员工只对上一级领导负责,你这个领导给你紧急任务,你当时应该指出让他通知科长是否可以让你做,毕竟你是科长管的,或者你当他的面给科长打电话,然后让他们两个说话。如果上级领导是给你直接打的电话,你直接打电话回去说明科长的意思就可以了。