实际具体使用中,哥猜,黎曼猜想什么的,都是假装当作结论用的,费马大定理被证明之前不也是这样。
但从数学角度,还没办法证明,无法进入公理系统,所以在数学证明中不能当作公理。不过也有很多基于某猜想成立的研究,比如黎曼猜想就有很多拓展研究,这些研究假定黎曼猜想是公理,一旦证明黎曼猜想就能成立,这也是黎曼猜想的重要性所在。
至于你说的几何平行公理,历史遗留问题,名字叫公理实际上也进不了公理体系。而且几何第五公设和哥猜有本质区别,平行线是人为定义的,和原来的公理体系不会有冲突。