激发态,各种新颖的基组和赝势),软件的功能扩展到了光谱模拟,非线性光学性质计算,轨道/电子密度分析等等。但是可惜的是好景不长,各种矛盾随之出现。 最初的问题出现在Pople身上:Pople是一个非常慷慨的人,虽然Gaussian已经商业化运营,但凡是他的朋友问他要一份Gaussian的copy,他从来都是免费给别人(在他的思路里他依然还是将Gaussian认为是他初创时的那个community tool)。这个做法一是减少了Gaussian Inc的收入,但最大的弊端是,很多人拿到Pople的免费copy后会魔改并加一些自己的方法,取一个新的版本号放回Quantum Chemistry Exchange Program上 (这是G70最初发布的平台),这段时间Gaussian有着各种各样的版本流传,而且大部分都不是由Gaussian Inc发布的,这造成了一定程度上计算结果和计算效率的不统一。Mike认为John的做法不但有在收入上有损于Gaussian的持续性发展,更是对Gaussian声誉的不负责(主要也是和他version control的理念不符),而Pople对此是不以为然的。这个事情让Mike和Pople开始生隙,几年以往,分歧也就变成了决裂。在1991年,Mike要求John离开Gaussian Inc,而且根据当年的NDA,Pople在接下来8年时间里都不能从事商业量子化学代码的开发。这对于Mike来说确实是一个艰难的决定,但当是他自己是以为多数人会理解他的。事实是,这是真的!不管是Gaussian内部,还是学术界,真的有很多人支持他,这些人里有不满Pople做法的,有本身没有被Pople fairly treated的,还有支持Mike的(Mike在87-91这4年里向Gaussian加入了很多理论化学家的方法,很多人对自己的方法可以被广泛使用而对Mike心存感激)。但是Mike最希望得到理解的人,在当时他最最志同道合的挚友, Gaussian蓬勃发展的亲历者推动者,Martin Head-Gordon选择站在老师Pople这一边,这是对于Mike最沉重的打击, 而这个时候他也开始变得不理性了。除了Martin以外,Peter Gill,还有Pople 曾经的学生比如Mark Gordon,以及他的很多朋友比如Schatz,Bartlett自然也选择站在Pople这边。眼看这场站队运动声势越来越大,Mike作出了一个史无前例的完全非理性的决定,那就是禁止不仅是Pople,还有那些所有支持他的人使用Gaussian,也就是那个有名的bannedbyGaussian (其表现形式为不卖license给他们)。当然,后来有些人或是为了表达自己的正义之心,或是为了拔高自己在学术圈的道德水准继而提高自己的学术地位,主动的把自己的名字加入了这个名单,这倒也是后话了。

到这里为止,我基本讲完的Gaussian从开始到分家的所有故事,包括bannedbyGaussian的由来。这件事情的本质,还是软件开发的路线,Mike主张的commericial software,Pople更倾向的是community package。但其实在今天,Gaussian的开发模式已经是这两者的结合了,但可惜的是在当时,这个矛盾并没有得到调和。从那之后,理论化学开始站队,这个恶劣的影响一直到今天还在学术圈若隐若现。

但最后还是想提一点,Gaussian的分家发生在90年代初,但这件事情真正在舆论上形成影响力被广泛报道,却是2000年左右。原因有二:一是98年Pople获得了诺贝尔奖,二是Gaussian98才是Gaussian真正开始大获成功俘获大量理论和实验用户的开始。(Mike本人在1994年用HF以及Becke exchange, LYP以及VWN correlation合成了理论化学迄今为止最大的魔法,B3LYP。这个泛函在G94第一次出现,在G98裹挟ONIOM,TD-DFT横扫几乎所有应用)


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“我举报女友吸毒,自己反而被判刑六个月…”


今天的推送我觉得是所有去夜店蹦迪、电音节的人都应该看的一篇文章。


tututu先讲个真实发生过的故事:


主人公是个白纸男孩,我们就叫小白吧。


小白去蹦迪认识了朋友的朋友Yuki,Yuki是个留学生、老夜店玩咖,一看到小白跟个宝藏男孩一样,就疯狂的去倒追小白,两个人就在一起了。


在一起之后,Yuki就经常会去小白家里睡觉。


但因为Yuki在美国留学的时候喜欢飞叶子(大麻),每次事后就喜欢在小白家里自己卷上一根。


一次、两次、三次…小白实在受不来了,他是个小白纸啊,咋可能找个会飞叶子的女朋友啊?


两个人就吵架,小白说:“你以后不能碰这种东西了。”


Yuki就跟他说美国叶子合法之云云,两个人越吵越厉害,小白气坏了说我现在就报警叫警察抓你!


结果Yuki也是个岔道B,她说你报警就报警,我他妈现在就自己举报我自己。


警察就来了,一到现场,好,看到叶子了,给小白和Yuki验尿,小白没事,Yuki倒闭了,警察跟说Yuki得被关进去十四天,完了Yuki就进去了。


行政拘留十四天,第一次吸毒被抓都是这个处理结果。


接下来就到了这个故事最他妈精彩的部分了——


小白知道自己没事啊,就问警察叔叔说我要不先回家了?明天还得早起去上班呢。


警察叔叔笑了笑,就跟小白说你更走不了。


“吧哒”,一个手铐跟呼啦圈一样拷小白手上了,“您因为涉嫌容留他人吸毒,请配合调查。”


那一刻小白的心里真的是日了大狗了。


两个月后,法院判决结果出来了:


小白在三次明知女友在自己家吸毒的情况下,仍然容留她,为其提供吸毒场所,触犯了《中华人民共和国刑法》,判有期徒刑6个月,罚款5000元。


你是不是觉得这个故事在扯犊子?


你会觉得,WTF??小白连他妈碰都没碰,他简直太无辜了!


但对不起,这个故事就是现实中的判例:


而且判的合理合法,没有任何错误。


因为根据《中华人民共和国刑法》,容留他人吸毒的量刑标准就是三年以下有期徒刑,这个跟你吸不吸没有任何关系。


你说那我假如夜店认识了一个女生,我把她带回酒店满分,但她却要打气、飞叶子,我根本不碰这些东西,我就是在旁边守株待兔玩手机呢,我这也得被判刑么?


是的,如果缉毒警察突击进来,那你就拉闸了。


要是她还带了几个女生一起,是在你酒店房间高轰趴,那情节更严重,还得加刑。


你得被判半年,那个害你入狱的岔道B,没准被关了14天就出来了,还能去监狱探访你呢。


她还会隔着玻璃跟你说,兄弟你太惨了,我就是被关看守所里而已,环境还不错呢,你咋就进监狱了呢?等兄弟你出来之后我请你蹦迪好吧!


之所以要写这篇文章,是因为昨天朋友跟我吐槽了她以前一个蹭住的朋友,那个朋友就天天蹭住在她家里,她那个蹭住的朋友不仅每天带不同的男生回家,还玩东西。


我朋友给我吐槽的时候,她就根本不知道她已经触犯了刑法里“容留他人吸毒”这条罪名。


这也让我意识到,大部分的蹦迪选手也好、电音节Raver也好,其实都缺乏法律常识的,不知道有一条罪名是“容留他人吸毒”,总觉得“我不碰,就一点关系都没有”,真别等到自己被关半年,才后悔自己是个法盲。


我不知道这个数据是不是正确的:


但根据2019年国家禁毒办发布的中国毒品形势报告,登记在册的吸毒人员是214.8W名,这个群体其实鱼龙混杂,人们总觉得吸毒的都是黑社会、站街女,其实不是。


富二代、女艺人、留学生、网红、导演、金融…各行各业都有,所以如果你常去电音节和夜店,总会不可避免的接触到这类人。


这是很常出现的一种情况:


你知道对方吸毒,对方却不会像电影里一样教唆你吸毒,反而是在你好奇的时候严厉呵斥你,让你别碰这种东西。


而你自己也有一定的自制力、明辨是非的能力,不碰那些东西。


你会发现对方也并不像电影里描绘的那样精神错乱,反而温和有礼,跟你还很聊得来,而且人家还有正当工作,并且杰出优秀。


于是你们渐渐的变成了好友,你们会一起去电音节或夜店,之后你们还会一起在酒店的房间里轰趴、小酌。


他有时候还会来你的城市,你会直接让他住在你家里,因为你信的过他的人品。


他会在你的酒店房间、你家玩点东西什么的,当然每次你好奇的时候,他都让你别碰这些。


结果有一天恰好是电音节的时候,一个瘾君子被警察抓了,他又跟警察报出了很多他知道的名字,于是你朋友就被点了,警察来抓你朋友,直接敲开了你酒店房间的门。


一进门,你在沙发上玩手机喝酒上头呢,你朋友在那里玩东西。


最后的结果是什么呢?


你朋友被关14天,而且他是行政处罚,你得被关半年甚至更久,你这个叫刑事处罚。


所以我希望所有蹦迪选手、Raver都能记住这一点:


不管你碰不碰那些东西,请务必不要收留任何人在你家吸毒。


也别随便让吸毒的人来你家,你咋知道人家会不会因为你抢过他的小哥哥/小姐姐,所以故意接近你,去你家吸毒,自己举报自己,然后跟你来个同归于尽呢?


最后我想来理性的谈谈毒品和法律这个问题。


不可否认吸毒对于灵感创作、人生顿悟的帮助,比如许多画家、作家、音乐人都通过毒品创造了传世的佳作,比如柯尔律、济慈、勃朗宁、伯勒斯、梅勒、金斯堡、迪克、卡林、斯蒂芬金,甚至连白求恩都是经过一段毒品、糜烂的生活后,才寻找到了人生真正的意义。


但须知,世界上没有对错,所谓价值观即是多种利益之妥协,法律乃是社会契约所成,法律的本质目的在于维系社会的稳定,在大部分人生命权益的自由和小部人创作灵感的自由中进行取舍是困难的,这就像“电车难题”一样,从来不会有一个答案,每个人的答案都是主观的。


但如果我是立法者,我仍然会坚定的在毒品和枪支两件事上以重刑。


很多自由派会批评社会过于追求稳定,但须知一个人生在中国,他大可以在凌晨三点放心的出门,他不用担心自己乘坐的地铁会突然爆炸,更不用担心自己的办公室会突然遭到枪击,甚至连新冠流行你都会像没事人一样轻松。


但生在其他国家,你必须为这些事情担心,这个世界上没有能够兼顾到所有人、所有事的法律,没有尽善尽美的制度,任何一种法律和制度都是在各种问题上进行取舍得出一个答案而已。


很高兴认识你,我是tututu、一个从衡中考到上财之后不务正业的蹦迪博主,并莫名其妙写着写着就成了中国最大的蹦迪公众号,如果你想看更多有趣的蹦迪文章,请关注公众号 满分激光枪


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结果Yuki也是个岔道B,她说你报警就报警,我他妈现在就自己举报我自己。


警察就来了,一到现场,好,看到叶子了,给小白和Yuki验尿,小白没事,Yuki倒闭了,警察跟说Yuki得被关进去十四天,完了Yuki就进去了。


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两个月后,法院判决结果出来了:


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但对不起,这个故事就是现实中的判例:


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