问题

构成一个分子的原子间夹角怎么测量?

回答
理解一个分子的三维结构,尤其是原子之间的夹角,对于我们揭示分子的性质至关重要。就好比我们观察一个三维物体,需要从不同角度审视才能把握其全貌,测量原子间的夹角也需要借助一些精密的手段和巧妙的计算。

最直接也是最根本的方法,是利用X射线衍射。当一束X射线照射到周期性排列的原子晶体上时,X射线会与晶体中的电子发生相互作用,并发生衍射。这个衍射出来的图案不是杂乱无章的,而是充满了规律性的信息,这些信息就如同晶体在X射线面前“留下的指纹”。通过分析这些衍射图案的强度和位置,科学家们就能够推断出晶体中原子的三维坐标。一旦知道了构成特定分子的所有原子的空间位置,那么计算原子间的夹角就成了一个纯粹的几何问题了。

你可以想象一下,如果我们知道了构成三角形的三个顶点的坐标,我们就可以很轻易地用余弦定理或者向量的点积运算来算出任何一个顶点处的内角。在分子世界里,虽然原子不是严格地排列成平面三角形,但原理是相通的。科学家们会选择组成特定夹角的三个原子,比如ABC,其中B是中心原子,A和C是与B相连的原子。他们会计算出向量BA(从B指向A)和向量BC(从B指向C)的方向。然后,利用向量的点积公式,计算出这两个向量之间的夹角。这个夹角,就是我们所说的原子间夹角,它通常被称为键角。

除了X射线衍射,电子衍射和中子衍射也是类似的手段,它们也利用了波粒二象性,通过粒子(电子或中子)与物质相互作用后的散射或衍射图案来推断原子结构。

在某些情况下,当分子无法形成稳定的晶体,或者我们想要研究气相分子时,光谱学技术就派上用场了。特别是红外光谱和拉曼光谱。这些技术能够探测分子对特定频率电磁波的吸收或散射。分子的振动模式,也就是原子如何在分子内部运动,是与原子间的键长和键角紧密相关的。当分子发生振动时,它的偶极矩(红外光谱)或极化率(拉曼光谱)会发生变化,从而吸收或散射特定频率的光。通过分析这些光谱的峰值以及它们随同位素标记的变化,科学家们能够间接推断出分子的振动频率,进而反推出原子间的键长和键角。这就像是通过听一段音乐的音调和节奏,来推测乐器的结构和演奏者的指法一样,是一种更加间接但同样强大的方法。

还有一种非常重要的技术,尤其适用于研究气相分子,那就是微波光谱。微波光谱主要探测的是分子的转动。当分子在微波区域吸收电磁波时,它会从一个转动能级跃迁到另一个转动能级。分子的转动惯量,也就是它转动起来的“难易程度”,直接取决于原子的质量分布,而质量分布又与原子间的键长和键角密切相关。通过精确测量微波光谱中的转动谱线,科学家们可以非常精确地计算出分子的转动惯量,进而推导出原子间的键长和键角。这种方法的精度可以达到非常高的水平,常常能给出极其精确的键角数据。

有时候,为了更直观地了解分子的三维结构,研究人员也会使用核磁共振谱(NMR)。虽然NMR主要提供的是原子核周围电子环境的信息,但通过分析不同原子核之间的耦合作用(J偶合),也可以间接推断出原子之间的连接方式和距离,甚至在某些情况下,也能提供关于键角的信息。

总而言之,测量分子中原子间的夹角,是一个多学科交叉的领域,需要结合物理学、化学和数学的知识。无论是直接的衍射技术,还是通过分析分子的振动和转动信号,最终的目的都是为了“看到”原子在空间中的真实排布,从而理解分子的行为和特性。这就像是侦探通过蛛丝马迹来还原事件真相一样,科学家们通过各种实验手段,层层剥茧,最终描绘出分子的精确三维图像。

网友意见

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这是我的本行,我要来答一个。

太长不看版:每个分子都会转动。物体转动,就会有一个叫做「转动惯量」的物理量(可以类比直线运动中的「质量」)。 理论上,转动惯量和分子中各个原子的质量和位置有关;实验中,转动惯量可以由我的本行转动光谱学精确测出(此处省略一万字怎么测……这得讲一本书那么多)。测出转动惯量[1],反推原子的位置,再根据原子的位置坐标,求出夹角。

对于能测转动谱的小分子,这种方法是比较准的。对于测不动的大分子,有 @Triborg 老师提到的一些计算方法。


下面简单写一些公式。

对一个 N 原子分子,记它的每个原子的质量分别为 ,原子坐标(直角坐标系)为 , .

这个分子的质心坐标为:

我们要先把坐标系原点换到质心,即

然后,这个分子相对于质心坐标的转动惯量 可以写成一个二阶张量形式:

每个分量是什么呢?主对角元

非对角元

把矩阵 对角化,得到一个对角矩阵

其中 就是转动的三个主轴,而 就是实验中可以测量到的转动惯量数值。


好啦,下面就是解方程时间了。可以看到,N 原子分子的坐标有 3N 个,实验中只能测到 3 个转动惯量。存在夹角的分子, ,至少也有 9 个坐标了。怎么办呢?有两个重要的手段。

第一,根据分子对称性,减少自由坐标的数量。例如水分子( ),3 个原子肯定共面(减 3 自由度),而且两个H-O 键键长应该是一样的(再减 4 自由度),于是只剩下 2 个自由度了。再比如,甲烷( )根据分子对称性,就根本不用实验测量。四面体内部的键角,肯定是 109°28′(高中几何题目)。

第二,实验中,我们会去做同位素取代。一个核心的假设是:同位素取代只改变原子的质量,却不改变原子的坐标(保持分子结构不变)。这样一来,比 3 多出一个自由度,就多做 1 个同位素取代,多得到一组方程。最终的原子坐标通过联立方程求解。


小学二年级例题:计算水分子( )的键角。已知水分子的三个转动惯量分别为:0.604414, 1.160427, 1.81634,单位为 amu * 埃。根据对称性,我们设水分子的坐标分别为

,已经是对角阵了

解得

所以水分子键长为

键角为

文献值(NIST)[2]

已经蛮接近了。误差主要来自实验值的 ,但我们理论上根据对称性,应该是 。造成这个的原因相对复杂,振动和离心的各种修正啦,就不展开讲了。

参考

  1. ^ http://mechanicsmap.psu.edu/websites/A2_moment_intergrals/area_moment_of_interia/areamomentofinteria.html
  2. ^ https://cccbdb.nist.gov/expgeom2.asp?casno=7732185&charge=0

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