如何看待华南农业大学发现穿山甲为新型冠状病毒潜在中间宿主？具体情况是怎样的，有何意义？
具体情况是怎样的？
这则重磅消息来自华南农业大学的林更新教授团队。他们在2020年初，也就是新冠疫情爆发初期，对走私的马来穿山甲进行了研究。研究人员从这些穿山甲的肺部、肠道等组织样本中分离出了一种冠状病毒。
经过基因序列比对，他们发现这种穿山甲冠状病毒与引起人类感染的新型冠状病毒（SARSCoV2）在关键的受体结合域（RBD）上有非常高的同源性，甚至达到了90%以上。这意味着，穿山甲身上的这种病毒，在理论上具备与人类细胞ACE2受体结合并进入细胞的能力，这正是病毒感染人类的关键一步。
更重要的是，研究还发现，穿山甲病毒的基因组序列与在人类患者身上发现的新型冠状病毒在其他区域也有相当程度的相似性，虽然并非完全一致。这种相似性表明，穿山甲病毒很可能在病毒进化过程中扮演了某种“中间宿主”的角色，将一种蝙蝠来源的冠状病毒，通过某种方式，比如基因重组，变得更能感染人类。
有何意义？
这项发现的意义非常深远，可以从多个层面来看：
1. 为溯源研究提供重要线索： 新冠病毒的起源一直是科学界最关注的焦点之一。在疫情初期，人们就猜测可能是由野生动物传播给人类的。蝙蝠被普遍认为是病毒的天然宿主，但蝙蝠病毒通常很难直接感染人类。因此，寻找能够“桥接”蝙蝠和人类的中间宿主至关重要。华南农业大学的这项研究，为穿山甲成为这个“桥梁”提供了有力的证据。这有助于科学家们进一步缩小溯源范围，更精确地追踪病毒从蝙蝠到人类的传播链条。
2. 揭示病毒跨物种传播的机制： 病毒从一种动物传播到另一种动物（甚至跨物种传播到人类），往往需要经历一个复杂的进化过程。穿山甲身上发现的病毒与SARSCoV2的高度相似性，尤其是其受体结合域的相似，表明了病毒在跨物种传播过程中发生了关键性的变异。这可能意味着，在病毒从蝙蝠传播到穿山甲的过程中，或者在穿山甲体内发生进一步演化时，其基因组发生了改变，使其获得了更强的感染人类的能力。理解这个机制，对于预测和预防未来可能出现的类似疫情至关重要。
3. 加强野生动物贸易和消费的监管： 穿山甲是世界上被非法交易最频繁的哺乳动物之一，其鳞片和肉常被用于传统医药和食品。这项研究无疑给那些非法野生动物贸易敲响了警钟，进一步凸显了野生动物贸易和消费对全球公共卫生的巨大风险。为了防止未来的大流行病，必须进一步加强对野生动物贸易的打击力度，并提高公众对野生动物保护和禁止消费野生动物的意识。
4. 指导公共卫生政策制定： 科学研究是制定有效公共卫生政策的基础。这项发现为政府和相关部门在野生动物管理、动物疾病监测以及疾病防控策略的制定上提供了重要的科学依据。例如，可以考虑在野生动物交易和消费的重点区域加强病毒监测，并对可能存在的潜在中间宿主动物采取更严格的管理措施。
5. 推动病毒学和进化生物学研究： 这项发现也为病毒学和进化生物学领域的研究提供了新的课题和方向。科学家们可以进一步研究穿山甲病毒的完整基因组，分析其与蝙蝠病毒的差异，并深入探究病毒在穿山甲体内是如何发生适应性进化的。这些研究成果将极大地丰富我们对冠状病毒的认知。
需要注意的几点：
“潜在”中间宿主： 虽然证据有力，但科学上通常会谨慎使用“潜在”一词。这意味着穿山甲很有可能是一个中间宿主，但也不能完全排除其他动物也可能参与了传播链。溯源工作仍在继续，可能还需要更多的证据来完全确认。
非直接传播的证据： 这项研究发现了病毒，但并不直接证明穿山甲是导致武汉最初爆发的那个特定病毒的直接来源。病毒的传播链可能非常复杂，涉及多种动物。
穿山甲的保护： 这一发现也让穿山甲这个本已濒危的物种面临更大的压力。强调穿山甲的保护，同时也要避免因“中间宿主”的身份而引发的过度猎杀或歧视。
总而言之，华南农业大学关于穿山甲作为新冠病毒潜在中间宿主的研究，是一项具有里程碑意义的科学发现。它不仅为我们理解新冠病毒的起源提供了关键线索，也深刻警示了人与自然和谐共生的重要性，以及加强野生动物保护和规范人类行为的必要性。
网友意见
穿山甲，
快躲起来！
现在有一个问题，国内穿山甲来源一般是非洲或者东南亚，国内的穿山甲种群已经非常稀少了。如果是进口的，那源头就更不好找了。
华南农大的文章还没发布，新闻说：
攻关团队通过分析1000多份宏基因组样品，锁定穿山甲为新型冠状病毒的潜在中间宿主；继而通过分子生物学检测，揭示#穿山甲#中β冠状病毒的阳性率为70%；进一步对病毒进行分离鉴定，电镜下观察到典型的冠状病毒颗粒结构；最后通过对病毒的基因组分析，发现分离的病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%。
等文章出来再解读。
根据目前华南农大的消息，基本思路是
1，宏基因组检测后比对，发现穿山甲可能性高
2，对之前的穿山甲样本进行检测，找到高度相似病毒
—以下内容只是解读前几天的一个研究，不是这次华南农大的研究—
本文大部分内容是我之前写过的一篇未发表的草稿，当时内容太震撼了，穿山甲是非常庞大的产业链，涉及到无数医药和从业人员，我怕~你懂得！
现在华南农大爆出来了，所以我就分享一下几天前的一篇分析穿山甲病毒和新型冠状病毒的文章。
开篇强烈预警：
下面这篇文章是一个科学算命，纯粹的生物信息学研究，大家只是看看就行，千万别当真。因为，作为一个科学算命工作者，我深知生物信息学就是科学算命，必须要有真实的证据才能作证这一切。
本文来源于[1]
题目的意思是：通过对新型冠状病毒的spike蛋白受体结构域分析，发现新型冠状病毒的相似度和马来亚穿山甲病毒多样性的数据集十分相似。
简单的介绍一下。
首先，什么是spike蛋白？大家知道冠状病毒为啥叫“冠状”病毒么？其实就是因为它表面有一堆凸起的东西，就像帽子（冠）一样，所以才叫冠状病毒，而这个冠，就是spike蛋白（英文意思是尖、突）。
瞅一眼这次新型冠状病毒电镜下的照片
这是冠状病毒包膜上的一个刺突糖蛋白（S，Spike Protein），也就是大家目前认为病毒能够感染人的重要因素，这个蛋白的作用是识别并结合宿主细胞表面受体血管紧张素转化酶Ⅱ（ACEⅡ），从而介导病毒包膜与细胞膜融合。
比如当年SARS病毒就是通过s蛋白去结合人体的ACEⅡ相互作用而入侵人体的。目前各大机构对于新型冠状病毒的感染机制仍主要集中在这个s蛋白上。
通俗的理解就是：有了这家伙，病毒才能抓住细胞，否则就是滑不溜的粘不住，那自然也无法入侵了。
所以，这篇研究就把目光瞄准了s蛋白，他们选择的是s蛋白的保守性。
之前，武汉病毒所的石正丽他们通过序列比对，认为病毒是来自于蝙蝠RaTG13 genome (EPI_ISL_402131)[2]。
作者比较石正丽研究员的文章时候发现，尽管这次病毒和蝙蝠相似度极高，高达96% 。
但是，spike病毒这个关键的东西结构域（S1 Receptor Binding Domain (RBD)）却明显的不一样，尤其是在第350-530氨基酸序列，相似度仅有91%(大家记住这个数字）。
大家可以理解为最关键的结合位置不一样。
这就有意思了，这么大差异，直接从蝙蝠到人身上，那难度太高了，毕竟相差太远，病毒感染也为难。一定有个中间宿主在发挥作用，让整个病毒在中间宿主上继续发生进化，直到其更容易感染人类。事实上，中间宿主是蝙蝠感染的常见历史，SARS，MERS都是蝙蝠通过中间宿主感染了人
所以这次大家也纷纷寻找新型冠状病毒的中间宿主。
作者怀着怀疑，决定去寻找一个更加接近的中间宿主。办法当然是生物信息学了，他们把这次新型冠状病毒的序列丢到公共数据库上进行寻找，结果意外发现，这段序列，竟然和穿山甲的病毒库最像，高达97%的相似度，远超过和蝙蝠91%的相似度。
这个数据库是最近才发表的Malayan pangolins病毒数据库（PRJNA573298106）。
这是截至目前为止，这段核心序列最高的比对率，大家可以理解为相似度，97%。
Malayan pangolins是什么呢？
答案是，穿山甲。
到此为止，文章介绍完毕，下面是分割线！！！
—————可靠吗？—————
1，比蛇更可靠，因为，穿山甲是哺乳动物。
之前有人认为是蛇，当然这个我认为是不可信的， 因为他们自相矛盾，自己的图上，竟然发现蝙蝠寄生的病毒最佳宿主反而成了蛇。
其实从常理来看，动物越接近，病毒越共享，毕竟动物在分类上越接近，越意味着他们本身相似度高，基因相似度，细胞受体相似度都高，那么对于病毒来说，越容易感染，比如猩猩和人类共享的艾滋病毒HIV，绿猴和人类共享的马尔堡病毒、埃博拉病毒。
穿山甲，属于哺乳动物，这一点要更靠谱，再来补充一张分类图，感谢 @好大一盆绿萝
2，穿山甲是一种重要的药材
在药物中是允许穿山甲入药的，也有很多人吃穿山甲
3，但也不这么急
因为我说过，生物信息学是科学算命，所以，算命这事情，终究只是玩玩数据，真正确认还需要更加真实的证据，比如，那些染病者，到底接触穿山甲了没
但是，至少，给溯源的团队，提供一个参考，不妨去检测下穿山甲！
————再次声明—————
本文仅仅是科学探讨以及合理的推理，本文的所有参考资料均网上可查。
2、Zhou, P., Yang, X., Wang, X. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature (2020).
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