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如何看待 Nature 上刊文宣称很多科学家缺乏统计学知识? 第1页

  

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我想认真的回答一下这个问题:

一、很大一部分生命科学领域科研工作者确实缺乏必要的统计学意识

生命科学是由一个定性的研究领域发展过来的,所以在很长的一段时间内,统计学在其中的应用既不广泛也不深入。而现在的相关专业课程设置中,统计学的重要性也并没有被突出,所以在真正接触到有较深统计学需求的实际研究前,一个科研人员往往很难具有充分的统计学训练。

生命科学领域科研工作者欠缺的不仅仅是统计学常识,更重要的是缺乏统计学意识。比如u检验、t检验、秩和检验大家都学过,正态分布也学过,但一个简简单单的两组差异比较,很多人不会想到需要先看样本分布,再决定用参数检验还是非参数检验,而是简单粗暴的用上自己最熟悉的 t 检验(经几位专业人士提醒,这里额外提醒一下避免误导,t 检验要求来自两个独立同分布总体的数据,正态只是其中的特殊情况,具体见匿名用户答案及

@朱可昊

在本答案下的讨论),这就是意识问题。

二、这种缺乏在特定问题上容易造成假阳性结果

在一些问题的解读上,很多人由于缺乏统计学意识,往往想不到需要去做某些处理,恶果就是假阳性结果。上文中有同学提到的多重比较(multiple comparison)问题就是最经典的案例。这也是目前流毒最广的一个问题,比如很多人外包给公司做芯片数据,而公司很不负责任的给一个p<0.05的表,很多人就拿着这些显著的基因去做后续实验去了(比如从中挑选自己觉得有兴趣的做功能验证),他们根本想不到,两组数据 50000对 t 检验,就算两组数据来自同一样本,也会有2500个p<0.05的假阳性,自然也就想不到在做后续验证前,还需要先在公司给的3000多个p<0.05的探针中筛一遍。

三、统计学对绝大多数的生命科学数据并没有特别重要的意义

正如

@若目田修远

说的,大多数情况下,只需要定性实验结果就足够了,对于目前生命科学领域的很多分支学科确实如此。确实没有必要为统计而统计,举个例子,曾经有好几个人问我有没有计算Western Blot条带强度的软件,有倒是有啊,且不说功能齐全的Image J,光用个PS就能解决问题,可是完全没有意义啊。两个条带看起来就一深一浅,你统计亮度有显著性差异不是多此一举吗,两个条带看起来差不多,稍微有点差异,你统计完说p<0.05,我觉得只能呵呵了。生命科学研究论文本质上都是在讲故事,故事本身逻辑严谨很重要,但不是每个环节都需要用统计学去证明它的严谨,很多实验就是简简单单有或无的问题,例如 con-focal,例如共沉淀。

四、生命科学领域数据可重复性低的主因不在于统计学上的不严谨,而在于选择性汇报实验结果

我接触到的大多数生命科学的论文,都是用一个个小的结论,通过严谨的逻辑连成一个有一定科学价值的故事。然而我们也知道,这些发表的实验结果背后,还有着大量的未发表的实验结果。由于杂志审稿的偏好性,很多情况下,一篇论文是不能够出现看起来自相矛盾的数据的,但是实际工作中这种情况却并不罕见,很多刚正的学者的选择往往是深入挖掘(运气好能挖到大成果甚至诺奖,但大多数情况却没有什么价值)或者放弃整块结果,而另外很多研究者则会保留和整个故事一致的结果,放弃不一致的结果,虽然损害了一点点的逻辑严谨性,但毕竟守住了不造假的底线,也无法苛责太多。

五、随着生命科学的学科发展,统计学已经越来越重要

小作坊写故事片段,再拼接大论文的做法已经越来越行不通了,看看现在5-10分档的传统生物学论文数据量,简直一年比一年恐怖,如果把实验数据量当这个世界的货币看的话,贬值速度都赶上津巴布韦元了,完全一副夕阳产业的景象。

不会解读高通量结果,现在学术界积累的数以ZB量级的数据对你来说等于零。要么趁这几年生命科学领域投资热潮,尽早转出去做商业化,要么赶紧学好统计,拥抱时代和技术的馈赠。




  

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