法国的发现最大意义在于对病毒溯源给出了新的证据,因为这不是白肺病什么鬼之类的,这是真的核酸证据。
我们迫切希望改写这个进化树的画法,也就是把根部序列改掉,不要再用当前武汉发表的序列作为根序列
然而,到目前为止,没有成功,因为我们真的没找到比武汉更早的扩散全球的病毒。不过法国这次的研究可以让靠近根部的地方发生一些变动,如果再有其他地方继续检测,再发现,那么说不定真的可以改变根部序列了,也就是把基因溯源的问题彻底解决掉。
毕竟,阴谋论始终是阴谋论,而科学却可以长久。
其实昨天天就写了这个内容
但是发出来后,评论区也是乌烟瘴气的,尤其是阴谋论,真的让我感觉到浓浓的不适,尽管我本人的评论区是被强制开启了审核无法关闭,但是我自己还是要忍着不适看一遍评论然后把所有评论放出来。
因此,借着这个回答,也做个统一评论:
我只相信核酸证据,至于其他什么可能病,拿出核酸证据来说,否则一律当做无效证据,这种逻辑戏份很无聊。
看了很多评论,都在说一种想法就是,法国发现早期病毒,会让人们去认为武汉更早,所以武汉隐瞒之类的。我只能说,这种想法,和之前的阴谋论调一致,完全陷入了逻辑问题。这也是我非常不喜欢回答什么xx市长认为自己去年得新冠之类的内容,或者什么白肺病,还是之前的什么更早的肺炎之类的, 凡是广泛宣传这类新闻的人,大概率是陷入了逻辑怪圈,因为,你无法证实这是新冠导致的。
于是结果就陷入了“你无法证明有”和“你无法证明无”的逻辑口水战中,所以,我一直坚持一点就是,核酸为王。一定要证实这就是新冠引发的,否则,那种无意义的阴谋论纯粹浪费时间。。
引发肺炎的因素很多:
肺炎就是发生在终末气道、肺泡和肺间质的炎症的意思,是一种呼吸科的疾病,临床上可能会表以发热、咳嗽、气促、呼吸困难以及肺部固定湿啰音为主要表现,胸部影像学表现为急性浸润影。
从这个定义上,大家可以看出,肺炎,其实是一种病理现象的描述。事实上,我国的肺炎一直保持着很高的发病率,约占人群中的12%,可以说是一个大的疾病类型,也是常见的临床并发症。
那么,导致肺炎这种疾病现象的因素有哪些呢?
答案很多
所以,单纯说肺炎,根本无法论证是新冠。
更别提,有20%的人根本就不会得肺炎,这也是为什么到who把疾病命名为covid-19,而不是我国提出的ncp,因为前者是新冠病毒疾病,后者范围直接缩小到了肺炎上去了。
所以肺炎和新冠,是一个既不充分也不必要的内容,肺炎不一定是新冠引发的,新冠不一定导致肺炎。
抗体倒是比起ct看到肺炎更进一步了,但是抗体麻烦的是,它没法确定时间。就比如那个市长,他自述11月得过病,然而他没法证明那一次是新冠,至于体内4月检测到抗体,完全有可能是后来的无症状感染之类的呗,所以又一次陷入了“无法证明有”和“无法证明无”的逻辑口水战中。
这也是为什么,我一直反复关注核酸问题,因为核酸才是真正的标准。
法国这一例的意义是因为很幸运的冻存了样本,然后又进行了核酸检测,于是就发现了这真的是新冠。
而结合前两天法国巴斯德研究所发表的新冠基因组研究
他们也指出,法国流行的病毒并非武汉输入的,而是法国本土独立的一支病毒,如下图,武汉的病毒是哪个※,法国的流行病株是彩色的。
那么,这对于新冠的溯源,无疑是提供了新的证据。
所以,现在非常期待这一例的全基因组情况,看看到底和武汉提交的病毒序列是什么关系。
文章其实非常短,全篇结论用图2 Figure2就可以覆盖,略显单薄。
研究人员分析了采集于1月24日至3月24日之间的97个来自法国的样本以及3个来自阿尔及利亚的样本,同时参考了GISAID上的338个基因组样本,来说明病毒在法国的早期输入和传播。
三个来自湖北的输入病例,IDF0372,IDF0373,IDF0515。前两个基因组具有V367F (G22661T)突变,因此归为V类;第三个没有V,G,S三类任一的标志突变,因此归于其他类,但是它又携带了V1类的G11083T 突变,因此猜测可能是其G251V(G26144T)位点发生了回复突变,所以三者都算是早期的V类。三个意大利输入病例,B2234,B2340,GE1583。前两个属于V类,第三个属于S类。
而所有法国北部的样本都属于标志为 D614G(A23403G)的G类,并且G类的亚类在北部地区比较分散,而且呈现区域聚集,符合输入后社区传播的特点。在G3b亚类中有阿尔及利亚的三例样本,则像是法国输出的情况。因此推论法国北部的病例来自于G类毒株的一次或者多次输入,而非来自于上述的六个V类和S类的早期病例。
另外对于G类最早的病例HF1463, 因为没有旅行史和密接史,所以推论是由无症状感染者在二月传播。这样的话,最早的G类流行病例就应该是传给HF1463的无症状感染者,输入时间于是就变得完全不可知了。
文章还提到基于一到两个碱基替换来构建进化树的可靠性问题。HF1463是诊断时间上最早的病例,但是有些诊断时间晚于它的病例却比它更接近G类根节点,用无症状感染者传播的理论可以在一方面解释这种进化关系,但是另一种不能排除的可能性是 回复突变以及趋同突变的存在可能导致有限样本量的基于少数碱基替换的进化树不可靠。
总体而言,讲述的其实是一个寻找传播源头但是得到阴性结果的故事。
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很多人把它解读为“法国发现病毒独立起源”,但是实际上真正能有效支持的结论是“法国不太可能是全球疫情的发源地”(废话)。
但是对于文中的重要论点 “已知的早期输入病例似乎不是导致本地流行的原因”,或者更确切地翻译为“当前样本量下,来自中国和意大利的输入病例没有导致法国本土的新冠疫情”,是可以做出合理拓展的。拓展为“法国/阿尔及利亚是发源地”或者“法国证实起源并非中国”需要的假设依然比较多,不太符合奥卡姆剃刀原则。但是这么解读是恰当的:“不论病毒发源地在地球上的何处,其初期的传播都在当地卫生系统的检测警报限以下,疫情的全球流行不可避免”。哪怕在12月26日,全球第一份关于该病毒的mNGS检测报告得出SARS阳性结论的当天采取措施,也已经晚了可能有一个月。
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