台湾专家推断新冠病毒发源于美国，因为美国有全部五个病毒族群，这靠谱吗？

从来都是把台湾政论节目当娱乐版块看的大陆正能量自媒体破天荒地拿台湾节目当科学证据，那必然是因为很靠谱。

呼吁全世界各国加强病毒全基因组检测，越多的数据越接近真相。

首先要说明一点，溯源问题上，主要是讲究证据链和概率，尤其是目前的溯源文章基本上是生信分析，也就是我经常自我调侃的科学算命，主要是一个概率问题。包括版纳所的这篇文章也是我们老同行的作品。

其次，各位要否定我们的研究时候，一定要给出真实可靠的证据，那就是核酸证据，千万别总是想着各种缺乏真实证据的东西，尤其是症状相似这种玄乎的东西。

所以，有一分证据，说一分话。

台湾这个专家的推断，在当前证据下，基本上不成立，至少从流行病学上，台湾专家提到的美国有全部5个病毒株群，很打脸的是，这些人，全是有武汉旅行史或接触过武汉旅行史的。

那个古老的H38，是美国的第一例，他是个回武汉探亲的中国人，

所以，你说武汉到底有多少病毒株没被检测？？？因此，强烈建议武汉继续检测，不过好像没可能了~~~

1，美国的发病晚于中国，且有武汉旅行史

尽管从进化上分析，我们发现美国的和广东的病例说携带的病毒属于较为古老的病毒，但是，这并不能说明病毒是其他地方的，事实上，这两个患者，他们的旅行记录表明 2019 年 12 月底至 2020 年 1 月初都来过武汉，然后他们都是1月份发病的，晚于武汉。所以，流行病学上是在武汉被感染的。上面的研究，只能佐证他们并不是被华南海鲜市场病毒感染的，而是可能来自武汉其他地方的病毒。而这也引出了一个本研究的根本上缺陷——病毒样本不完善。

原文引用了两篇文献，我查了下，如下

广东首例：

They had no history of contact with animals, visits to markets including the Huanan seafood whole sale in Wuhan, or eating game meat in restaurants.——柳叶刀[1]

美国首例：

Although the patient reported that he had not spent time at the Huanan seafood market and reported no known contact with ill persons during his travel to China——新英格兰[2]

2，武汉的问题在于样本太不客观

尽管在这个计算中，武汉个体是非常多的，但是很遗憾的是，不具有统计学上的普遍性

事实上，尽管整个研究选择了93个样本的基因组，是迄今为止发表的关于新型冠状病毒疫情最大规模群体基因组研究，但是，这个研究样本还是不够全面。

武汉样本样品采集时间局限于 2019 年 12 月 24 日和 2020 年 1 月 5 日。而那个时候，当地对于疫情的排查集中在了华南海鲜市场，而样本来自几家定点医院，换句话说，样本取样地不具备统计学上的无偏性，这导致最终的数据分析也必然受到了影响，也就是garbage in，garbage out。

然而根据目前看法，早期患者没有华南海鲜市场接触史

最早报道的病例是12月1日，这个病例并没有华南海鲜市场暴露史，接下来12月10日新增的3例患者，有2例无华南海鲜市场暴露史。换句话，在早期爆发的4例中，有3例都是没有华南海鲜市场暴露史的，这就意味着，最早的源头，应该不是华南海鲜市场。

这意味着，华南海鲜市场不是最早的源头，应该是武汉其他区域，所以，用华南海鲜市场的样本来，从一开始就不是早期样本，自然后续推论也有问题了。

事实上，我们根据广东和美国的病例，可以推测出，武汉本地存在更古老的单倍型H13 和 H38。因此，要想完整的溯源，事实上对武汉后续发病例进行更广泛的基因组检测，这样才能更好地确定真正的源头。

然而，武汉早期提供的样本要求必须有华南海鲜市场接触史：

这意味着，从源头上，武汉就直接把样本给限定了。这种情况下，你哪怕测序1万例，也只能看到从这个地方起源的那些病例，也就是这个图

有啥意义呢？

从华南海鲜市场采样，然后证实这些华南海鲜市场感染的病人是源于华南海鲜市场？这还用核酸验证么？多此一举。

事实上，版纳所文章都给出了一个路线图，目前其他地方的都是从湖北传出去的

最后，

1，不要歪曲版纳所文章，要讨论，也要基于这篇文章。

2，如非必要勿增实体的基本科学逻辑

3，如果有其他想法，欢迎给出【基因】研究证据

4，当然你要是谈非科学之类的问题，那自便

5, 呼吁美国等加大全基因组检测力度，包括对前期疑似病例检测~

1 Chan JF-W, Yuan S, Kok K-H, et al. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novelcoronavirusindicatingperson-to-person transmission: a study of a family cluster. Lancet 2020

2 HolshueML,DeBoltC,LindquistS,etal.FirstCaseof2019NovelCoronavirusinthe United States. N Engl J Med 2020

3 WB Yu et al.Decoding the evolution and transmissions of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) using whole genomic data

一些额外的话，我这个内容只是基于当前的证据，我也认为，当前的研究，证据并不是板上钉钉。

比如各位反复提到的一个问题，美国只检测武汉接触史的病例。然而，从流行病学的角度，这是有一些道理，毕竟新冠疫情是武汉爆出的，其他地方自然也没必要去检测无武汉暴露史的或接触史的。

疫情从A开始，B检测来自于A的个体，发现的确是输入型的，进一步佐证了A的起源。

至于其他地方更早出现的一些肺炎情况，如果不做检测，那么始终只能认为是非新冠肺炎。但是从防疫角度，又没必要对已经发生过的其他肺炎进行检测了。这个就陷入了个循环。

所以只能期望各国继续呼吁更多的基因组序列，然而，这一点，又似乎不单单是个科学问题了~

ps：我的评论区是被官方永久强制开启审核的，我选不了~

我写得可能比台湾节目还早几天。

这个事情目前看是非常可疑。

要实锤，把美国流感死的查查，电子烟死的查查。

把美国或者全世界来一次大规模检测，把病毒版本一列就明白了。

中国有个好处是早封城了，国外版本进不来。

而且，美国陆军传染病实验室到底泄露了什么，美国能不能有人要求解密？

或者有黑客把美国cdc的资料查查

去年8月为什么关闭这个实验室？

这个病毒如果在美国先爆发，来源很可疑。

美国没有中华菊头蝠，实验室才可能有sars病毒做研究。

美国首发的话，病毒源头哪来的？

在等一段时间看看。

虽然美国起源有不小的可能性，但没有证据的推测是不靠谱的。

版纳园的预印本论文只是得出【基因组学证据并不支持华南市场是SARS-CoV-2的发源地，是从其他地方传入的】的结论。

前两个月，大部分感染者与武汉有关，但中国境外的一些感染者可能与广东或其他地方有关。版纳园的预印本论文证据表明，SARS-CoV-2可能在2019年12月之前（可能从11月中下旬开始）已经在武汉的人群中广泛传播。

华南市场尚未被确认为SARS-CoV-2向人类传播的单一来源，武汉市尚未确定其他可能的SARS-CoV-2原始来源。

但可以确定的是，在武汉肺炎爆发的早期阶段，华南市场促进了SARS-CoV-2向人类的传播，之后，SARS-CoV-2迅速传播到全中国和其他国家。

如果能从第一个确认感染者，以及12月初感染者的身上采集到冰冻样本，进行基因组测序进行系统流行病学研究，有助于确定武汉地区SARS-CoV-2的源发地。

同时，版纳园的预印本论文预计，如果今后有更多的样本进行测序，武汉市部分感染患者样本中会发现H13和H38单倍型。

这对于寻找SARS-CoV-2的原始来源非常重要，因为H13和H38都是祖先的单倍型。单倍型进化网络可以在局部范围内恢复人与人之间的传播方向，并在较大范围内传播。

中心型单倍型可以看作是超级铺展型单倍型，顶端型是最新的后代单倍型。利用支路和支路的连接信息可以识别出传输方向。

例如：来自华南市场的确诊患者共享共同的祖先单倍型H1，这表明他们是从共同来源感染的，他们可能是市场上的超级传播者。这种传播现象也可能在深圳与A组患者一起发生，这种方法已经在深圳家庭（H13→H14）、昆士兰旅游团（H25→H26）、英国家庭（H28→H29）和从武汉遣返的日本人（H53→H52）中恢复了特定的人际传播方向。

大多数国际传染病直接或间接与武汉有关，但对其中一些人来说，尚不清楚具体感染地点。

在来自美国的13个基因组中，3个来自华盛顿的同一病人，编码相同的单倍型H38，而另外3个样本编码8个单倍型，涵盖所有5个组，因此输入性感染的来源很复杂。三个单倍型（H1（加利福尼亚州）、H19（威斯康星州）和H38（华盛顿州））与武汉有关，三个单倍型（H19（威斯康星州）、H35（亚利桑那州）、H42（加利福尼亚州）到五个单倍型（H41（加利福尼亚州）和H58（伊利诺斯州））可能与广东有关。其余的单倍型（H36（加利福尼亚州）、H37（加利福尼亚州）和H57（马萨诸塞州））与来自武汉的中国境外患者（H54（越南）和H56（澳大利亚））有关。H15,39目前还不清楚他们是在哪里感染的。这11起案件在美国没有人与人之间传播的证据。

如上所述，研究者发现日本和美国的一些病人可能在广州感染，而法国的一个病人可能在重庆或新加坡感染。研究者怀疑是超级传播者介导了从中国向全球的传播。至少，感染H56和mv2以及H54的人至少有三种单倍型。

版纳园的预印本论文关于和美国有关的部分，有且仅限于以上部分。

版纳园的预印本论文数据具有很大的局限性，数据甚至不足100例，占当前病例的比例太低，稍微扩大化一些数据，就可以得到完全不同的结果。该论文可用的样本不包括第一个确定的感染患者和12月初的其他患者，因此可能会遗漏最常见的祖先单倍型。

该文章的方法和数据缺陷是引发阴谋论的最根本原因。

更多数据可以看看四川大学生命科学学院副教授[石头鱼]的回答：

而关于论文的缺陷，以及如何得到更准确结果，并探讨起源，[石头鱼]也进行了详细的梳理：

当前最大的可能性，无外乎三个地方：武汉、广州（深圳）、美国。

随着研究的深入，疑似起源点，甚至不仅仅这三个地方。

但是，有一个事实无法改变：华南海鲜市场推动了SARS-CoV-2流行和爆发，于2019年12月初将其传播至全市，乃至全国。全球的传播，也和武汉有着极大的关系。

探讨新冠状病毒的起源，在科学和医学上都有非凡的意义，是探讨全球疫情的关键。无端臆测除了煽动舆论之外，对科研成果没有任何的意义。

当前新冠状病毒在全球范围内，已经越来越有大爆发的趋势，这是对全人类的威胁，而不是单单某一个国家。对于他国ZF的处置方式，你可以嘲笑，但不能无视。

美国人没有担当，自毁长城而已。

我国历来有大国风范，我们需要的是真相和真正的科学精神，望台湾省同胞同心共气。