目前已经找到的地球上最古老的生物化石是约 34.8 亿年前[1]到 35 亿年前[2]的细菌变成的:
最新的叠层石仍在澳大利亚西海岸继续形成:
蓝菌之类生物进行光合作用,减少水中溶解的二氧化碳,产生碳酸钙沉淀。这些沉淀被继续生长的蓝菌包裹,那上面又产生新的碳酸钙沉淀。这个过程不断进行,出现了一层层菌体与沉淀物的复合体,就是生物性叠层石。
非生物因素也可以形成叠层石。“如何有效辨识生物性与非生物叠层石”是地质学和古生物学的研究课题之一[3]。地球上有许多前寒武纪生物性叠层石,较早的可能由蓝菌产生,较晚的可能由早期真核绿藻产生。
此外,含有小型同心层结构的松节石也是细菌化石。在这些之外,细菌化石很少出现在微晶石英之外的岩石中,但也有一些页岩夹带细菌化石。
目前已经找到的地球上最古老的疑似生物活动痕迹看起来也是细菌留下的:
此外,格陵兰西岸的一些古老石头包含有 37 亿到 38 亿年历史的石墨,可能是那时的有机物变成的[5]。它们也有生物成因的证据[6],可能是曾生长在沿海浅水区域的细菌生物膜。
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