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世卫组织称新冠 Delta 变异株正在成为全球主要流行的变异株,将带来哪些影响? 第1页

  

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新冠病毒Delta变异株强势反击,防疫需借鉴疫苗的现实世界数据丨117三人行

是否需要打第三针疫苗加强针?什么人应该打?什么时候打最好?社交隔离政策应当收紧还是放宽?……其他国家和地区对新冠疫情流行病学数据的密切观察和分析,有助于我们做出适当的防疫决策。


撰文 | 史隽


虽然以色列的新冠疫苗接种率在全世界处于领先地位(已有超过80%的成年人接种了疫苗),但最近一段时间,以色列疫情似有卷土重来的迹象,新冠病毒Delta 变异株的病例急剧增加。据以色列耶路撒冷希伯来大学的报告,15岁以上的新增病例中有90%是已经完成疫苗接种的人。7月23日,以媒称辉瑞疫苗阻止Delta变异株传播的效力仅有39%,但仍可预防重症。


同时,美国各地的新冠病例也有所增加,类似的,也是相当一部分的确诊病例是已经完成疫苗接种的人,通常被称作突破性病例。截至 7 月 17 日,马萨诸塞州统计有 5,166 例突破性病例。其中,272人住院并存活;有 80 人去世,其中23 人没有住院而死亡;57 人在住院后死亡。马萨诸塞州的居民完全接种了疫苗有4,344836 名,占所有居民的63%。


很多医生认为,疫情反复的最大原因是Delta 变异株的传染性是原始毒株的两倍




图1:新闻报道美国马萨诸塞州新增感染人数增加[1]


个人认为,这一波疫情反复可能有以下4个原因:

  • 变异株的传染力增强了。
  • 疫苗的有效率随着时间减弱了。
  • 疫苗对变异株的有效性减弱了。
  • 接种了疫苗的人更容易大意,不注重基本防护。





除了Delta变异株,目前到底还有哪些变异株值得担心呢?

今年2月初,我曾对当时已经出现的新冠病毒变异株做了一次梳理(详见《新冠病毒变异株大梳理:变异必将继续,人类何去何从?| 117三人行》)。自那以后,又出现几个新的变异株。5月31日,世界卫生组织采用了一个新的系统来命名新冠病毒变异株。

在更改命名之前,这些变异株除了有科学界常用的字母+数字名称,还通常用首次发现它们的国家/地区来提及。例如,首先在英国发现的 B.1.1.7 通常被称为“英国变异株”,而 B.1.351 被称为“南非变异株”,较新的 B.1.617.2 则被称为“印度变异株”。

新的命名系统使用希腊字母,而不是民间常用的国家名称,也不用科学界常用的“字母+数字”模式。这样做,可以避免给这些国家带来污名,另外,希腊字母更易于发音,适合普通大众的讨论,可以避免 “字母+数字”难记的坏处。同时,科学家们将继续使用“字母+数字”的命名系统。

命名系统避免污名化,并不是多此一举。

Delta 变异株在印度被发现,并在世界很多国家迅速传播开后,印度政府要求社交媒体平台删除有关“印度变异株”的内容。世卫组织担心,如果延用旧的命名方式,各国可能会因为顾虑新的变异株要用自己国家的名字来命名,而不愿意报告新变异株。

残酷的事实是:只要新冠病例一天不清零,就会有新的变异株出现。

新的变异株出现以后,科学家们会努力去了解清楚它们的特征,例如:

  • 是否更容易传播?
  • 是否会导致更严重的疾病?
  • 当前可用的病毒测试方法是否能检测到?
  • 对目前的新冠药物反应如何?
  • 以及,目前被批准使用的疫苗对它们的防疫能力有没有减弱?


研究表明,到目前为止,新冠病毒有几个在刺突蛋白上的突变特别麻烦。带有这些突变的新冠病毒变异株所引起的病例,可能会让特定的单克隆抗体疗法变得不那么有效。这些突变包括:

  • L452R突变。在好几个变异株中有。
  • E484K 突变。在好几个变异株中有。
  • K417N、E484K 和 N501Y 突变组合。Beta (B.1.351)变异株中存在。
  • K417T、E484K 和 N501Y 突变组合。Gamma (P.1) 变异株中存在。


目前几个主要的新冠病毒变异株的特性可以用下面这张表格概括:







*引用文章尚未经过同行评审。





我们经常听到Delta 变异株更容易传播的消息,但Delta变异株到底和原来的新冠病毒有什么不同呢?最近一篇新研究进一步分析了这个变异株[23]

一个病毒传染力增强的原因可能有几种:

  1. 从宿主身上脱落得更多。
  2. 传染期加长,有更长的时间能从宿主身体脱落去感染别人。
  3. 传染性增加,能更好地感染宿主细胞,与细胞表面的受体更好的结合。
  4. 在环境中的稳定性增加,更耐湿热等。


研究者调查了中国大陆首次本地传播的Delta变异株感染,采集的167个病例均可追溯到同一个病例源头。流行病学数据分析显示:

  • 暴露于病毒中后,感染 Delta 变异株的人更快地检测出阳性,这表明Delta 变异株在体内增长更快;
  • 感染 Delta 变异株的人在首次检测时,病毒载量比感染2020年原始毒株的人高出 1000 倍。


这表明,与初始毒株相比,Delta变异株的潜伏期缩短了,而且感染者排出(散播)的病毒是过去的1000倍,这会大大增加密切接触者感染的几率。同时,潜伏期缩短也意味着感染Delta变异株后的人能更快具有传染性,就有更多机会感染其他人。也就是说,病毒传播更为高效了。

通过追踪病毒的传播路径并做系统发育分析,这份研究还发现,在这167个病例中,Delta变异株的传播途径有直接接触和间接传播,后者最有可能是通过气溶胶,而非污染物。换言之,Delta变异株的主要传播途径仍然是直接接触和气溶胶间接传播,而不是坊间传说的“更容易在空气中传播”。

图2. 实线表示高度置信的直接接触传播,虚线表示可能为间接传播[23]。(点击看大图)


因此,Delta变异株传播率增加的原因主要有二:病毒量更多,传染速度更快。但传播方式没有变化。





现有疫苗对Delta变异株的有效性究竟如何,不同国家的研究结论也不完全相同。

最近有一项发表在《新英格兰医学杂志》上的研究,基于英国的现实世界数据,证实了英国公共卫生部在 5 月份发表的疫苗功效数据。这项研究发现,在英国,两剂辉瑞新冠疫苗接种完成后,预防 Delta 变异株引起的有症状病例的有效率为 88%,而对 Alpha 变异株的有效率为 93.7%。两针牛津-阿斯利康疫苗对 Delta 变异株的有效率为 67%,对 Alpha 变异株的有效率为 74.5%[24]

而一项来自以色列的小规模研究的初步数据表明,最近几周,辉瑞疫苗预防新冠感染的效果有所下降。根据以色列卫生部的数据,在 6 月 20 日至 7 月 17 日期间(具体人数尚未公布),Delta 变异株在以色列新冠病例中占主导地位,辉瑞疫苗两次接种完成后,在降低感染风险方面的有效率为 39%,降低有症状病例的有效率为 40%, 降低住院病例的有效率为 88%,降低重症风险的有效率为91%[25]

以色列和英国的情况有两点值得考虑:

第一,以色列开始大规模接种的时间较早,疫苗的保护作用可能已经开始下降了。

第二,在英国,辉瑞疫苗两针的间隔是8周以上,而以色列是传统的3周间隔。

英国最初在 2020 年底将辉瑞新冠疫苗两针之间的间隔延长至 12 周。随着疫苗在英国的覆盖率提高,现在这一间隔已缩短到8周。一篇未经同行评审的预印本文章调研了 503 名 英国国家健康机构(NHS)工作人员打完辉瑞新冠疫苗以后的免疫反应[26]。这些工作人员在 2020 年底和 2021 年初以不同的时间间隔接受了两次注射,当时Alpha 变异株正在英国迅速传播。第二针的1个月后,研究人员测量了这503人血液中的抗体水平。

研究结果表明:

  1. 辉瑞疫苗两针间隔时间无论短还是长,总体上都产生了强烈的免疫反应。
  2. 3周疫苗间隔产生的中和抗体比与10 周间隔少。
  3. 第一针以后,虽然抗体水平有所下降,但 T 细胞(细胞免疫)的水平仍然很高。
  4. 更长的间隔时间虽然导致总T 细胞较少,但其中一个特定的类型,被称为辅助 T 细胞,比例更高。而这种细胞是支持免疫记忆的关键


这项研究的首席研究员 Susanna Dunachie 教授说,辉瑞疫苗两针比一针好,但两针间隔的时间可以根据情况灵活安排。对于英国目前的情况,她认为8周间隔是最佳时间。

这类对数据的密切观察分析虽然是在以色列、英国和世界其他国家和地区进行的,但是对别的国家的公共卫生政策有着重要的意义。例如,是否、什么时候需要打第三针加强针?需不需要恢复社交隔离?等等问题,都可以借鉴这些国家和地区的数据来做决定。

现有的新冠疫苗是针对还没有这些变异的病毒株研发的。虽然有研究表明现有的新冠疫苗对某些变异株的效力降低了,但这些疫苗似乎仍能预防感染以后的重症。确切的结论还需要进一步的研究,疫苗制造商也在开发针对这些变异株的新疫苗

参考文献

[1] nbcboston.com/news/loca.

[2] Davies, N.G., et al., Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England. Science, 2021. 372(6538).

[3] depts.washington.edu/pa.

[4] fda.gov/media/145802/do.

[5] Wang, P., et al., Antibody resistance of SARS-CoV-2 variants B.1.351 and B.1.1.7. Nature, 2021. 593(7857): p. 130-135.

[6] Shen, X., et al., SARS-CoV-2 variant B.1.1.7 is susceptible to neutralizing antibodies elicited by ancestral spike vaccines. Cell Host & Microbe, 2021. 29(4): p. 529-539.e3.

[7] Edara, V.V., et al., Infection and mRNA-1273 vaccine antibodies neutralize SARS-CoV-2 UK variant. 2021: p. 2021.02.02.21250799.

[8] Collier, D.A., et al., Sensitivity of SARS-CoV-2 B.1.1.7 to mRNA vaccine-elicited antibodies. Nature, 2021. 593(7857): p. 136-141.

[9] Wu, K., et al., mRNA-1273 vaccine induces neutralizing antibodies against spike mutants from global SARS-CoV-2 variants. 2021: p. 2021.01.25.427948.

[10] papers.ssrn.com/sol3/pa.

[11] cmmid.github.io/topics/.

[12] fda.gov/media/145611/do.

[13] Madhi, S.A., et al., Safety and efficacy of the ChAdOx1 nCoV-19 (AZD1222) Covid-19 vaccine against the B.1.351 variant in South Africa. 2021: p. 2021.02.10.21251247.

[14] ir.novavax.com/press-re.

[15] jnj.com/johnson-johnson.

[16] Wang, P., et al., Increased Resistance of SARS-CoV-2 Variant P.1 to Antibody Neutralization. 2021: p. 2021.03.01.433466.

[17] Deng, X., et al., Transmission, infectivity, and antibody neutralization of an emerging SARS-CoV-2 variant in California carrying a L452R spike protein mutation. 2021: p. 2021.03.07.21252647.

[18]khub.net/documents/1359.

[19] Jangra, S., et al., SARS-CoV-2 spike E484K mutation reduces antibody neutralisation. The Lancet Microbe, 2021. 2(7): p. e283-e284.

[20] Annavajhala, M.K., et al., A Novel and Expanding SARS-CoV-2 Variant, B.1.526, Identified in New York. 2021: p. 2021.02.23.21252259.

[21] Greaney, A.J., et al., Comprehensive mapping of mutations in the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human plasma antibodies. Cell Host & Microbe, 2021. 29(3): p. 463-476.e6.

[22] Garcia-Beltran, W.F., et al., Multiple SARS-CoV-2 variants escape neutralization by vaccine-induced humoral immunity. Cell, 2021. 184(9): p. 2372-2383.e9.

[23] virological.org/t/viral.

[24] Lopez Bernal, J., et al., Effectiveness of Covid-19 Vaccines against the B.1.617.2 (Delta) Variant. 2021.

[25] cnbc.com/2021/07/23/del.

[26] pitch-study.org/PITCH_D.


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保留好疫苗预约方式,等着以后若干年每年都要打加强针。


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应该是南京这次疫情波及范围太大了吧,这个1个月前写的回答又有人看了,那这样我就干脆再补点内容,这样这个回答就算对Delta毒株的特点,做一个比较系统性的梳理了。

首先,针对评论区有朋友问,Delta毒株对疫苗的逃逸能力强,这一点有没有实锤。有一说一,确实是有的,而且不管是国内的灭活/蛋白亚单位疫苗还是国外的mRNA疫苗,面对delta,都出现了类似的情况。

比如说,在这项发表在新英格兰医学的研究结果[1],就展示了辉瑞(BNT162b2)和牛津(ChAdOx1 nCoV-19)疫苗面对Delta效力有所降低。

国内科兴的灭活疫苗(ConoraVac )和智飞的蛋白亚单位疫苗(ZF2001),也有类似的结果[2]

另外,Delta毒株还有一个很“暴力”的特点,就是在感染者首次检测到核酸阳性时,其测到的病毒载量(Viral load)更高,通俗来讲,就是在统一体积的样本里,病毒载量越高,说明病毒量越大,也侧面反应出感染后,病毒在感染者体内的病毒复制速度就越快

而用来判断病毒载量的,通常是使用一个PCR cycle threshold的数据,也就是我们经常听到的ct值,做过PCR实验的朋友,肯定不陌生(我读博期间唯一做过的实验)。用白话来讲,因为在采集的样本里,病毒的绝对值肯定是很少的,因此我们需要利用PCR仪,首先对样本中的病毒DNA进行扩增,从而让其DNA浓度达到一个可以被观察到的最小浓度,那这个过程中的复制次数,就叫做cycle threshold(Ct),这样说应该就不难理解了对吧,那就是如果本来的基数大,那要达到阈值所需要的复制的次数肯定就越低,换句话说,Ct值越低,说明病毒的初始浓度就越高。而最初的新冠,检出的Ct值一般都在28-30左右,而感染Delta的患者,这个Ct值普遍在20上下,甚至出现了16.... 这可能说明Delta毒株的复制速度比初始毒株快了1000多倍...

不得不说,这就是进化的结果,所以很多朋友可能弄反了因果,并不是因为Delta成为了全球主流毒株,所以才有了这些特点,而是因为Delta有了这些特点,所以才能在军备竞赛中胜出,成王败寇,物竞天择,就是这个意思。

-------------------------6月30日原回答-------------------------

在谈影响之前,可能有些朋友对Delta变异株都还比较陌生,不知道是什么时候冒出来的。所以,首先我们来捋一捋这个所谓Delta变异株是何方神圣。

其实这个Delta变异株,最早在去年年底就已经在印度被发现了[3],其更系统的一个名称叫做B.1.617.2,其实就是B.1.617变异毒株的一个亚型,说起B.1.617这个名字,很多朋友应该就不陌生了吧,之前闹得沸沸扬扬的“双突变”毒株就是它。所以通俗来讲,Delta变异株其实就是在B.1.617的基础上进一步变异而来[4]

从基因组层面来看,Delta变异株一共有13处突变,其中最关键的突变有四处,均发生在病毒的S蛋白区域,分别是D614G,T478K, P681R和L452R,因为这些突变均能改变病毒S蛋白的氨基酸序列,因此可能造成S蛋白结构的改变。同时,也的确有研究数据表明这些突变会影响病毒的传播性,以及被抗体中和的能力[5][6]而事实也的确如此,传播力强,潜伏期短,病毒载量高,病情发展快,重症比例高等特点也相继被发现

目前Delta变异株的传播有多夸张呢?据世卫组织6月21日公布的内容,Delta变异株变异毒株已传播至全球92个国家,并且依然在全球迅速蔓延。过去七天,英国99%的新增确诊病例感染的都是Delta,在俄罗斯莫斯科,89.3%的新冠肺炎患者体内也都发现Delta,德国疾控机构罗伯特·科赫研究所所长也指出,最迟将在今年秋季,Delta大概率会成为德国境内的主流毒株。

至此,世卫也将Delta毒株加入了需要关切(of concern)的标签,目前有该标签的毒株一共有四种,分别是最早在英国发现的毒株B.1.1.7—阿尔法(Alpha);最早在南非发现的毒株B.1.351—贝塔(Beta);最早在巴西发现的毒株P.1—伽玛(Gamma)和最早在印度发现的毒株B.1.617.2—德尔塔(Delta)。

这样的情况下,将带来哪些影响呢?

其实主要的影响,相信大部分朋友都能想到,病毒的持续变异,加上目前部分区域疫情已经很难遏制,这在一定程度上肯定会延长疫情的持续时间,全球贸易全面恢复的时间肯定也会相对延后。

但我认为还有一点很值得关注,那就是疫苗的完整注射率,从现有的数据我们知道,虽然Delta毒株存在一定的免疫逃逸现象,同时其造成的重症比例较高,但完成了全程接种新冠疫苗的人即使发生了感染,发生重症的风险相对于没有接种的人群也是大大减少的。但是,对于大部分两针剂的新冠疫苗,要使体内的中和抗体真正达到有效的保护滴度,是需要完整的两针注射的。只打第一针所产生的中和抗体浓度几乎和不打无异。而我们国家虽然之前已经公布,全国累计接种疫苗超10亿剂,但这个数字只是总剂量,具体有多少比例是完成了全程注射的还不清楚。所以之前有部分地区,规定优先满足第二针疫苗的注射,应该也是出于对此的考虑。

所以在此基础上,接下来的防疫任务可能会进一步的加重,一旦发现有Delta变异株规模化的流行,流行病学调查,核酸检测频次可能都要指数级加量。另外,可能新一代疫苗的研发,也已经在路上了。

目前我国,完整接种疫苗的人数在2.3亿的样子

参考

  1. ^ https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2108891
  2. ^ https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.09.451732v1
  3. ^ https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-cases-of-variant-b-1-617-the-indian-variant-being-investigated-in-the-uk/
  4. ^ https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk
  5. ^ Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (April 2021). "Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016". Cell Reports Medicine. 2 (4): 100255. doi:10.1016/j.xcrm.2021.100255. PMC 8020059
  6. ^ https://www.sciencemediacentre.org/expert-reaction-to-vui-21apr-02-b-1-617-2-being-classified-by-phe-as-a-variant-of-concern/?cli_action=1621097773.028

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看了很多回答,笑得肚子疼,其实漫威黑点主要集中在妇联,什么瓦坎达振金西瓜刀烧火棍,全场掉线的美军和全场在线的NYPD,超英反派全员蜜汁战力波动,等等,其实就是这种合集电影的通病,就是非要把设定不同的几个世界凑到一部电影里演大戏,必然会出现的问题

妇联这是典型的关公战秦琼,美队是生化加强人,他能打的反派也只能是冬兵红骷髅这种加强版或改造版人类,连钢铁侠这种时间线世界观跟美队差不多的,里面的反派比如邪恶钢铁人和失控战争机器之类的,美队都对付不了,为了把他俩凑一个team打共同boss,要么削钢铁侠,要么加强美队,然后鹰眼寡妇这类跟美队差不多水平,绿巨人是美队加强版,可以手撕坦克,到没啥问题,然后蚁人出现,把科技背景下的穿越时空量子玄学概念带进来了,这时候钢铁侠的科技就不够用了,于是只能把蚁人的地毯民科也加进电影,因为哪怕是灭霸银护位面的科技设定也搞不定蚁人位面的民科,接着看女巫。。。其实和法师可以合在一起,已经引入了魔法的设定,魔法,最大的特征就是不科学,什么瞬间转移、预测未来、隔空移物等等,想跟美队钢铁侠蚁人这帮打起来就是导弹机枪大爆炸的英雄一起搞,那就只能给反派也加点魔幻魔法的能力,不然根本不够打,没有还手之力

在接着,银河护卫队也来了,他们的科技设定,属于未来派,是宇宙战舰满天飞、激光飞舞、星际旅行说走就走的位面,好吧,反派不仅要有魔法能力,还得在科技上赶上星际旅行这级别的,一下子又甩开了钢铁侠这类的,没办法,只能削boss,设定成反派可以星际旅行,但攻击手段的科技含量依然属于钢铁侠位面的,再再再接着,雷神也要进来,这下,连神话传说都出现了,神话传说什么特点,就是比魔法更加不科学,肉身傲游太空、锤子打雷、恒星打铁这种设定已经是玄幻了。。。。

于是,能有资格被这个阵容打的反派,就变成了灭霸,表现为肉体单挑绿巨人加美队加寡妇等等,科技方面带着宇宙战舰能屠了半个银河系,魔法方面则套了个手套代不同石头就能有不同属性的bug,打对应的英雄一定会使用对应的手段,考试绝不超纲

直到惊奇队长也掺和进来了。。。其实我觉得干脆把惊奇队长黑化一下做反派好像更合适?!


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