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如何看待科学家将视频「放入」大肠杆菌? 第1页

  

user avatar   zhang-hao-qian 网友的相关建议: 
      

科学技术层面,nonsense. 很科普,适合发表在Scientific American上。


user avatar   li-lei-up 网友的相关建议: 
      

完美论证了“破事水”这三个字。


搁在普通人,也就是个uc 头条,即使大牛也是走个nature news ,没想到竟然是论文。


不过从文章的接稿信息来看,其实还是送审了,而非编辑随便定的。2016年接的,2017年发表的

Received 22 August 2016 Accepted 02 June 2017 Published online 12 July 2017

单位是

Department of Genetics, Harvard Medical School, 77 Avenue Louis Pasteur, Boston, Massachusetts 02115, USA

文章的意义是

This work demonstrates that this system can capture and stably store practical amounts of real data within the genomes of populations of living cells.

本文论证了这个系统可以在活细胞群中捕获和稳定储存实际数据


回头我写两句诗进去看看能行不,说不定可以实现大肠杆菌永生化。


user avatar   guo-hao-tian-10-31 网友的相关建议: 
      

发表在Nature这样的杂志上,我觉得很大程度上是因为通讯作者是大犇George Church,不但名声好,而且特别会玩媒体,能帮Nature吸引流量。

而且存个gif,给高中生5000刀每人summer school做个小实践,非常寓教于乐。


但是工作的科学性本身…不客气地讲,毫无卵用。

DNA存储其实这两年新闻也不少呀,作为synbio的一个小分支,其实走的非常远了。

现在DNA可以很低成本地合成非常大的片段。与其设计520个小片段分别导入细菌,为什么不直接合成一个包含同样信息的大片段,一次性放进去呢?对于细菌DNA大规模的改造,直接合成DNA去替换原有的DNA,一定是比一个一个进行engineering要来得方便、便宜、高效得多。其实连Church实验室自己的人也是这么认为的,他们年初的对大肠杆菌遗传编码的改造,就是基于DNA合成和替换,而不是使用CRISPR甚至更古老的MAGE对DNA一个点一个点的修饰改造实现的。Design, synthesis, and testing toward a 57-codon genome


不要以为能在细菌里存个gif就了不得了。直接用DNA存储效率不知道高到哪里去。这个idea最早也是Church lab开始做的,2016年能够无损存储22MB。同一年,巨硬公司、Twist和华盛顿大学的合作项目走得更远,可以用一根铅笔尖大小的DNA存储200MB的信息,而且可以无损读出!(200MB!存个小黄片都轻轻松松。)

粉色部分是被染色的DNA,Microsoft and University of Washington researchers set record for DNA storage - Next at Microsoft

For now, the bar is set at 200 megabytes. That’s how much data the researchers were able to encode in synthetic DNA pairings, and then correctly read out again. The encoded files included a high-definition music video by the band OK Go, titled “This Too Shall Pass”… the Universal Declaration of Human Rights in more than 100 languages … the top 100 books from Project Gutenberg … and the Crop Trust’s global seed database.


既然我们已经能够在DNA存储如此可观的信息,为什么还要把信息存储在细胞里面呢?而且似乎没有任何优势呀:这篇文章的方法中,不同值的存储效率差别非常之大。单个细胞的DNA所存储的信息也并不准确,需要整个群体才能正确读出,然而精度也远远不如只用DNA。随着整个种群的不断复制繁殖,这段信息很快就会随着种群的进化而失真。而相比而言,干燥的DNA稳定程度之高,可以保存数个世纪。


我估计这也是为什么这篇逻辑链条如此清晰的文章审稿用了一年多。但是George毕竟强无敌,还是把审稿说服了……


user avatar   CaptainK2 网友的相关建议: 
      

Church还玩上瘾了……以前写了venter一句话,后来church就编辑过一本书进dna了


现在一个gif,就内容来讲好不新鲜啊,不过这次是使用crispr塞进去的而已,而原核生物由于没有同源染色体的同源重组来修复切口,crispr在原核生物中的应用是有些技术困难的


如果吹『DNA存储』的故事的话,是压根用DNA分子就好了不需要塞进细胞,塞进细胞还会被细菌自己突变甚至干掉……


科学上嘛,显然是没有任何卵用的




  

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