大脑为什么自己不明白自己的工作机理呢？
1. 结构与功能的极度复杂性，超越了直观理解的边界。
想象一下，大脑不是一个简单的齿轮组，你可以拆开来看，数数有几颗牙，它们的啮合方式是什么。它是一个由数千亿个神经元组成的巨型网络，每个神经元又连接着成千上万的另一个神经元。这些连接不是固定的，而是不断变化、重塑的。信息在其中以电化学信号的形式传递，速度快到难以想象，而且是以一种高度分布式的方式进行。
这种复杂性，就好比试图理解一个庞大城市的交通系统，仅仅通过站在一个路口是无法掌握全局的。你需要的是全局的地图、实时的监控，甚至还需要模型来预测拥堵情况。而大脑的“地图”和“监控”我们才刚刚开始绘制和建立。我们知道有不同的大脑区域负责不同的功能——视觉皮层处理图像，听觉皮层处理声音，前额叶皮层负责决策和规划——但这些区域之间是如何协同工作，如何将孤立的信息整合成连贯的意识和思想，这中间的“胶水”和“流程”仍然是巨大的谜团。
2. “旁观者效应”：我们是观察者，也是被观察者，但两者之间存在根本的鸿沟。
我们的大脑是观察和理解世界的主体，它负责接收外部信息，进行分析、判断、记忆、学习，并最终产生行为和思想。但是，当它试图反过来观察和理解自身时，就出现了一个关键问题：主体和客体之间的分离。
就好像你要用眼睛看到自己的眼睛一样，这是不可能的。我们需要镜子，或者通过其他人的描述来了解自己的外貌。同理，大脑也需要借助外部的工具和方法来“看见”自己。这些工具包括脑成像技术（如 fMRI, EEG），它们就像是给大脑拍的照片或录下的视频，让我们看到哪些区域在活动，但并不能完全揭示其运作的微观细节和动态过程。
更深层次的是，我们的大脑是通过“感受”和“体验”来运作的。喜悦、悲伤、思考、记忆，这些都是大脑活动的内在结果。而当大脑试图去“分析”这些内在结果时，它是在用一种由这些结果本身塑造的方式去分析。这就好比用一套由猫咪行为产生的规则去解释猫咪的行为——你只能看到表面的模式，而难以触及猫咪内心的动机和神经网络的运转。我们的大脑天生就更擅长处理外部世界的信息，而不是对自身进行递归式的、彻底的自我解析。
3. 意识的“黑箱”：它是一个涌现的现象，难以从底层机制中直接推导。
我们最想理解的，往往是我们作为“我”的那个感受，那个意识。而意识，很可能是大脑中数千亿神经元相互作用、信息高度融合后涌现出来的复杂属性。这种涌现性意味着，即使你完全了解了每一个神经元的行为模式，也未必能直接推导出整体的意识体验是如何产生的。
这就像你了解了构成水的每一个氢原子和氧原子，知道它们如何结合成水分子，但你仍然难以从这些基础知识直接推导出“水的清凉感”、“水的流动性”这些宏观属性。意识的产生，可能是大脑这个系统本身为了处理信息、做出决策、适应环境而发展出来的一种高效的组织方式，但它的具体机制，它的“是什么”，仍然是科学界最深刻的未解之谜之一。
因此，大脑自己无法“明白”自己的工作机理，并非是它“不愿意”或者“懒惰”，而是因为它本身的运作方式——极度的复杂性、信息传递的微妙性、以及意识这样一种涌现现象——使得它自身成为了一个极其难以被自身完全洞察的领域。我们只能像一个勤奋的学生，借助各种先进的工具和方法，一点点地去逼近这个答案，去理解我们这位最亲密的伙伴。这本身也是大脑孜孜不倦的追求，不是吗？
网友意见
大脑当然能明白自己的工作机理，不明白的是你自己的意识罢了。
比起整个大脑的功能，你意识的权限低得相当令人发指。
你的意识权限仅仅在神经网络上，神经系统把你的感知死死限制在了对外界信息的获取和处理过程中。
你可以通过你眼、耳、口、鼻、舌、皮肤等外界感受器，获取大街上的帅哥美女信息，想一想今天晚上吃些什么，然后再刷刷知乎，逛逛小破站。
但你的意识绝对不能主观控制心跳，控制肠胃的蠕动，肝脏的运行，控制血管的收缩舒张……
当然，你的意识更不能指导每一个神经元的运转。
由于你的意识权限仅仅被限制在神经网络之中，你甚至不知道神经元本身的存在（如果你没有接受过现代科学的教育的话）。
你以为自己的意识是身体或者大脑的主人。
但你可知道，当你还在妈妈肚子里的前两个月，你根本没有任何的意识。
你以为的“你”根本就不存在。
但你的身体，依旧按照DNA编码的规则，按部就班的发育着。
你的神经系统，在孕龄的第一个月底才开始发育，到第三个月才有了雏形。
但一开始你也根本没有任何的意识。
随着孕龄的增大， 你听觉、味觉、触觉等感知系统的发育逐渐完善后，你的大脑才能建立足够多的神经网络，让你产生意识。
但一开始你的意识，不仅十分的短暂，就像幻灯片一样，而且还没有什么思维逻辑能力。
不说你是否明白大脑自己的工作机理了，但凡你能知道自己是谁，那都会被人认为是活佛转世了。
你出生后，随着你接收到的信息越来越多，意识也逐渐成型，你会在1岁左右知道自己是谁。两三岁的时候，才开始懵懵懂懂的认知你接触到的事物。
但这个时候，你的神经系统，却开始对你大脑的神经网络，进行大开大合的手术了。
当然这个“手术”有专门的术语，叫做突触修剪。
在你成长的过程中，一部分神经元会程序性凋亡，一半的突触链接会被修剪掉。
突触是神经元传递信息的关键部位，保证着神经元对信息的传递、加工，以及存储。
它是神经活动的基础，也决定了你的学习和记忆。
2岁的你，有着此生最为丰富的神经网络，你的思维和意识也是此生最为天马行空和跳脱的阶段。
但随着突触的修建，你也逐渐变得老实了（更加富有逻辑思维）。
因为在突触修剪的过程中，你的前额叶也会被修剪，你可以理解这是自然生理版的低配前额叶手术。
从本质上来说，突触的修剪过程，就是对你意识的塑造过程。
你积极的理解，可以认为这是大脑逐渐塑造新生自己的过程。
如果你悲观的理解，可以认为是大脑逐渐杀死过去你自己的过程。
是吧！你不仅没有任何的权限获取你大脑结构、神经元的任何信息，甚至神经系统还能对你“任意”的切割整合。
你总是能主观的控制自己的躯体和自由运动，于是你觉得自己对身体有着绝对的掌控权。但其实你能驱使的也就是部分运动系统罢了。
哪怕你身体内，属于神经元直接管辖之外的那部分的，运转也依靠各种激素、神经递质、调节蛋白等等，和你的意识无关。
你身体的所有微观部分都按部就班的工作着，但你的意识仅仅被束之高阁，没有任何的权限管理。
现在你知道了吧：
意识≠大脑
你只是大脑在不断接受和整合外部信息时，逐渐形成的一种特殊的映射。
某种意义上来说，你身体的每一个细胞，都可以算是生命个体。
它们通过复杂的分工合作，搭建成了一个完整的人体。
而你这个现在正在思考的意识，仅仅只是神经元互相协作下产生的。
它们才是真正的主人。
你才是想要反客为主的那一位。
PS：如果某一个星球存在一种生命，它们演化出神经系统后，逐渐向高等生物演化的整个过程中，身体内所有的生化反应都会记录在突触连接中，并像DNA那样一代代的传承。那么这个生物进化成高等意识的生命体之后，便有可能知道自己身体和大脑工作的机理。
至少从碳基生命的角度来说，这样的高等生命是不存在的，因为这样的大脑会记录海量的信息，大脑的耗能就把这种生命给耗灭绝了。
目前看来，人脑是长期的自然选择塑造的复杂系统，研究局部难以预测其涌现的行为和特性，在计算上难以模拟。人们还没有给组成人脑的细胞、组成这些细胞的亚显微结构、组成这些结构的粒子建起让人满意的模型，对“这些细胞的相互作用及其对整个系统的影响”建模有内在的困难、对初始条件极其敏感，“人脑缺少精确感知自己状态的机制”更加大了实验的难度。
而且，在当前条件下，让人“明白自己的工作机理”在本质上是不可能的。
你我其实都不知道关于世界和自身的任何“绝对正确的真理”，感官输入的一切信息都是可疑的。只是“目前看来，我们没办法从这状况中逃出去”，让我们姑且相信“世界是存在的、自身是存在的、自身是个人、人有个大脑、大脑里有许多神经细胞”之类消息。
通过任何仪器看到的自己大脑的外观、解剖结构、显微结构，是“暂时没被推翻的知识”。
科学理论是人们构筑的模型，处于“暂时没被证伪”的状态。
所以，会出现这个问题，直接原因是“你不满足于当前的模型”。一般认为这是一件好事。
事物的“工作机理”，哪怕是“飞机是怎么飞起来的”“自行车如何保持平衡”这样“看上去很直观的物体运动规律”，我们都没有搞明白，只是“目前看来这些东西和相关的理论可以用”，例如空气动力学至少可以在一定范围内指导飞机的设计、提高飞行效率或性能。
当前关于人脑的知识也是这样，可以参照：
观察时间延长、工具改进、实验方法变化、材料进步等等都有可能让人们“发现新的现象”或“注意到过去没注意到的现象”，然后更改模型。
古人建立的“看不见的灵魂在控制人的行为与情感”的模型至今还是有人在用，满足于这种模型的人就可以不纠结于“大脑的工作机理”：神经无非是灵魂操控身体用的一堆线路，换成提线木偶的丝线、黏土之类，乃至让灵魂脱离身体独立存在，感觉也差不多吧。
你可以追溯到“看起来，在地球生物演化的历史上，从没有一种生物明白自己的工作机理”。即便在实在论的范围内，人类“白手起家”研究世界和自身的构造与运动规律，投入的时间和人力物力跟“尚未搞明白的问题”的规模比起来差得远，理所当然有一些问题不懂。
- 就不用说大脑了，你想想你明白自己身上的其它细胞的工作机理么。
- 你说说细胞里的细胞器“穹隆体”（你身体里也有）是做什么的。
- 你不知道是很正常的，2021 年现在没有人知道。它可能参与了蛋白质合成、从细胞核到细胞质的物质转运、作为脂质筏的一部分对抗病原体，似乎还能帮助癌细胞对抗化疗。
- 穹隆体在真核生物中普遍存在且结构保守，但是在发现穹隆体之前就被作为模式生物的秀丽隐杆线虫、黑腹果蝇、拟南芥、酿酒酵母没有穹隆体。
我理论层面思考过这个问题，我猜测是，可能是你想着想着，就忘记自己处理到哪一步了。
假设有 n 个节点，每个节点记忆容量是 k，每次大脑处理某个问题，都会产生一个 snapshot， 是一个 n 维的 array，[0，4，2，1，....] 这种，自由组合产生可以被分辨的状态数量，最大是 k^n，也就是这种数组个数有 k^n 个。
假设人类最强大脑，可以命令这 n 个节点，遍历搜索这 k^n 个状态，在 P(n) 多项式时间内，找到更加接近目标答案的状态，这就是让每个节点处理 k^n / n 个元素，并且每次都是执行一个 n 维数组和某个东西是否相似的问题，要求时间复杂度是多项式的话，且单个节点显然无法存下所有 array，只能递归调用，把上一轮的比较答案记录下来给下次使用，并把自己的状态回滚到初始化状态，每个节点的空间复杂度最少就需要 log(k^n / n) 这种级别缓存状态。
但是 n 很大的时候，k < log(k^n / n)，所以你发现脑容量一直不够。你的大脑处理到一半，突破脑容量，自行清理缓存然后失忆，导致你无法很好回溯清楚自己处理到那一步了。
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