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不谈别的,就简单说下他们二者的宗教关系吧。
原本波斯穆斯林主体、塔吉克人和帕米尔塔吉克人都信仰逊尼派。
萨满王朝被喀喇汗王朝干掉后,波斯人基本退出中亚地区,强大时期勉强的把影响力投射到土库曼地区,而且还经常处于突厥语部落的轮流坐庄统治。萨法维王朝在什叶派12伊玛目派的大力支持下坐上波斯王位,境内传播本派理念,因此伊朗(包括阿富汗的部分呼罗珊地区)波斯人基本改为12伊玛目派(伊朗在阿巴斯王朝时期就已经什叶派和逊尼派并列),并且让南部其他宗教的波斯人全面伊斯兰化。
所以,塔吉克人和波斯人的同步性被打破,塔吉克人北部跟中亚察合台语族群、南塔吉克人跟阿富汗人保持文化发展的同步。伊朗人改教派时塔吉克人处于中亚的各突厥语政权统治下,并没有跟波斯人同步归入什叶派的十二伊玛目派。
帕米尔塔吉克人归入伊斯玛仪派的支系尼扎尔派是近代的结果,阿迦汗起兵夺权失败后逃到英属印地避难,英国人为了加大对呼罗珊地区(伊斯玛仪派大本营)的影响力,大力支持阿迦汗一世。当时英属区域的帕米尔人上层主动投入阿迦汗门派,然后他们把这个门派传入到中国这边的塔吉克人中,就这样中国塔吉克人在近代归入了什叶派伊斯玛仪派。
对了,尼扎尔派就是波斯历史上大名鼎鼎的那个刺客派,他们对伊斯玛仪派进行了有些改动,比如他们不认为第七任伊玛目隐遁了,他们延续了伊玛目的传代。