关于以色列目前流行的毒株B.1.617.2+S:T791I (AY.12)，目前已知的信息有哪些？
1. 毒株的背景与分类：
首先，我们要明确B.1.617.2是Delta变异株的一个分支。Delta变异株本身就因为其传播速度快、致病性强等特点引起了全球的广泛关注。而AY.12，则是对B.1.617.2进一步细分的谱系名称，它代表了在Delta毒株基础上，发生了一些特定突变组合的子系。
其中，S:T791I这个标记指的是在刺突蛋白（Spike protein）的第791位氨基酸从苏氨酸（T）突变成了异亮氨酸（I）。刺突蛋白是新冠病毒入侵人体细胞的关键，它上面发生的突变往往会影响病毒的传播能力、免疫逃逸能力以及疫苗的有效性。
2. 以色列的流行情况：
要了解以色列目前流行的具体情况，我们需要参考以色列卫生部发布的数据和相关研究机构的报告。通常情况下，这些信息会包括：
占比和趋势： AY.12（或包含此突变的Delta亚型）在以色列近期新增病例中所占的比例，以及这个比例是上升还是下降的趋势。这有助于判断其在当地的“竞争力”。
传播特征： 是否有证据表明AY.12在以色列的传播速度比其他同期流行的变异株更快？这可能与它的刺突蛋白突变有关。
病例特点： 感染AY.12的病例在症状、重症率、死亡率等方面是否与其他变异株感染者有显著差异？例如，是否更容易出现特定的症状，或者是否更容易导致重症？
3. AY.12的已知突变及其潜在影响：
AY.12这个谱系名称本身就意味着它与B.1.617.2在一些关键突变上有所不同。除了前面提到的S:T791I，AY.12可能还包含其他一些突变。具体有哪些突变，需要查阅权威的病毒基因组数据库（如GISAID）以及相关的科学文献。
这些突变的影响是大家最关心的问题，主要可能体现在：
免疫逃逸： 某些突变可能会改变刺突蛋白的形状，使得身体产生的抗体（无论是通过感染还是疫苗接种获得的）识别和结合病毒的能力下降，从而增加再次感染或疫苗突破感染的风险。S:T791I这个突变也被一些研究认为是可能影响免疫逃逸的突变之一。
传播能力： 突变也可能提高病毒与细胞受体（ACE2）结合的亲和力，或者改变病毒复制的效率，从而增强其在人群中的传播速度。
致病性： 虽然目前更多的关注点在传播和免疫逃逸，但也不能完全排除突变对病毒致病性的潜在影响。不过，这方面的证据通常需要更多的临床观察和研究来确认。
4. 疫苗和治疗的有效性：
鉴于AY.12包含特定的突变，大家最关心的是现有疫苗和治疗药物对其的有效性。
疫苗有效性： 以色列是以色列疫苗接种率较高的国家之一。针对AY.12，需要关注的是以色列卫生部或相关研究机构是否有关于现有疫苗（如辉瑞、莫德纳等）对这种毒株的保护力数据。这通常是通过分析接种者和未接种者感染率的差异，或者在实验室环境中测试疫苗诱导的抗体对病毒的中和能力来评估。通常来说，当新的变异株流行时，疫苗的“突破性感染”率可能会有所上升，但对于预防重症和死亡，疫苗仍然被认为是有效的。
治疗药物： 对于现有的抗病毒药物（如Paxlovid等），其对AY.12的疗效也需要关注。同样，实验室测试和临床观察数据是评估这一点的关键。
5. 以色列应对措施和建议：
基于对AY.12流行情况和潜在风险的评估，以色列卫生部门可能会采取或建议采取一些应对措施，例如：
加强监测： 对病毒基因组进行持续监测，及时发现新的变异株或现有变异株的进一步演变。
调整疫苗策略： 如果现有疫苗效果明显下降，可能会考虑推出针对新变异株的更新疫苗，或者调整加强针的接种计划。
公共卫生措施： 根据疫情发展，可能会重申或加强佩戴口罩、保持社交距离、通风等公共卫生建议。
在哪里可以找到更详细的信息？
如果你想获得最准确、最及时的信息，建议直接查阅以下来源：
以色列卫生部（Ministry of Health, Israel）官方网站： 这是最权威的来源，他们会发布官方的疫情数据和政策声明。
权威科学期刊和预印本网站： 例如PubMed、Nature、Science、medRxiv、bioRxiv等，可以找到相关研究的最新进展。
国际卫生组织： 如世界卫生组织（WHO）也会定期发布全球变异株的流行情况和评估报告。
信誉良好的新闻媒体的科学报道： 许多媒体会引用专家观点和官方数据来报道相关情况，但要注意甄别信息来源。
总而言之，关于以色列流行的B.1.617.2+S:T791I (AY.12)毒株，其核心在于它属于Delta变异株的一个亚型，并携带了可能影响病毒特性的特定突变。了解其在以色列的流行程度、传播特点、对疫苗和治疗药物的影响，是应对疫情的关键。
网友意见
说说情况。
一个半月，从0干到40%+。这是标准的新老交替。老毒株在新毒株的压倒性优势下，如果没有人为干预，下不存在反抗能力。在来一个半月，说不定能占比80%
哦对了，以色列是人口五百万以上的国家中接种率非常高的。人工的选择压非常大。新毒株要搞掉老的，要么体内复制速度进一步加快，凡在免疫系统反应过来前就先让人具有传染能力；要么，进一步搞砸抗体的有效率。
我希望是后者，因为目前对所有变种的统计来看，加速复制速度会导致重症率和致死性进一步上升。
另外，那里是中东，考不考虑和本土一直在低水平流行的mers结个亲？mers不强，才30%的致死率而已。
周末到了，老夫来例行贩卖个稍微大号的焦虑吧。
一、
没人知道AY.12相对于原版delta有什么特殊变化，也没人知道刺突蛋白T791I有什么特异功能，现在还太早了。
但这不是问题重点。
问题重点其实是——
为什么AY.12出现在以色列？并且（几乎）是以色列独有的变异株？
二、
AY.12的特征突变（lineage-defining mutation）不止刺突蛋白T791I，还包括了ORF1a:K261N和ORF3a:P42S，同时还有时隐时现的ORF7a:P45L，以及其他几个同义突变。
如果用ORF1a:K261N加ORF3a:P42S来定义的话，AY.12的地域特点更明显。
——请品鉴：
如上图，截止8月12日，全世界一共测序了824例AY.12，其中820例都在以色列。
——剩下4例里面，日本那一例还是以色列输出的：
同理，如果用ORF1a:K261N加ORF3a:P42S来定义的话，AY.12一共占了以色列delta的65%。
————下面正式进入贩卖焦虑环节————
所以细思极恐的问题就来了。
通常我们认为，以色列这种地方很难养出什么变异毒株。
原因无他，就在于以色列人口太少了，盘子实在不够大。
但AY.12的出现却无情地打了我们的脸。
以色列不仅养出了变异毒株，而且还尼玛是独家限定款的变异毒株。
三、
更不可思议的是，delta 4月8日才输入以色列。AY.12居然在6月份就出现并且定型了。
然后，6月份和7月份的大部分时间，以色列新增确诊基本维持在平均每百万人每天10例以下，甚至经常每天5例以下，其中还包括了输入病例。：
并且这段时间以色列检测阳性率不超过0.1%（也就是说，基本不存在大范围漏检）：
这就实在太反直觉了。
撮尔小国，每天一丢丢新增，社区传播链几乎断掉，又没啥漏检，凭啥能产生变异毒株？？？
delta截止目前一共13个子毒株，除了以色列的AY.12以外，其他哪个不是靠着大规模持续社区爆发慢慢养出来的？？？
凭啥以色列就能不劳而获？？？
如果每百万人每天新增十例就足以产生变异株的话，那凭啥新加坡、土澳，甚至扬州就没有？？？
————高浓度焦虑警告————
四、
下面继续加一点独家猛料。
这次可是真·原创啊，全网别无分店，内网外网都没有。
各位你们看，老夫为了周末能贩卖一个大号焦虑，真的是豁出去了……
总之，各位想必知道，在delta之前，以色列的流行毒株是alpha。
但各位可能不知道，以色列的alpha，也TM变异得亲妈都不认识了。
不过一般人可能发现不了，因为刺突蛋白上几乎看不出痕迹。
当然也不是完全没有痕迹…比如多了个F490S出来。
F490S这货虽然是个根正苗红的高风险突变（lambda同款），但这货同时也是alpha挺常见的非特征突变。比如在肯尼亚和德国都有不少测序记录。
正因为如此，可能专业人士拿uSHeRTree工具也很难发现端倪，因为如果不手动揪出关键突变的话，以色列/肯尼亚/德国的测序记录会被自动划分到一起……
（注：uSHeRTree是UCSC搞的一个新冠病毒演化树自动生成工具）
要不是老夫手贱乱点着玩儿，估计很难发现，
以色列的这个神秘变异alpha，它的突变点位几乎全尼玛在核衣壳蛋白（N蛋白）上……
——请品鉴：
alpha自带四个，再一口气突变出来四个，整个一只N蛋白八突变的大怪兽……我的妈呀。
（注：核衣壳蛋白是冠状病毒中含量和 保守性最高的蛋白 ，是病毒粒子的核心成分。N蛋白不仅能识别病毒RNA并将其包装成核糖核蛋白（RNP）复合体，还能通过与病毒或宿主蛋白结合，参与病毒转录、复制、免疫调节等多个进程。）
核衣壳蛋白是病毒中保守性最高的蛋白。
核衣壳蛋白是病毒中保守性最高的蛋白。
核衣壳蛋白是病毒中保守性最高的蛋白。
（重说三）
所以说好的保守性最高呢？格劳资一口气冒出来8个突变是想要干嘛？
五、
和AY.12的情况差不多，以色列这个变异得亲妈都不认识的alpha，最早出现的时间是6月28日；
7月份以后，变异株占了alpha总数的六成以上；
并且又是以色列的独家限定款，别无分店：
然后大家请回忆一下6月份以色列的岁月静好，至少是水面上的岁月静好。
谁想得到水面下竟是如此紧锣密鼓的病毒变异大赛？
在这种意义上，以色列人民也许应该感谢delta及时出现，把alpha给挤没了吧……
六、
那么六月份以色列究竟发生了什么，
导致alpha和delta先后疯狂变异？
老夫也不知道。
但老夫斗胆盲猜，说不定是这个——
6月1日，由于全民接种行动取得成功，疫情几乎消失，以色列解除了大部分管控措施。
七、
祝大家周末愉快！
————2021年8月14日第一次更新————
原回答提到的两个以色列的例子，看起来似乎都太不真实，
所以评论区有些朋友以及其他答主提供了一些假说，试图解释这种现象。
——比如以色列人与巴勒斯坦人之间可能存在不受控的交叉感染。
这点我完全同意，肯定不能排除巴以交叉传播的可能性，
但这个假说似乎没法解释所有细节。
比如AY.12和神秘alpha变异株两者的源头都明确指向了输入病例（所以至少源头上跟巴勒斯坦关系不大）；
再比如神秘alpha变异株的传播有聚集性，而主要涉及的地区刚好没挨着边境。
所以个人觉得，就算巴勒斯坦人对这两种变异株的演化过程做出来贡献，他们可能也算不上最主要因素。
话说昨晚睡不着刷paper，偶然刷到一篇讲澳洲RSV病毒的预印本，刚好跟以色列这情况挺相像，然后两边对比着一琢磨，顿时开窍了。
其实以色列的情况可能很简单，高中生物课就学过，
只不过被各种干扰信息晃花了眼，以至于一时没反应过来——这不就是典型的瓶颈效应/奠基者效应咩……
先简单说说土澳那篇略微跑题的预印本吧[1]。大致讲的是——
去年土澳执行了很长时间的封城政策，以至于新冠清零的同时，其他一堆呼吸道传染病也被搞得几乎绝迹。
但随着土澳解封，新州和西澳都发生了罕见的RSV（呼吸道合胞病毒）反季大爆发。
（注：RSV是一种类似感冒的上呼吸道病毒感染，具有季节性，多发于儿童）
作者们进一步发现，这次爆发的病原体是两种以前从未见过的变异株：
并且由于土澳一直保持了严格的封国策略和入境隔离政策，所以几乎可以排除输入病例的可能性。
那么唯一的解释就是，存在一小撮隐秘传播的RSV病毒，在解除封城的短时间内就突变得亲妈都不认识，然后席卷了大半个土澳。
是不是跟以色列的遭遇很像？
——都是病毒几乎被清零（只不过土澳靠的封城，以色列靠的疫苗+NPI）；
——然后都是放松管控；
——再然后，土澳的RSV是小范围隐秘传播变成社区传播，以色列的新冠则是输入病例引发社区传播。
——最后结局都是亲妈不认的变异。
——这不就是典型的瓶颈效应：
顺便补充一个新鲜出炉的例子吧[2]。
各位想必听说了，美国麻省旅游胜地Cape Cod，
7月3日之前已经连续零新增14天,
7月4日当地搞起了一年一度为期两周的基佬大会，
两周之后，当地累计中招469例（其中74%已完全接种）。
……
这事儿闹得沸沸扬扬的，知乎上也有过讨论：
以上算是各位知道的部分。
各位可能不知道的是：
这次聚会直接搞出了一种新的delta子毒株。
这次聚会直接搞出了一种新的delta子毒株。
这次聚会直接搞出了一种新的delta子毒株。
——请品鉴：
如上图，横轴是测序时间，纵轴是测序结果的演化树分支。
7月份麻省基佬大会搞出来的新毒株可以粗略地理解为delta的基础上额外发生了刺突蛋白G142D和S112R两个突变。
上图每个小圆点代表一个符合新毒株定义的测序记录，圆点的颜色代表不同的州（其中深蓝色代表麻省）。
怎么样各位，咱们好像不小心发现了一个快速高效制造变异毒株的捷径呢……
只要把感染者放进已经清零且接种率较高的地方自生自灭，一个月之后就可以打开盲盒，就可以稳定收获变异株耶~
惊不惊喜意不意外？
所以啊，结论就很明显了——
一旦清了零，后面又不小心拉胯的话呢，就等着品尝惊吓盲盒的滋味吧。
参考
我有几个问题啊。。。
以色列的接种率是按犹太民族算还是按实控地区居民算的啊？
以色列的确诊人数算不算不承认以色列但和犹太人混居的那（些）个民族？
以色列这一系列的操作是不是政治安排多过防疫需要？
巴以这种。。。
只有一边清零了有个蛋用？典型的交叉传播啊。
STD只汇报一边的情况，医生不给白眼看？
您以色列是日增低于10了，那您的另一半呢？
而且吧，您以色列疫情曲线和巴勒斯坦一毛一样，你就不想想是不是出了问题？以前的峰每次都您以色列先于巴勒斯坦，您以色列不觉得和巴勒斯坦的关系实际非常亲密吗？
您以色列就算清零了又咋样呢？您得和您的partner一起清零才行，懂？
是是，您俩对外表现确实是闹得非常不愉快我们都看到了，但是为啥您俩呼吸道微生物群落特征几乎一致呢？
哦，您俩加起来只有一张床啊？您病好了就不戴了啊？那难怪哦。
巴以地区疫情只有一个解决方案。具体做法得参考中国和周边国家的合作，地球上似乎没有其他地区可以参考了。
焦虑吗？焦虑。
但不是说几千万人口的国家日增不过十，病毒却依旧会变异传播的这种焦虑，情景不太合理。而是周边地区控制得不好，我们的防疫压力就会超级大的那种焦虑，而我们的周边国家实在是又多又复杂，必须谨慎对待呐。
PS1：以色列不是正常国家。
PS2：死亡率拉起来了，这个毒株有点东西的，小心小心再小心。
PS3：小心美利坚！成事不足败事有余！
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