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29% 新冠病毒样本出现 D614G 变异,世卫组织称「不是新的变异,已在欧美传播」,意味着什么? 第1页

  

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北京最近流行的就是这个病毒株D614G。

下图是北京此次上传的新冠病毒序列变异性性,红框圏出的地方,恰好就是D614G。

————不是新变异,但是也不老,而且传播更快——————

这个变异的确不是新变异,因为这个变异最早应该是在2月份(Feb 16)出现的。但是传播速度非常快。

看一下下图是流行病学统计,这个病毒株在短短一个月内就迅速攀升[1]。

在2月之前的时候,全世界流行的病毒株主要是D614(橙色),但是从2月起,新的突变株G614(蓝色)开始快速增加,并且迅速成为了占世界主流的病毒株,这一情况在全世界各地都在上演。以至于到了4月的时候,全球的主要流行病毒株一半以上是G614病毒株了。

一个病毒株快速扩散,有两种可能

1,建立者效应

病毒去征服一个新领地了,新感染人群的病毒类型主要受出现在该地的病毒株影响,也就是生物学上的建立者效应(奠基者效应)

2,新病毒株感染能力强

还有一种可能,就是一个感染力强的病毒株和感染力弱的病毒株同时出现,那么感染力强的病毒株会迅速扩散压过感染力弱的病毒株。

其实,这个通俗的可以视为大家熟悉的R0,R0越大,扩散越强。

但是我们觉得从流行病学上,可以排除1,因为这个病毒在多个地方都呈现了后来居上的趋势。

事实上,无论是欧美还是亚非,都是类似的趋势,就是这个新的病毒株比例会迅速增加,那么,这就不是单纯的建立者效应了。

因为在很多国家,D614和G614是同时存在的,此消彼长,那基本上可以认为不是建立者效应的影响了(或者存在,但是相对较小)。

————多个实验室证实D614G的确具有更强的感染力————

事实上,多个独立实验室都佐证了这个新的病毒株,的确具有更强的感染力

1,G614感染力比D614高出9倍以上。

来自佛罗里达州Scripps Research Institute的研究人员用新冠病毒关键蛋白S蛋白构建了D614和G614的伪病毒并用来感染人肾上皮细胞系293T,然后检测感染后细胞中的荧光变化,发现变异后的G614感染细胞能力明显提高,如下图中的所示,G614感染细胞能力要高出D614一个数量级[2]。

2,G614感染肺细胞、肝脏细胞和结肠细胞能力更强

来自纽约基因组研究中心Neville E. Sanjana团队采取类似的策略构建了包含D614G在内的新冠S蛋白伪病毒,然后用其来感染三种人体细胞,分别是肺细胞(A549)、肝脏细胞(Huh7.5)和结肠细胞(Caco-2),然后用流式细胞计数来检测感染后的荧光强度[4]。



结果发现D614G变异在三种细胞系中均提高了伪病毒感染细胞的能力,起提升比例高达2.4-7.7倍,尤其是在肝脏细胞中,这种变异后感染能力提升最为明显。


不仅仅是细胞研究层面,事实上,在现实群体检测中,也观察到了类似的情况,G614患者体内的病毒量要高于D614患者体内的病毒[1]。


(说明,上图是检测的循环要求,越低表明病毒载量越高,可以看到G614患者病毒载量更高)。

上述研究都佐证了一个事实:D614G属于感染性更强的病毒株。

——————新病毒株感染力更强,可能是因为变异改变了结构——————

当然,进一步深入探讨,那么就要回归到结构上了。

G614之所以传染性这么强大,跟这个变异有很大关系。D614G发生在新冠病毒的S蛋白区域。也就是新冠病毒表面那些凸起的地方,也是新冠病毒命名中的“冠”的来源。这些凸起对于新冠病毒本身至关重要,它可以和我们细胞上的ACE2受体进行结合,使得我们的细胞将其当做正常物质而吞入,于是就发生了感染。因此,S蛋白对于新冠病毒来说就是一把开启细胞的钥匙。而这个D614G的变异,恰好造成了S蛋白结构发生了一些变化。


如上图所示,D614G导致了病毒核心S蛋白的构象发生了改变。原本和相邻的T859之间的氢键作用力发生了改变,而这种改变会引发病毒感染性的改变,这一点在上文中已经证实了。


所以,最后结论就是,这个病毒大概在2/3月份出现,并迅速取得了传播优势。而实验和流行病学证实该病毒的传播性增强,其原因在于该变异导致了病毒核心蛋白S蛋白的结构变异。


1 Spike mutation pipeline reveals the emergence of a more transmissible form of SARS-CoV-2

2 Lizhou Zhang et.al,The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity

3 Zharko Daniloski et.al,The D614G mutation in SARS-CoV-2 Spike increases transduction of multiple human cell types


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意味着新的反华浪潮即将到来。

把一切瘟疫衍生问题诿过于中国,在以美国为主导的西方世界是具有深厚群众基础的政治正确,美国七月份的企业债集中兑付即将到来,对向外转移矛盾的刚性需求愈发饥渴。

这恰是美国法痞讼棍产业链创收盈利的好时节

不出意外的话,对中国企业的攻击,对华负面议程的设置,对中国地缘的围堵,对中日韩一体化进程的破坏即将大干快上,反华工作将全面加速。

八月份是中日韩自贸的正式签字工作,看好吧,某些逆民分子会突然爱国起来,什么钓鱼岛啊,独岛啊,朝核啊,慰安妇啊,等等,诸如此类狗屁倒灶的问题会集中发酵一波。

然后华为,中兴等企业相关议题也会再起波澜,澳大利亚,加拿大等小丑也会开始一顿捧哏。

什么日记啊,电影啊,纪录片啊,各种乌烟瘴气的东西也会群丑齐聚。

总而言之,对于大明来说,瘟疫越严重,财政越亏空,就越要抓建虏,只要抓建虏就行,反正目的又不是抓建虏。


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李登辉这个人,看似奸诈,实则昏聩。

台湾(省)从蒋经国手里交到李登辉手上时,产业方面是四小龙里最强的。韩国在李登辉主政时,人均在四小龙里陪坐末席。但是李登辉依据神棍张家墩的理论,做出戒急用忍的决定。台湾企业失去了最佳的升级产业,扩张市场的时机。

台湾相对于韩国的劣势,不是人才不够,技术不行,而是岛内市场不足,很难在自己的一亩三分地把产业养大做强,韩国毕竟还有5千万人。李登辉的总路线,就是放弃得天独厚的,的最大优势,与大陆市场若即若离。

所以这个人,见蒋经国坐半个凳子,分裂国民党的手腕绵长深远;方方面面精算犹如偷袭珍珠港前的军部,但是对大局的预测,笨的一塌糊涂,也是军部一个水平。归根结底,只是政客,不是政治家。

当然对中国大陆而言未必是坏事,这一点和香港李家把数码管项目搞的完全走样是一样的。


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同为西部省份,作为地方工业和信息化部门,随便答一下,不一定准确。

首先最大的优势是税收优惠。本来一个在东部发达地区的互联网公司,有软件研发部门和机房运营部门。互联网公司每年收入1亿,其中软件研发部门花费5000万,机房运营维护部门花费1000万,剩下4000万利润中,需缴纳一半的税,即2000万。

现在该公司拆成两个子公司,其中研发部门仍在人才密集的东部,机房运营部门搬到贵州,公司在通过做账,将研发公司每年的收入限定在5000万,即研发公司没有利润,在贵州的数据运营公司每年收入5000万,支出1000万,剩下4000万的利润中,贵州当地只抽25%的税,即1000万,则公司所得的利润是3000万。这实际上可以看成是挖发达地区的墙角。

但优惠政策不仅仅是贵州有,其他西部贫困省份也都有自己的优惠政策,为什么单单是贵州发展起来了呢?另一个原因在于贵州机房建设成本低。除了低在哪?不是因为地价便宜,而是因为贵州多山,大部分机房可以建在山洞中。在山洞中建机房,除了传统的冬暖夏凉的优势之外,还有一个最大的好处就是不需要国土部审批太多的建设用地。

根据18亿亩土地的红线政策,各地方将土地作为商业或工业开发,需经国土部批准。但这些土地指的是地面上的土地,挖山洞由于并不破坏山体表面的树木和梯田,国土部的卫星也看不到山体内部的施工情况,故贵州只需要很少的一部分公路建设指标,即可获得了很大面积的机房建设用地。而其它省份既使有闲置土地,在没有国土部用地指标的情况下也只能让其抛荒干瞪眼。

至于电力便宜,西电东输的大部分输出省都便宜。

总的来说,贵州大数据经济是否能带动贵州有实质性发展目前还需观察,但贵州能抓住一切有利因素,在一票西部省份中脱颖而出凭空做出一个产业聚集,还是值得肯定的。


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三更,今天做了第二次核酸检测

8月7日,已经隔离了三个星期零一天,我们小区进行了第二次核酸检测,有些小区已经进行了第三次。

这一次是十人一组的检测,组数更少,检测效率更快。

有一个小小的愿望,希望这次我们小区没有事的话可以允许我们下楼活动。

——————————————————————————

二更

在这个特殊的时期,写这些文字更多是一些生活的记录吧。这是我,一个在外求学的学子,陪我的家乡经历的一场考验。其实并不希望有这样的机会,但是也很珍惜现在的时光。

其实我们所有人的想法都是相同的,希望公开透明的信息披露,希望一些更有效的措施,希望新疆快点好起来。

谢谢大家的关心,我自己也会稳住、挺住。

想更一些心疼社区工作人员系列。

其实我对社区的工作人员一直是有不满的,基层的工作人员就像有些时候的我们的上层一样,更僵化,更固执,还更自以为是。在做完核算检测的第二天,明明他们知道上头的规定是居民不能出楼,还在群里通知大家菜到了可以买菜,后面又让志愿者把居民都赶回家去,场面一度混乱,让我与他们直接起了正面冲突。我说他们就不应该通知大家来买菜,他们居然在跟我谈我们也想坐在办公室里好好休息但是现在我们在这里为你们服务这种词汇,让我笑而不语。

但是人家确实是蛮辛苦的。

我们的一个包户干部,可能是总负责我们小区的,我不太确定。因为他往返办公地点和我们小区的次数最多,帮助找卖菜的小商贩,给志愿者发袖标,在检测核算现场组织布置,都是他在负责。终于有一天他向志愿者求助,谁家有电瓶车借他,他的腿要溜细了。

我们接到第二天要核酸检测通知的时间是半夜一点半,就算是新疆时间,半夜一点半也已经是不早的点钟了。但是他们还在工作,为这个事情做准备。早上七点半就来到小区里开始准备布置核酸检测现场。

因为我爷爷需要去医院看病,在和社区报备了以后,社区一直没有将出发的时间告诉我们。于是在要出发的那天早上大概九点钟,我妈妈给包户干部发了微信,但是他没有立刻回。于是妈妈过一阵发一条过一阵发一条发了几条以后,听到了包户干部发来的语音,声音朦朦胧像刚睡醒。我说这可能不知道忙到几点终于逮着机会睡一会,可能又不知道被什么事情惊醒。

昨天,包户干部突然上门,说每天要测量体温,一天三次。不知道为什么测了一次以后就没有人来了,可能是不知道什么人觉得实在是太Stupid就算了吧。

就在刚刚,我们的包户干部在小区群里求助,问谁家有帐篷,他们应该是没办法回到单位,需要直接住在小区里了。

我真的觉得他们很辛苦。

但是这并不代表我认同这种行为,有很多时候,努力不一定有效率。只是这可能成为新疆特色,强制、服从、一刀切,所有的工作人员如同特殊材料筑成。

我希望将来会有更科学的管理,而不是靠着惊人的强制力和执行力。

~~~~这是一条分割线~~~~

知乎首答,在家被关了半个月了,坐标新市区,想写点自己的体验。

7月13号,有在外地上班的小伙伴问我小道消息说天山区有病例是不是真的,我说官方也没报,我们不信谣不传谣,新疆管控这么厉害不会有什么问题的。

7月16号,突然看到了浙江报道了新疆传入的病例,而后就看到了新疆的新闻,说我们确诊的首例在7月10日就有症状了,心里一惊。但是觉得,我们这么厉害,相关的接触者应该早都控制起来了,并且也有朋友说自己被大数据查出来是因为坐了同一辆公交车被拉去隔离了。觉得我们管制很严,大数据又很厉害,这些接触者应该早都被隔离起来了吧。

7月16日晚上,听到了封小区的消息,但是我们小区并没有通知。我还特意到大门口去转了一圈,问了门卫,门卫说他们没有接到消息,但是有别的小区的消息说要封小区了。我看到了出小区采购的人拿着大包小包匆匆回来,但是我们小区内没有商店菜铺子之类的商业设施,现在出去也为时已晚。就回家,告诉我妈妈,明天应该要封小区了,我妈妈还正约着和姑姑一起去早市。

7月17日早晨,妈妈告诉我早市肯定是没了,路上一辆车也没有,一个人也没有。此时我家里还有些余粮,还能吃个两三天。一开始的管制也不是很严,小区里有个体开着小卡车出去拉了菜回来,价格昂贵,大概是有人向社区反映了,社区要求明码标价,限制价格,并且给我们找了另一个菜贩子来买菜,一个开着小车车的菜贩子。大家在小区里的锻炼活动没有受到限制。

过了两天,社区人员让大家不要随便下楼,不要在小区里活动,但是每家可以有一个人在小菜贩子来的时候出门买菜,需要戴口罩。在买菜交流的过程中,妈妈发现我们家对门一家子在16号就被救护车拉走了,是因为他们家的女儿去参加了一场婚礼。妈妈回来告诉我,大惊,感觉有一个密切接触者就离我们很近。思考了很久自己和他们家的人这两天没有过密切接触,但是心中仍然不安,寄希望于社区间开展的核酸检测。

7月24日,终于等来了核酸检测。但是流程和说好的有些区别,没有按照事先安排的分组,很多人也没有走安排好的路线(防止做完的人和没做的人交叉的路线),现场排队的间隔也不到一米五,大家凭着对彼此的信任做完了整个核酸检测。现在已经可以知道,我们家没有事,我们小区也没有事。

做核酸检测的那天我都没有意识到我们已经封闭了一个星期以上,日子都是混沌着过的,每天为了吃什么就要琢磨很久。

核酸检测做完把我们更加严格的封闭了起来,不允许每家出去买菜了,所有的菜都是在小区群里说好,然后负责的志愿者送到家门口。各大公众号还在宣传为什么要在核算检测之前把我们封闭起来,做完了核算检测依然要把我们封闭起来。大家都在这么说着,但是我的心里真的是有所怀疑的。

7月28日,为了杜绝有些人还是偷偷跑出来,我们每家每户门上都贴上了封条,现在扔垃圾都需要志愿者负责了。

8月1日,看到了病例数断崖式下跌,惊喜之外简直有些不可置信,不知道为什么就从一百多突然变成三十多了。大概是真的真的,所有人都在医学观察下了吧。

8月2日,病例数还是三十多,心中感觉情况已经在一步步好转。前两天真的是为现在的疫情感到头秃,在想自己能不能正常开学,在想还要关到什么时候。




  

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