天皇在室町幕府时期有自己的领地(御料地),公卿也有自己的领地。虽然这些领地的数量不足以让朝廷与幕府和武士阶层抗衡,但勉强可以维持朝廷的财政脱离幕府运作。而室町幕府也会为了政治需要,向朝廷提供一定的经济援助。
战国时期,天下大乱,天皇和公卿的领地在战乱中基本都被武士抢走了,朝廷财政崩溃。朝廷只能靠买家里东西来维持生活,从官爵、宝物到字画无所不卖,甚至有后妃宫女卖淫赚钱的记载。很多公卿则是逃离京都,投靠地方大名要饭。
在安土桃山时代,织田信长和丰臣秀吉都出于政治需要给了朝廷很优厚的经济支持。但他们都拒绝归还朝廷被夺走的领地,从而将朝廷的财政供给逐渐纳入武士政权的财政支出。
江户时代,江户幕府在织田信长和丰臣秀吉的基础上将幕府对朝廷的财政供给规范化,将朝廷的收入严格限制在约十万石(后来增加到约二十万石)。此后朝廷的财政供给完全成为幕府财政支出的一部分,直到倒幕战争和明治维新。
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