因为当时很多雄藩的实权已经不掌握在藩主手里。明治维新看起来似乎是一场自上而下的变革,西南雄藩联合明治朝廷打败了江户幕府,但是仔细探究,西南雄藩内部和幕府内部,藩主和将军都非绝对话事人:
萨摩藩算是藩主权力最大的了,岛津齐彬尚能掌握大权,到岛津忠义时已沦为傀儡,藩政皆从西乡隆盛出。这也就是为什么到废藩置县的时候,岛津家心存不满也只能放一晚上烟火泄愤,而明治政府的改革侵害到下层武士的利益时,西乡隆盛可以拉出数万萨军攻打熊本城。
长州藩从第一次长州征伐开始到版籍奉还,从桂小五郎到高杉晋作,都没毛利敬亲什么事,第一次长州征伐,长州战败,幕府的处置是:三位家老切腹,毛利敬亲谨慎(软禁),可见幕府方面也知道藩主非掌实权。
至于土佐更是混乱,武士分为藩士和乡士,下层的乡士多是长宗我部旧臣,上层的藩士是山内带来的亲兵,而且长期没有交流,山内对于乡士的控制力本来就比其他藩差很多。
肥前藩和土佐类似也是藩主权力天然有缺陷,肥前名义上有35万石,但是刨去庶流支藩和原主家龙造寺四家,藩主实际收入只有6万石,藩主即使江户前期都不能控制全领何况幕末?
至于幕府方,一桥庆喜本身就不愿与朝廷开战,鸟羽伏见一场失败就放弃大阪乃至江户无血开城,御三家之一的尾张藩在大阪就当了带路党,反倒是作为将军臣下的会津藩血战到底。三代及之前的幕府将军尚有天下人的威权:最上家57万石大名(奥羽的石高都比较实在,最上家实际估计有百万石)因为不能压制家臣纷争被撸成5000石旗本(最上骚动);春日局一介乳母,毫无官职就可以随意拜见天皇,天皇也只能退位表示委婉的抗议。三代以下的将军就逐渐拉胯:四代家纲软弱无能,老中酒井忠清专权被称为“下马将军”,家纲病危无嗣,忠清想仿旧北条氏旧例,从宫中拥立亲王做将军(傀儡),被德川光圀等人反对而不得,最后忠清居然全身而退。这在当时的大清或者法国是不可想象的。忠清当权时发生了和最上骚动类似的伊达骚动,结果伊达氏不但家名保全,石高更是一石未减,幕府权威衰微可见一斑。