如何看待南非新冠病毒 501.v2 型可能出现免疫逃脱的现象？这会导致疫苗或者现有的免疫疗法失效吗？
什么是“免疫逃脱”？
咱们先弄明白这个概念。新冠病毒，说白了，是个外来户，它进入咱们身体后，免疫系统就会认出它，然后发动攻击，产生抗体和T细胞来对付它。这些抗体呢，就像是“通缉令”，专门锁定了病毒表面的关键部位，比如那个刺突蛋白（Spike protein），然后让免疫细胞去清除病毒。
“免疫逃脱”的意思就是，病毒通过基因变异，把自己的“样子”改了改，特别是那个被免疫系统“盯上”的刺突蛋白，它上头的识别标记（抗原决定簇）变了。这就好比，通缉令上的照片和现在的样子对不上号了，免疫系统一下子就认不出它来了，或者识别和结合能力大大下降。原本有效的抗体，现在可能就没那么管用了，病毒也就更容易逃脱免疫系统的追捕，重新感染或者突破已经产生的免疫。
501.v2（Beta 变异株）的“免疫逃脱”是怎么回事？
南非在2020年底发现 501.v2，很快就引起了科学家的警觉，主要是因为它出现了一些关键性的氨基酸突变，特别是在刺突蛋白的受体结合域（RBD）和N端结构域（NTD）等区域。这些区域正是抗体最常识别和结合的地方。
关键突变： 501.v2 携带了多达10个突变，其中有几个特别值得关注，比如 E484K、K417N 和 N501Y。
E484K 突变： 这个突变可以说是“明星突变”了，它位于RBD的关键位置，对刺突蛋白与人体ACE2受体结合的能力影响不大，但却对中和抗体的结合有显著影响。很多研究表明，E484K 能够削弱甚至“逃脱”由先前感染或接种疫苗产生的大部分抗体的结合能力。
K417N 突变： 这个突变也影响了刺突蛋白与ACE2的结合，并且也可能影响抗体的结合。
N501Y 突变： 这个突变则主要影响了病毒与ACE2受体的结合亲和力，被认为有助于病毒更有效地传播。
证据： 最初的观察是，在南非，501.v2 出现后，病例数迅速攀升，而且有证据表明，之前感染过其他新冠病毒株的人，再次感染 501.v2 的风险似乎有所增加。同时，实验室研究也开始显示，从感染者或疫苗接种者体内提取的抗体，对 501.v2 的中和能力有所下降。
这会导致疫苗或者现有的免疫疗法失效吗？
这确实是大家最关心的问题，也是最令人担忧的一点。答案是：不是完全失效，但效力可能会打折扣，而且效果的下降程度需要具体分析。
1. 对疫苗的影响：
灭活疫苗和腺病毒载体疫苗： 这类疫苗通常包含完整的刺突蛋白或者其一部分，诱导产生的抗体是针对多个位点的。尽管 501.v2 的突变可能会削弱其中一部分抗体的效力，但其他位点的抗体仍然可能发挥作用，尤其是在阻止病毒进入细胞方面。因此，这些疫苗可能在预防重症和死亡方面仍然保持较高的有效性，但在预防感染和轻症方面，有效性可能会有所下降。
mRNA 疫苗： mRNA 疫苗也是通过提供刺突蛋白的遗传指令，让身体自身产生刺突蛋白来诱导免疫。理论上，与灭活疫苗类似，对 mRNA 疫苗的抗体也可能受到 501.v2 突变的影响。但 mRNA 技术的优势在于其灵活性，如果未来证明现有疫苗效力明显下降，可以相对较快地更新疫苗株。
实际观察： 现实世界的数据是最好的说明。在 501.v2 流行期间，一些大型研究显示，已接种疫苗的人群仍然能得到很好的保护，尤其是对重症和死亡的预防。例如，针对辉瑞和阿斯利康疫苗的研究表明，它们对预防有症状感染的有效性有所下降，但对预防住院和死亡的保护作用依然非常强劲。
2. 对现有免疫疗法的影响：
单克隆抗体疗法： 这是受影响可能最大的地方。许多早期研发的单克隆抗体疗法，其靶点就是刺突蛋白的特定区域，甚至是 501.v2 发生突变的那个区域。如果病毒的关键识别位点发生了变化，那么针对这些位点设计的抗体，其结合能力和中和能力就会显著下降，甚至可能完全失效。
实际情况： 确实，在 501.v2 出现后，一些针对特定位点设计的单克隆抗体被发现对该变异株的活性大大降低，甚至被认为无效。这也是为什么医药公司需要不断评估和开发新的单克隆抗体，来应对层出不穷的病毒变异。
为什么会出现“免疫逃脱”？
病毒变异是个自然过程，新冠病毒也不例外。驱动病毒变异的因素有很多：
病毒复制过程中的随机错误： RNA 病毒在复制时，其基因组很容易出错，这些错误就是突变。
自然选择的压力： 如果某个突变让病毒在传播或逃避免疫方面更有优势，那么这个突变就更容易在人群中传播开来，成为优势株。 501.v2 的出现，很可能就是自然选择的结果。在存在大量感染者的情况下，那些能稍微逃脱一点免疫反应的病毒，就有机会繁殖更多后代，从而在竞争中胜出。
长期慢性感染： 一些研究推测，在免疫功能低下的人群中，病毒可能长期存在并复制，这为病毒提供了更多的时间和机会来发生变异，并可能在体内“演化”出更具免疫逃脱能力的亚群。
我们该怎么办？
501.v2 的出现，以及后续出现的其他变异株（如 Delta、Omicron 等），都给全球疫情防控带来了新的挑战，也给我们敲响了警钟：
1. 持续的病毒基因组监测： 必须保持高度警惕，通过全球合作，持续监测病毒的基因组变化，及时发现新的变异株，评估其传播力、致病性和免疫逃脱能力。
2. 疫苗的更新换代： 就像流感疫苗一样，随着病毒的变异，疫苗可能也需要定期更新，以保持对主流毒株的有效性。这是科学界和制药公司正在努力的方向。
3. “组合拳”式的防控策略： 疫苗仍然是关键，但不能指望疫苗“包打天下”。在疫苗接种的同时，仍然需要坚持戴口罩、保持社交距离、勤洗手等公共卫生措施，这对于减缓病毒传播、降低变异株出现的概率至关重要。
4. 加强对免疫功能低下人群的保护： 这些人群既是病毒变异的高风险人群，也容易因为感染而面临更严重的后果。
5. 对免疫疗法的研发和评估： 需要不断研发新型的、对更广泛变异株有效的免疫疗法，并对现有疗法进行实时评估。
总而言之，501.v2 的“免疫逃脱”现象，并不是说疫苗和免疫疗法就彻底失效了，而是它们的效果可能会打折扣。这是一个持续的“矛”与“盾”的较量过程。科学界正在不断努力，用更先进的技术和更全面的策略来应对这场挑战。我们需要保持冷静，相信科学，同时也要做好长期应对的准备。
网友意见
2月2日，高福院士的研究团队在bioRxiv上发表了一篇关于国药和智飞龙科马两款国产疫苗对于南非新冠突变毒株501Y.V2的逃逸情况验证。
新冠病毒自从全球大流行开始，就产生了好多包括像D614G，以及英国的B.1.1.7还有像南非的501Y.V2等等多种突变毒株，其中最让人担心的是著名的E484K突变，这种突变已经证实对像辉瑞，Moderna和Novavax等疫苗都有一定的抵抗作用。
另有研究显示E484K可能是处于免疫压力之下诱发的新冠病毒的一个新的进化方向。这使得人们对疫苗的保护率产生了担忧。昨天高福院士团队发表的论文显示，包括国药新冠疫苗（BBIBP-CorV ）和智飞龙科马新冠疫苗（ZF2001）对包含E484K的南非501Y.V2毒株的中和能力也有所下降，但是下降幅度远低于康复者血浆和mRNA疫苗的下降幅度。
论文中提到，来自疫苗国药产的新冠疫苗（BBIBP-CorV ）或智飞龙科马生产的新冠疫苗（ZF2001）接种者的24种抗血清，针对原始的新冠病毒，以及D614突变和南非501Y.V2突变均保留了相当从程度的中合作用。与对原始新冠毒株或D614G突变毒株的滴度相比，几何平均滴度（GMT）略有降低。 对于ZF2001，GMT下降了1.6倍，从106.1（95％CI，75.0-150.1）下降到66.6（95％CI，51.0-86.9）。 而对于BBIBP-CorV，下降幅度也为1.6倍，GMT从110.9（95％CI，76.7-160.2）降至70.9（95％CI，50.8-98.8）。
这一数据，明显优于先前报道的恢复期血浆超过10倍降幅，也优于自mRNA疫苗接受者的抗血清的6倍降幅。
上图是两种疫苗接种者的12份样本针对三种突变病毒的50%中和详细数据。
总结一下，就是国药和智飞龙科马的疫苗对于南非的新冠突变毒株501Y.V2依然保留了较好的中和能力，比mRNA疫苗要好不少。
疫苗不是万能的，必须与防控措施协同使用才有决定性效果。不防控突变速度会很快，很可能导致疫苗失效。
一，消极防控下突变概率会大幅度提高
1.突变的影响
病毒的突变(Mutation)是指基因组中核酸碱基的化学变化。在一次感染中，一个病毒粒子要增殖上百万次，增殖过程中复制发生异常就会造成突变，可以是一个核苷酸的改变，也可为上百上千个核苷酸的缺失或易位突变是概率事件。
新冠属于RNA病毒，RNA病毒不稳定，病毒复制中的自然突变率 ～ 。
在绝大多数情况下，突变会导致病毒死亡。如果病毒突变后可以存活，有的基因突变对病毒没有显著影响，在一些情况下病毒会获得性状改变，如传播能力的变化、致病性的变化、对环境耐受力的变化等等。
2.病毒种群越大、感染时间越长则突变概率越大
（1）种群很大会增大变异概率。
假设病毒在某个患者体内出现可存活变异的几率为，则对于一个数量为n的宿主群体，病毒发生可存活变异的概率为 。即使为很低，只要n足够大， 就趋近于1。
（2）感染时间长有利于突变
俄罗斯女子体内发现18种变异新冠病毒。西伯利亚联邦大学基因组学与生物信息学系教授康斯坦丁·克鲁托夫斯基指出，这项研究工作首次确认了一个事实，即“新冠病毒在一个生物体内长期存在即会导致大量突变的出现”。[1]
3.数据计算
以上分析可以得到病毒总体突变概率和病毒种群数量（感染人数*人均带毒量）和感染时间相关，可以得到
P（病毒突变概率）=f（（患者数量*患者平均感染持续时间*患者平均带毒数量），）
另外如果一个患者在完全隔离的环境下被治愈（完全清除病毒），则他体内的突变病毒就被“闷死”了。
P（突变流行概率）=P（病毒突变概率）*（1-P（患者无法传染给下一个健康人的概率））
所以
P（突变流行概率）=f（（患者数量*患者平均感染持续时间*患者平均带毒数量）， ）*（1-P（患者无法传染给下一个健康人的概率））
4.结论
不积极进行疫情防控的情况下，疫情传播面广，病毒种群大，发生突变的可能性也越大。而由于防控不彻底，突变后的病毒很难在传播开前被消灭，突变很容易传开。
如果进行积极防控，社会上感染人数很少，病毒种群较小，突变可能性低。由于“应收尽收”做得比较彻底，突变后的病毒可能传播不开。
二、选择压会选出更适应环境的病毒
自然界中生物个体都有遗传和变异的特性，只有那些具有有利变异的个体，在生存斗争中才容易生存下来，并将这些变异遗传给下一代，而具有不利变异的个体被淘汰。
选择压是进化生态学中的概念，就是指外界环境施加给物种演化方向的压力，不同的外在的压力导致物种向不同方向演化。
假如：一个基因的选择压为0.001，那么一个频率为0.00001的显性基因只要23400个世代就可增加到0.99的频率。
在自然界，当选择压高的时候，在短时期中就可以形成新的品种。
例如在青霉素发明的时候，细菌普遍没有耐药性，在普遍使用抗生素的环境中，少数可以耐药的细菌被筛选出来，成为主流。
“物竞天择、适者生存”。如果某病毒具备能适应环境的特征，传播速度就会显著加快，从而占据主要比例。
三、传染性较强的毒株在选择压下胜出
研究人员对休斯顿地区两波疫情中的新型冠状病毒结构进行研究发现，一种更具传染性的新冠毒株正主导着最近该地区的疫情。
在第二波疫情中，休斯顿地区99.9%的新冠感染病例都携带这种被称为D614G的变异毒株。D614G指的是在编码刺突蛋白的基因组区域，一种叫做天冬氨酸（D）的氨基酸取代了一种叫做甘氨酸（G）的氨基酸。研究人员发现，感染这种毒株的患者上呼吸道中的病毒载量明显更高，这表明其传染性更强。
休斯顿地区99.9%的新冠感染病例都携带这种被称为D614G的变异毒株。
研究人员还发现，刺突蛋白（目前正在研制的新冠病毒疫苗的主要靶点）的一些区域出现了几处突变，这可能表明新冠病毒正在发生变化，以逃避人体出现的免疫反应。[2]
四、如果不积极防控，疫苗可能会筛选出耐药品种
这次的N501Y突变似乎不能使大多数中和抗体失效，没有影响到疫苗有效性，是个好消息。
但如果不积极防控，病毒能维持很大的种群，那么病毒会源源不断的产生各种各样的可存活变异，变异毒株具有完全不同的性状。
疫苗属于一种较为极端的选择压，如果有某个变异毒株恰巧有耐药性，在大规模使用某种疫苗的过程中这种毒株很可能被筛选出来，并在广泛传播中成为主流毒株，可能导致已有的某种疫苗失效。
在这种情况下，只能重新研制新的疫苗。
所以，只有积极防控避免广泛传播+疫苗免疫的方式才可能真正结束疫情。
参考
目前来看，之前英国变异体的N501Y主要是增加传染性，但真正的威胁是南非和巴西变异体的E484K突变，这可能是目前全世界疫苗开发遇到的最大挑战。
一
还是先说一点基础的知识，新冠病毒通过其表面的S蛋白（spike protein）与宿主细胞表面的ACE2受体相连，更具体一点讲是S蛋白上的受体结合域（RBD），而N501Y等突变就位于这个受体结合域，这个突变让病毒更容易进入宿主细胞，从广义上说就是病毒的传播力增强。
另外有些朋友可能还是不懂N501Y到底是啥意思。其实病毒的各种生理功能，主要就是通过蛋白质实现的，而大家知道蛋白质是氨基酸构成的，你可以把这个氨基酸序列想象成一长串代码，N501Y表示第501个氨基酸原本应该是N（天冬酰胺），但是突变成了Y（酪氨酸）。
二
YouTube上面昨天有个专家直播值得一看（https://www.youtube.com/watch?v=Ja_tLG8CLAc&feature=youtu.be），教授是Sslim Karim，非常非常牛的传染病专家。他在直播中就讲到E484突变在11份康复者血清样本中的9份降低了抗体结合，一些血清样本的中和能力降低了10倍以上，甚至在一些研究当中，发现有4份康复者血清无法中和E484突变。
可见相比于其他突变，E484突变对于新冠病毒S蛋白RBD的改变是比较大的。E484K将原本带负电荷的氨基酸转换为带正电荷的，就像磁铁反转一样，这可能会改变S蛋白与宿主细胞结合的形状，
更加专业的分析，可以看下子陵和王年爽博士写的微博，我这边就不在赘述，他们写得非常全面。
目前最主要的问题在于疫苗对这些突变体是否还有效。Prof. Karim认为疫苗还是有效的，疫苗的作用是非常复杂的，不只是体液免疫（抗体），还有很重要的细胞免疫（T细胞反应），而后者对于变异体仍然有效。疫苗的广泛接种起到了很关键的作用，降低病例数和住院率，这对于疫情防控来说很重要。
三
所以结合目前所有研究，我们所面临的敌人远比疫情之初想象的可怕：它有大量无症状感染者，我们很难将所有的感染者都找到；它可以冷链运输超远距离传播，使得防控远难于SARS；它的各种突变体接二连三地涌现，不断挑战着疫苗的有效性。
一年前的这个时候，「不会人传人」的美梦被彻底击碎；一年后的今天，我们的疫苗已经问世，创造了人类医学史上的最快速度。但我们不知道的是，第二种、第三种E484突变什么时候会到来。
这种感觉，有点像电影《环太平洋》里一只只怪兽从深海中爬出来。
今天，人类共同的敌人是新冠病毒，而人类唯一的竞争对手，是时间。
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