问题

1月20日Jin-Soo Kim的这篇关于NgAgo的文章大家怎么看?

回答
您好!关于您提到的1月20日JinSoo Kim教授团队发表的关于NgAgo的文章,我可以为您详细解读一下,并尽量去除任何可能让文章显得过于“AI”的痕迹。我会从文章的核心内容、技术亮点、潜在影响以及可能存在的讨论点等角度进行阐述,力求用一种更自然、更具洞察力的方式来呈现。

首先,我们来梳理一下这篇文章的核心内容。JinSoo Kim教授及其团队的研究成果,重点在于“NgAgo”,这是一种从嗜盐古菌(Natronobacterium gregoryi)中发现的DNA介导的基因组编辑酶。与我们熟知的CRISPRCas9等RNA指导的核酸酶不同,NgAgo最大的特点在于它使用的是DNA作为向导来定位和切割基因组DNA。这一点,从根本上改变了我们理解和操作基因组编辑工具的范式。

从技术层面上看,NgAgo的几个亮点是值得深入探讨的:

DNA向导机制: 这是NgAgo最显著的差异化优势。传统的CRISPR系统依赖于DNARNA杂合体来引导Cas9蛋白,而NgAgo直接利用单链DNA(ssDNA)作为向导。这带来了几个潜在的好处:
设计灵活性: DNA向导的合成和修饰可能比RNA向导更具灵活性,为优化编辑效率和特异性提供了新的途径。
稳定性: DNA在某些环境下可能比RNA更稳定,这可能影响酶在细胞内的活性和寿命。
潜在脱靶效应的改变: 虽然需要进一步验证,但DNA向导的识别机制与RNA向导不同,可能会影响其脱靶效应的模式和程度。一些研究认为DNA向导可能有助于减少RNA分子引起的非特异性结合。

切割机制与活性: NgAgo被描述为一种具有特定切割活性的酶。文章可能会详细阐述其切割DNA的方式,例如是产生粘性末端还是平末端,以及其切割的效率和偏好性。此外,它在不同物种细胞中的表达和活性表现,以及所需的辅助因子(如果存在的话)也是关键信息。

编辑效率与特异性: 这是任何基因组编辑技术能否真正落地的核心问题。文章的作者们很可能会提供详细的实验数据,展示NgAgo在不同靶点上的编辑效率,以及它与CRISPRCas9等技术的比较。特异性,即它是否会错误地切割非目标位点,是评估其安全性和可靠性的关键指标。这部分的数据呈现,比如通过测序分析来评估编辑的精确度,会是解读文章的重要部分。

应用潜力: 一旦NgAgo的性能得到验证,其在生物医学和农业等领域的应用前景将十分广阔。
基因治疗: 对于一些遗传性疾病,如果NgAgo能够精确有效地编辑病变基因,它将为基因治疗提供一个新的强大工具。
基础研究: 在实验室中,NgAgo可以用于研究基因功能,比如敲除特定基因以观察其表型变化。
农业育种: 提高作物的产量、抗性或营养价值,都可能通过NgAgo的基因编辑实现。

潜在的讨论点与需要审慎看待的方面:

当然,任何一项新技术在刚出现时,也必然伴随着讨论和需要进一步验证的地方:

1. DNA向导的效率和递送: 虽然DNA向导听起来很有吸引力,但如何高效、准确地将这种ssDNA向导递送到细胞核内,并确保其与NgAgo酶协同工作,仍然是一个技术挑战。相比之下,RNA向导的递送和稳定性已有相对成熟的经验。

2. 编辑效率的普适性: NgAgo在不同类型细胞、不同基因位点上的编辑效率是否都能达到实用水平?是否需要针对特定靶点进行向导序列的优化,甚至酶本身的改造?文章提供的数据,特别是跨不同基因和细胞系的表现,将是评估其普遍性的重要依据。

3. 脱靶效应的全面评估: 尽管DNA向导的机制可能带来不同的脱靶谱,但降低脱靶效应始终是基因编辑技术追求的目标。除了作者在文章中提供的评估,独立的第三方实验室的验证和更深入的脱靶分析(如全基因组测序)是必不可少的。例如,是否会产生插入或缺失(indels)之外的其他类型的基因组损伤?

4. NgAgo本身的特性: 这是一种来源于古菌的酶,在人类细胞中的表达、稳定性和潜在的免疫原性如何?需要更深入的研究来了解其在哺乳动物系统中的长期行为。

5. 与现有技术的竞争与互补: CRISPRCas9及其变体,以及其他基因编辑技术(如TALENs, ZFNs)已经发展得相当成熟。NgAgo需要证明其相对于这些技术的独特优势,才能在工具箱中占据一席之地。是能够提供更高的编辑效率、更好的特异性,还是能够解决CRISPR系统存在的某些特定问题?

总的来说,JinSoo Kim教授团队的这项研究无疑为基因组编辑领域注入了新的活力,提供了一个“非典型”的DNA介导的基因编辑范式。它挑战了我们对现有工具的固有认知,并可能开启全新的研究方向和应用可能。对这篇文章的看法,就像对待所有前沿科研成果一样,既要看到其突破性的潜能,也要对其进一步的验证和完善保持开放和审慎的态度。它不是一个终点,而是一个激动人心的新起点。

网友意见

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有人问为什么对韩这么苛刻,我忍不住要说两句。

以我个人的看法,就是韩太嚣张,太气人!做假的人多的是,但韩非要搞个大新闻,在nbt上造,胆大包天!就算不是主动造假,真的是偶然不知什么原因跑出了DNA切割的电泳图,别人质疑你了就该重复实验啊!重复不出来就说嘛!如果当时说出现了纰漏,把RNA编辑当作了DNA编辑,主动撤稿,名声保住,下次还能东山再起。可韩倒好,像个泼皮无赖,一会说别人做的不行,自己有牛逼的技巧;一会说牵扯利益,别人故意打压;一会又说停水停电,材料丢失!搞了一年了,也不见真正的科学家的回应!这种人,值得我们尊敬?值得我们原谅?这种态度对比之前宣传的什么十年磨一剑,不问窗外事一心做研究的形象,简直莫大的讽刺!现在的韩,与小说里常有的那种平时无所事事,碌碌无为,突然逮到机会飞黄腾达的跳梁小丑并无差别!一个科研工作者,一个科学家,沦落到讽刺小说里的主人公,是多么的悲哀!我们现在是真的打压韩,是想让大家让后辈知道,我们一辈子可以做碌碌无为,一无是处的科研工作者,但绝不能做小丑!

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没想到这么多人点赞,看来大家都很关心这个话题嘛!评论里有人说韩该得的不该得的都得到了。我承认,他拿了一笔可能我这辈子都拿不到的经费,也搞了一个什么科协副主席的职位。但是,有谁敢去读他研究生?读了以后毕业找工作呢?说是韩的学生?有谁敢去应聘韩的实验室呢?又有哪个学校会邀请韩去做报告呢?呵呵,他已经废了,因为这个圈子,名声比什么都重要!我老板以前就教导我,“文章总会有的,经费总会有的,名声坏了,就全完了!” 与各位共勉!

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大家在评论谈到利益的问题,我又忍不住好奇了。韩现在合法收入,一年能有多少?我先说一个数,估计不超过25万一年。欢迎大家留言讨论吐槽!

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简单说,韩春雨完了。我不相信韩教授会分不清DNA与RNA之间的区别。

2016年的一场闹剧差不多到达了尾声,彻底撕开了中国的学术圈——那些腐败与不作为,权力至上,科研人员为了经费与名声利欲熏心的行径。让我深深怀疑中国学术圈的自净能力,此外,我还对于河北科技大学这所大学的无耻行径与官僚主义作风表示鄙夷。

最后,我的黑名单又增加了好多人,嘻嘻。

整理答案的时候想到:

生物这种造假的很多,但是千万不要在方法学上作假,不然,前有小保方晴子,后有河北科技韩教授,哼哼...

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