除线粒体叶绿体外还有哪些细胞器中有DNA?
除了线粒体和叶绿体之外，在普遍意义上，地球上几乎所有的真核细胞都只在这两个细胞器中发现有DNA。 这也是我们通常所说的“细胞器DNA”的范畴。
但是，如果我们把“细胞器”这个词的定义稍微放宽，或者考虑到一些非典型的细胞结构和特殊情况，我们可以从更广泛的角度来思考这个问题，尽管这些情况并不像线粒体和叶绿体那样普遍且核心。
以下是一些可以探讨的、与细胞器DNA相关但又不完全是传统线粒体/叶绿体DNA的情况，我会尽量详细地讲解：
1. 细胞核 (Nucleus):
详细说明: 虽然细胞核本身是细胞的“司令部”，包含着绝大部分的基因组DNA（也就是我们常说的染色体DNA），但从广义的“储存遗传信息的结构”来看，细胞核无疑是最大的DNA“库”。然而，当我们讨论“细胞器DNA”时，通常是指存在于膜包裹的、位于细胞质中的、独立于细胞核的DNA。所以，虽然细胞核拥有DNA，但它通常不被列为与线粒体和叶绿体同类别的“细胞器DNA”，因为它构成了细胞的主要遗传物质，并且位于细胞的主要遗传控制中心。
重要性: 细胞核DNA包含了几乎所有编码蛋白质和非编码RNA的基因，决定了细胞的性状和功能。
2. 病毒的基因组（在某些感染状态下）：
详细说明: 病毒不是细胞，它们是寄生性的遗传单位。但是，当病毒感染真核细胞时，它们的基因组DNA（有些病毒是RNA病毒，但有些是DNA病毒）会进入宿主细胞。
整合到宿主DNA中: 许多DNA病毒（如疱疹病毒、腺病毒、人类乳头瘤病毒HPV、逆转录病毒如HIV）的DNA会整合到宿主细胞的染色体DNA中。在这种情况下，病毒DNA就“寄生”在了细胞核的DNA之中，并随着细胞的分裂而复制。从这个角度看，病毒DNA就成为了细胞核内的一部分，但它不是细胞核自身的遗传物质。
游离在细胞质中: 有些病毒DNA在感染初期或特定阶段，可能以游离状态存在于细胞质中，甚至在某些病毒复制周期中，它们会作为一种临时的“细胞器”或“核酸载体”在细胞质中活动和复制，等待进入细胞核或进行组装。例如，痘病毒家族的病毒DNA在感染早期会在细胞质中复制。
重要性: 病毒DNA的存在可以引起细胞的功能改变，导致疾病。在特定病毒感染的细胞中，可以将病毒DNA视为一种“非典型细胞器DNA”。
3. 质粒 (Plasmids) 主要在原核细胞中，但有特殊情况:
详细说明: 质粒是存在于细菌等原核生物细胞质中的小型的、环状的、双链DNA分子。它们独立于细菌染色体DNA进行复制，并携带一些非必需但可能对细菌有利的基因，如抗生素抗性基因、毒力因子基因等。
与真核细胞的关系:
在真核生物的实验中: 在分子生物学和基因工程中，我们经常使用质粒作为基因载体，将外源基因导入真核细胞（如酵母、植物细胞，甚至哺乳动物细胞）中进行表达。当质粒成功导入并被细胞接收时，它们可以在细胞质中（如果未整合到基因组中）或整合到细胞核的染色体中存在和复制。
植物的转化: 在植物基因工程中，农杆菌介导的转化过程中，农杆菌的肿瘤诱导质粒 (Ti plasmid) 的一部分TDNA会转移到植物细胞的基因组中。虽然最终TDNA整合到了植物细胞核的染色体DNA中，但在转移过程中，质粒DNA经历了在农杆菌细胞内以及通过细胞间的转移过程。
重要性: 虽然质粒不是真核细胞本身的细胞器，但在生物技术应用中，它们可以作为外源DNA存在于真核细胞中，承担类似“临时遗传单位”的角色。
4. 染色质和染色体 (Chromatin and Chromosomes):
详细说明: 如前所述，细胞核是DNA的主要储存库。我们通常将细胞核内的DNA称为染色体DNA，它们以染色质（DNA与组蛋白结合形成的复合物）的形式存在，并在细胞分裂时浓缩成染色体。
与细胞器DNA的区别: 这是主要的遗传物质，与线粒体和叶绿体DNA（虽然它们是环状的、与组蛋白不结合的DNA）在来源、复制方式、基因组成和功能上都有本质区别。线粒体和叶绿体DNA被认为是内共生起源的，它们保留了原核生物DNA的特征。
总结:
在严格意义上，当我们讨论“细胞器DNA”时，最主要、最普遍且被广泛接受的例子就是线粒体DNA和叶绿体DNA。它们是真核细胞内独立的、膜包裹的、具有自身基因组的DNA分子，并且被认为具有内共生起源。
然而，如果我们将“细胞器”的概念扩展到任何在细胞内具有特定功能、被膜包裹（不一定严格）或具有独立遗传和复制能力的结构单位，那么：
病毒的基因组 在感染状态下可以被视为一种“非典型”的细胞内遗传单位，其DNA可以存在于细胞质或整合到细胞核中。
质粒 虽然主要存在于原核生物，但在基因工程中可以作为外源DNA进入真核细胞，并充当临时遗传单位。
严格来说，除了线粒体和叶绿体，就没有其他被普遍承认的、属于细胞自身固有组成部分的、具有独立遗传信息的“细胞器”拥有DNA了。 其余情况更多的是寄生、外源引入或主要遗传物质的组成部分。
但是，如果我们把“细胞器”这个词的定义稍微放宽，或者考虑到一些非典型的细胞结构和特殊情况，我们可以从更广泛的角度来思考这个问题，尽管这些情况并不像线粒体和叶绿体那样普遍且核心。
以下是一些可以探讨的、与细胞器DNA相关但又不完全是传统线粒体/叶绿体DNA的情况，我会尽量详细地讲解：
1. 细胞核 (Nucleus):
详细说明: 虽然细胞核本身是细胞的“司令部”，包含着绝大部分的基因组DNA（也就是我们常说的染色体DNA），但从广义的“储存遗传信息的结构”来看，细胞核无疑是最大的DNA“库”。然而，当我们讨论“细胞器DNA”时，通常是指存在于膜包裹的、位于细胞质中的、独立于细胞核的DNA。所以，虽然细胞核拥有DNA，但它通常不被列为与线粒体和叶绿体同类别的“细胞器DNA”，因为它构成了细胞的主要遗传物质，并且位于细胞的主要遗传控制中心。
重要性: 细胞核DNA包含了几乎所有编码蛋白质和非编码RNA的基因，决定了细胞的性状和功能。
2. 病毒的基因组（在某些感染状态下）：
详细说明: 病毒不是细胞，它们是寄生性的遗传单位。但是，当病毒感染真核细胞时，它们的基因组DNA（有些病毒是RNA病毒，但有些是DNA病毒）会进入宿主细胞。
整合到宿主DNA中: 许多DNA病毒（如疱疹病毒、腺病毒、人类乳头瘤病毒HPV、逆转录病毒如HIV）的DNA会整合到宿主细胞的染色体DNA中。在这种情况下，病毒DNA就“寄生”在了细胞核的DNA之中，并随着细胞的分裂而复制。从这个角度看，病毒DNA就成为了细胞核内的一部分，但它不是细胞核自身的遗传物质。
游离在细胞质中: 有些病毒DNA在感染初期或特定阶段，可能以游离状态存在于细胞质中，甚至在某些病毒复制周期中，它们会作为一种临时的“细胞器”或“核酸载体”在细胞质中活动和复制，等待进入细胞核或进行组装。例如，痘病毒家族的病毒DNA在感染早期会在细胞质中复制。
重要性: 病毒DNA的存在可以引起细胞的功能改变，导致疾病。在特定病毒感染的细胞中，可以将病毒DNA视为一种“非典型细胞器DNA”。
3. 质粒 (Plasmids) 主要在原核细胞中，但有特殊情况:
详细说明: 质粒是存在于细菌等原核生物细胞质中的小型的、环状的、双链DNA分子。它们独立于细菌染色体DNA进行复制，并携带一些非必需但可能对细菌有利的基因，如抗生素抗性基因、毒力因子基因等。
与真核细胞的关系:
在真核生物的实验中: 在分子生物学和基因工程中，我们经常使用质粒作为基因载体，将外源基因导入真核细胞（如酵母、植物细胞，甚至哺乳动物细胞）中进行表达。当质粒成功导入并被细胞接收时，它们可以在细胞质中（如果未整合到基因组中）或整合到细胞核的染色体中存在和复制。
植物的转化: 在植物基因工程中，农杆菌介导的转化过程中，农杆菌的肿瘤诱导质粒 (Ti plasmid) 的一部分TDNA会转移到植物细胞的基因组中。虽然最终TDNA整合到了植物细胞核的染色体DNA中，但在转移过程中，质粒DNA经历了在农杆菌细胞内以及通过细胞间的转移过程。
重要性: 虽然质粒不是真核细胞本身的细胞器，但在生物技术应用中，它们可以作为外源DNA存在于真核细胞中，承担类似“临时遗传单位”的角色。
4. 染色质和染色体 (Chromatin and Chromosomes):
详细说明: 如前所述，细胞核是DNA的主要储存库。我们通常将细胞核内的DNA称为染色体DNA，它们以染色质（DNA与组蛋白结合形成的复合物）的形式存在，并在细胞分裂时浓缩成染色体。
与细胞器DNA的区别: 这是主要的遗传物质，与线粒体和叶绿体DNA（虽然它们是环状的、与组蛋白不结合的DNA）在来源、复制方式、基因组成和功能上都有本质区别。线粒体和叶绿体DNA被认为是内共生起源的，它们保留了原核生物DNA的特征。
总结:
在严格意义上，当我们讨论“细胞器DNA”时，最主要、最普遍且被广泛接受的例子就是线粒体DNA和叶绿体DNA。它们是真核细胞内独立的、膜包裹的、具有自身基因组的DNA分子，并且被认为具有内共生起源。
然而，如果我们将“细胞器”的概念扩展到任何在细胞内具有特定功能、被膜包裹（不一定严格）或具有独立遗传和复制能力的结构单位，那么：
病毒的基因组 在感染状态下可以被视为一种“非典型”的细胞内遗传单位，其DNA可以存在于细胞质或整合到细胞核中。
质粒 虽然主要存在于原核生物，但在基因工程中可以作为外源DNA进入真核细胞，并充当临时遗传单位。
严格来说，除了线粒体和叶绿体，就没有其他被普遍承认的、属于细胞自身固有组成部分的、具有独立遗传信息的“细胞器”拥有DNA了。 其余情况更多的是寄生、外源引入或主要遗传物质的组成部分。
网友意见
除线粒体和叶绿体外，非叶绿体的质体也有自己的 DNA；许多原核生物和一些真核生物有质粒，质粒当然有 DNA，但中学阶段做题可能不考虑真核质粒、出题人经常不考虑原核生物。一部分真核生物的氢化酶体有 DNA，你做的题目没提这个大概就不用管。
细胞质含有少量 DNA，它们可以被囊泡包裹并送到各种膜细胞器或排出细胞之外。这些不是“用于指导细胞器自身的蛋白质合成的 DNA”，在中学生物范围内一般不用考虑。
有些国家的教科书认为细胞核和拟核也算细胞器。在不正常的细胞里形成的微核亦可含有 DNA。
某些真核生物的 Mitosome、Ocelloid 可能含有 DNA，另一些似乎不含 DNA。这方面的研究还很初步。
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