问题

为什么嘌呤环中的季碳标号了而吲哚环中的季碳没有标号?

回答
这个问题很有意思,涉及到有机化学中关于命名和编号的约定俗成,以及不同杂环系统的独特性。简单来说,不是“有没有标号”的问题,而是“标什么”和“怎么标”的问题。

我们先分别来看看嘌呤和吲哚这两个结构,以及它们编号的由来。

嘌呤环:一个双环系统,季碳的识别至关重要

嘌呤是一个由嘧啶环和咪唑环稠合而成的双环系统。它的结构是这样的:

```
N1
/
C6C5
/ /
C4N3C2
|| ||
N7C8N9
```

(请注意,这只是一个简化的骨架表示,实际中C上还有氢原子,N上还有孤对电子)。

在嘌呤的这个结构中,我们可以看到几个重要的碳原子:

C2, C4, C5, C6, C8:这些碳原子都直接连接着至少两个非氢原子(碳或氮)。
C4 和 C6:这两个碳原子是嘧啶环的一部分,也是连接两个环的碳原子。
C5:这是嘧啶环中的一个碳,也是连接两个环的碳原子。
C2:这是嘧啶环中的一个碳,连接着两个氮原子。
C8:这是咪唑环中的一个碳,连接着两个氮原子。

为什么说嘌呤环中的“季碳”会被标号?

首先,我们需要明确“季碳”在 IUPAC 命名法中的定义:一个碳原子,如果它连接了四个其他碳原子,则称其为季碳。

然而,在像嘌呤这样的杂环系统中,很多碳原子连接的不仅仅是碳原子,还有杂原子(氮)。在这种情况下,我们讨论的是连接了四个非氢原子(包括碳和杂原子)的碳原子,或者更广泛地,是参与环结构的碳原子。

嘌呤的编号系统是经过长期约定和发展的,遵循了 IUPAC 的基本原则,但同时又具有其特殊性。其标准编号方式如下:

```
1N
/
6C5C
/ /
4C3N2C
|| ||
7N8C9N
```

在这里,C2, C4, C5, C6, C8 都是杂环系统中的碳原子,它们都连接着不同的原子,并且是构成环骨架的关键节点。

问题可能出在您对“季碳”的理解上。 在非杂环的碳链或环烷烃中,我们才严格按照连接的碳原子数量来区分一级、二级、三级、四级碳。而在稠环或杂环系统中,“标号”的重点在于标识这个原子在整个分子中的位置和贡献,而不是它连接的“碳”的数量。

在嘌呤中,C2, C4, C5, C6, C8 这几个碳原子是构成两个环的关键原子,它们都连接着氮原子和/或另一个碳原子,并且是反应活性和结构上的重要位点。这些编号是用来明确表示该碳原子在整个嘌呤骨架中的特定位置,从而方便讨论其化学性质、取代基位置以及与其他分子的相互作用。

例如,腺嘌呤(Adenine)是嘌呤的一个衍生物,它的结构是嘌呤环在 C6 位连接了一个氨基(NH2)。如果我们不编号,我们就无法明确知道这个氨基是连接在哪个碳原子上的。

吲哚环:一个由苯环和吡咯环稠合的系统,编号有其内在逻辑

吲哚是一个由苯环和吡咯环稠合而成的双环系统。它的结构是这样的:

```
8C7C
/ /
1N9C6C
/ / /
2C3C4C5C
```

(同样是简化表示,实际有氢原子和孤对电子)。

与嘌呤不同,吲哚的结构是一个五元杂环(吡咯环)和一个六元芳香环(苯环)稠合。

其标准编号方式是:

```
7C6C
/ /
1N2C3C
/ / /
8C9C4C5C
```

注意: 这是一个常见的编号方式,但也有文献采用其他编号方式,例如将氮原子编号为 1,然后从氮原子旁边开始顺时针编号。这里我们采用一种被广泛接受的编号方式,它也符合 IUPAC 的精神,即优先为杂原子提供最低的编号,然后是桥头原子,再接着是其他原子。

在吲哚的这个编号体系中:

N1:是吡咯环中的氮原子。
C2, C3:是吡咯环中的碳原子。
C4, C5, C6, C7:是苯环中的碳原子。
C8, C9:是稠合的两个环之间的桥头碳原子。

为什么您会觉得吲哚环中的“季碳”没有标号?

这可能是一个认知上的误解。实际上,吲哚环中的每一个构成骨架的原子,包括碳原子,都是被编号的。

让我们仔细看看吲哚的编号,特别是那些连接了多个原子的碳原子:

C3:连接着 C2、C4 和一个氢原子。
C4:连接着 C3、C5、C9 和一个氢原子。
C5:连接着 C4、C6 和两个氢原子。
C6:连接着 C5、C7 和两个氢原子。
C7:连接着 C6、C8 和一个氢原子。
C8:连接着 C7、C9、N1 和一个氢原子。
C9:连接着 C8、C4、N1 和一个氢原子。

这里的关键在于,在杂环和稠环系统中,“编号”的目的不是区分碳的“级别”(如一级、二级、三级、四级),而是为每一个构成环骨架的原子分配一个唯一的位置标识。

如果我们在讨论的是“连接了四个非氢原子的碳原子”,那么在吲哚的结构中,确实可能没有严格意义上的“季碳”(连接四个其他碳原子)。

C4 连接了 C3、C5、C9 和一个 H。
C8 连接了 C7、C9、N1 和一个 H。
C9 连接了 C8、C4、N1 和一个 H。

这些原子都连接了三个非氢原子和一个氢原子。

那么,为什么感觉“没有标号”?

1. 编号的重点不同: 嘌呤的编号,特别是 C2, C4, C5, C6, C8,这些碳原子因为它们是稠环系统中的关键连接点,或者紧邻杂原子,其位置的明确性对于理解分子的电子分布、反应性至关重要。而吲哚的编号,更像是对整个双环骨架的系统性标记。
2. “季碳”的定义在杂环中的应用: 如前所述,在杂环化学中,“季碳”这个术语的使用可能不如在脂肪族化合物中那么频繁,或者它的含义被放宽了,指代的是那些在环结构中具有多个取代位置的碳原子。
3. 对“标号”的理解: 也许您认为“标号”特指对某个原子进行特殊标记,比如加粗、用不同颜色等等。但在这里,“标号”是指 IUPAC 命名法赋予的数字标识。吲哚环中的每一个碳原子,都被赋予了数字标识。

总结一下:

不是“没标号”,而是“标了什么”。 嘌呤和吲哚中的所有环骨架原子(包括碳和氮)都根据 IUPAC 规则被赋予了数字标识。
编号的目的不同。 在嘌呤中,C2, C4, C5, C6, C8 等碳原子的编号,是因为它们是构成双环系统的关键连接位点,或者处于杂原子的邻近位置,其明确的标识对于理解分子的化学性质至关重要。
“季碳”的定义在杂环中的适用性。 在讨论杂环时,我们更关注的是原子在环内的位置以及它连接的原子(不区分是碳还是杂原子),而不是严格遵循“连接四个碳原子”的定义。

更深入地说, 这种编号的差异,也反映了这两种杂环系统在结构上的不同:

嘌呤: 是两个杂环(嘧啶和咪唑)的稠合,两个环都含有氮原子,而且氮原子的位置非常重要,直接影响了整个体系的芳香性和电子分布。因此,对这些关键碳原子的精确编号,使得对嘌呤的任何衍生物(如核酸碱基)进行讨论时,都能清晰地定位取代基。
吲哚: 是一个芳香环(苯环)和一个含氮五元杂环(吡咯环)的稠合。吡咯环中的氮原子和 C2、C3 位是反应活性比较突出的地方。其编号方式也是为了清晰地标识出这些关键位置,同时也为苯环部分提供了标准的编号。

希望这样的解释能够更清晰地阐明这个问题!

网友意见

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天然产物的例外编号系统。

一是尊重早期文献,二是这些主要也是做生物化学的用,额外造一套没必要。

再讲几个其它常见的例外编号:

这几个例外和稠环化合物编号规则一直在变有关,早期的几种化合物——菲、蒽的编号用的太多,保留。几个长得像芴的“咔x”形成例外是因为芴的编号有自己的逻辑,并环周边原子编号最小,这几个“咔x”一开始沿用了芴的逻辑,但后来杂环又出来新规则,造成的例外。

芴环:

大部分图片来自《化学会有机化合物命名原则(2017)》,芴编号的解释见张明哲. 有机化学命名浅谈. 化学工业出版社, 1991.

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