生物的基因有没有可能是“祖传屎山”？ 第1页

我有时候会说人类基因组是代码屎山，人类之外也有许多生物的基因拥有“祖传代码”的低效特征^[1]，但你是不能对所有生物一概而论的，演化更不是“从第一个DNA生物进化至人类，积累了很多祖传代码”这样抽象的情景。

大部分原核生物的基因组是没有内含子的，放眼望去所有的编码都可以发挥功能，尽管经常会有许多功能处在并不好使的状态。

• 远洋杆菌属（Pelagibacter）遍在远洋杆菌（P. ubique）可能是现代地球上数量最多的细菌，估计其数量级在万亿亿亿的程度，可以占据夏季温带海洋表层水中细胞总数的一半左右。该物种世界性分布，是革兰氏阴性菌，以溶解的有机碳为生，是已知的体型最小的独立生活的生物之一，比很多支原体的体型还要小：体长370~890纳米，直径120~200纳米。
• 2005年测序表明遍在远洋杆菌HTCC1062菌株的基因组为1308759bp，是已知的自由生活的物种中最小的基因组，只有1354个基因。它的基因组不含重复的基因拷贝，没有内含子和病毒基因（当然，正在被噬菌体攻击时例外），并适应缺氮的远海而减少了基因组中使用的氮。

人类已经亲自动手修改过一些生物的基因组，从里面剔除内含子和功能较弱的基因，生物仍然可以正常生存，例如克雷格·文特尔领导的研究组用自然界存在的支原体基因组删改出含有525个基因的支原体^[2]。显然，这不是程序员们所说的代码屎山可以比的。

人类基因组里的一些内含子是有功能的，目前保守估计至少15%的碱基对是必需的，美国国家人类基因组研究所的公共联合研究项目“DNA元件百科全书（ENCODE）”则认为人类基因组的80%具有功能——没错，里面有很多是低效的祖传代码，但你并不是总启动着它们的，人类现在的能量获取效率完全支持得起细胞复制时占用这么点核酸。

• 选择性剪切允许外显子和内含子的不同组合让同样的基因结构编码不同的蛋白，不同的基因还可以一起编码新蛋白。人类基因编码的蛋白质数量比基因数量高一个数量级，编码的RNA数量则比基因数量高两到三个数量级。
• 而且，你很快就会看到生活方式远比我们原始的生物在使用超过我们许多倍的庞大基因组。
• 2020年，对整个人类基因组的研究有一定进展：基因型-组织表达项目相关的研究人员于九月上旬在《科学》、《细胞》等杂志上发表了15篇论文介绍他们的发现，《科学》杂志以封面报道的形式对此进行了介绍，你可以去看看。

根据过去几十年的观测事实，基因编码不是程序源码，而是备用工具箱，你无法从基因里看出器官排列的方式，多细胞生物的身体构造在很大程度上是细胞发生过程和环境互动的产物。演化也能随机地造成祖传基因的丢失或失去活性，现在每个人的基因组的两万来个基因里都有约20个完全沉默。

现代生物学已经放弃“高等生物”“低等生物”这样不准确的描述，“庞大的基因库”也是风趣的表达：

• “基因库”是互相能产生可育后代的群体中的全部个体所含有的全部基因的集合。
• 个体数量极多、遗传多样性高的物种的基因库远比人类大，毕竟全人类的遗传多样性比东非的几千只猩猩的遗传多样性还要低。
• 个体的基因组不是基因库，人类基因组也并不庞大。

人类染色体才46条，碱基对才30亿个，基因才20000~26000个，说难听点，够干啥的。

• 老鼠基因组含约33亿个碱基对，约29000个基因。
• 瓶尔小草属的植物拥有已知多细胞生物中最多的染色体，约1260到1400条染色体。
• 石花肺鱼拥有已知多细胞动物中最大的基因组，约1300亿个碱基对。
• 衣笠草拥有已知多细胞生物中最大的基因组，约1490亿个碱基对。

是“多细胞生物中”哦。

• 色藻界纤毛虫门旋毛纲的单细胞生物Sterkiella histriomuscorum拥有已知生物中最多的染色体，其二倍体大核装有约16000条染色体。
• 无恒变形虫Polychaos dubium拥有已知生物中最大的基因组，约6700亿个碱基对。这是1960年代的分子生物学技术测出的，有人认为含有很大的误差^[3]（当年测定大变形虫拥有约3000亿个碱基对，现代技术重新测定则为约400亿个，但你瞧瞧咱们那29亿~30亿的数据好了）。

单细胞真核生物用一个细胞实现极度复杂的功能和丰富多样的行为，其身体构造的复杂程度和基因组的规模都和你我身上的细胞不是一个概念。谈人家是低等生物，很大程度是因为十九世纪的科研工具的性能太差，看不清楚人家在干什么。

参考

1. ^ 可以类比为几百个人堆积木，堆得歪歪扭扭、乱七八糟，但你千万不能抽里面的积木，抽一块就可能造成整个坍塌。结果每个人都往上继续加积木，弄出的东西越来越臃肿、越来越不稳定。
2. ^ https://science.sciencemag.org/content/286/5447/2165.abstract
3. ^ https://doi.org/10.1016/j.tree.2003.10.007

推荐一本书《《人类这个不良品》。

先说一个：人的视网膜安反了。

是的，所以转基因（GMO，基因编辑，或者从业者对同一个事物的任何称呼）是不安全的。转基因的基本原理就是：

第一步：把外来基因复制粘贴进去，结果要么是根本复制粘贴不进去，要么是复制进去也不表达（生物基因虽然是屎山，但是和计算机代码屎山不同的是，生物，特别是高等生物有非常聪明的基因沉默机制，除了正常的繁殖，异常的基因改动绝大多数都会被屏蔽掉，完全不表达，或者表达出蛋白质也会形成包涵体，不能发挥生理作用）；

第二步：为打破基因沉默，加入各种强迫基因表达的元件（最常见的是强启动子），结果基因表达了，基因表达出的蛋白质参与了生理生化过程，但是：

1，生理生化过程是一个复杂网络，牵一发而动全身；

2，一个基因可能参与不同蛋白质的表达；

3，基因在DNA分子上的顺序对基因表达有影响；

4，加进去的那些强力元件不老实，影响其他基因的表达；

很快发现，转基因生物出现各种奇奇怪怪的bug（按基因工程术语说是脱靶效应或非预期性改变）；

第三步，把第一步和第二步重复成百上千遍，从中挑选出表面上既表达了目标基因，又没有出现明显的bug（生物本身无法存活，强烈毒性，显著低产量等）的转基因生物，至于完全可能出现，却几乎无法辨识的不太明显的bug：

1，致癌等长期安全影响；

2，基因漂移到其他生物体导致的环境影响；

等，就自欺欺人地认为不存在，或者做一些假数据或刻意挑选的数据假装它不存在。

第四步，把第三步得到的转基因生物量产推向市场，宣布攻克转基因重大课题，向农民推销，向国家要钱，和网络反转势力吵架等。

我以上说的每一步都是有事例证实的。反转基因界的书多为通俗读物，适合知乎网友的，写的专业的不多，有两本书推荐给大家，可惜目前均未引进国内：

1，Altered Genes, Twisted Truth（改变的基因，扭曲的真相），作者Steven Druker是美国的公共利益律师，他在书中揭示了美国政府和主要科研机构如何系统地歪曲关于转基因生物的事实以及质疑其安全性的科学研究。

2，Pandora's Potatoes: The Worst GMOs（潘多拉土豆：最糟糕的转基因），作者Caius Rommens曾在孟山都、辛普劳公司开发转基因，特别是作为领衔科学家为后者开发了一种转基因土豆，后来他却开始怀疑自己开发的产品的安全性，以及现有的监管体制，转向反转基因阵营。

唉……

我妈为我操碎了心。

说起来，我妈真是不好说的。

她是个善良的好人。但有些事情啊。

～

比如前妻的条件就是，不离婚可以，让母亲交出我名下房子的钥匙。

母亲居然还准备交出来。

那房租是给她们补贴家用，吃药的。不然二三千块工资过得非常拮据。

我就是看到这一点，才下定决心离婚。

自己的钱去讨好老婆就算了。威胁到我父母，那就激怒我了。

略施小计，让她告到法院。我知道她是利令智昏，贪得无厌索求无度。然后拿出证据，证明她是贪图家产，转移隐匿巨额财产。

她官司败诉还要赔我钱。

再一反起诉，要求追查夫妻共同财产去向。一套组合拳，打得她痛哭流涕，晕头转向，不知所措，又来求和解。

然后大笔一挥，给钱走人。

这事我绝对厚道。

那数额的一半，不是夫妻都够把牢底坐穿了。她是吓得单位都换了。

我妈还在埋怨我没有好好对她。最后还在给她们家陪笑脸。

利令智昏。

善也令智昏。

～

宁可倒贴几百上千万的房子……就怕我没人要。

这是第一起

～

第二起。

我姑姑特别爱打麻将。那天来我们小区借麻将，说要给我介绍对象相亲。

反正我家族很大很大。

大到我都不知道到底有多大。估计有一个县的人口。

所以亲戚关系没有专门的研究人员是搞不清的。

是真的。我幺爷，没事做就在就研究我们家族的历史族谱辈分。还出了本书。

我那天上网一搜，我们家也算望族。但不高贵。所以也不会随意起诉。历史上溯到洪武年间，属于各路野鸡家族历史爱好者研究的基础材料。

反正来了一些我爸也搞不清的乱七八糟的亲戚。

请了一顿饭。好几桌。

然后叫出一个大妹妹。让我认识。八十后。

该妹子一看就病态，凸目，疲惫，但化妆了。但还是掩盖不住一股丧气。

一问，父亲癌症走了，母亲卧病在床，在做微商养活自己。

我一听就傻眼了。

母亲浑然不觉，当场就要认干女儿。

我急忙使眼色制止。最后半发飙。母亲才看我不善。

父亲是老江湖，也看出这群人“鬼打架”。也制止了我妈。

因为坐得近，这妹子口里臭气熏天，一说话要把我熏死。我强忍着，最后去洗手间吐了一次。

然后这群老年亲友团，吃饱喝足，等我买了单，一千多。最老的一个倚老卖老的开始强加于人。

为了礼貌，八十多了，没有让她下不了台。回去就把她拉黑了。

回头跟我妈妈说，以后这种不要浪费时间跟金钱。

不靠谱。

什么人都要认干女儿。

冒着倾家荡产的风险挽救一个绝症家庭，也要当场认干女儿，生怕我没人要？

～

第三次是一个婶娘介绍的她的兄弟的什么什么的女儿。

父母双亡，跟着舅舅在过，在一个国企上班，每月就拿几千块，无房。大龄剩女。

然后的士接送，招待，请客，吃饭，不在话下。全部鄙人买单。

尬聊几句。她态度冷淡，叫着我要回去上班。

最后对我大喊大叫。让我不要送她。

我最后直接把经过对着婶娘说了。然后告诉家里人，不要弄些不清白的人来见我。

大家都是奉旨相亲而已。而且还是我全款。专业一点好不好，敬业一点好不好。

～

第四次，母亲介绍了一个同学的认识的旅游旅伴认识的。

其实我妈那群同学真是一言难尽啊。这么大年纪搅在一起，还在为一点小事搞得勾心斗角，拉帮结派，七十多了，还看不开又离不开。

然后我前妻也是我妈同学的女儿。一家都是极品。几十万上百万就不顾吃相的。一辈子没拿过五千以上的薪水。

这个同学稍微有点身价，上千万吧。丧偶，找了一个。因为续弦要求把财产留给她儿子，立刻就分了。

也算果决。

找的这个是个做酒店的。由于他跟我母亲关系好。于是奉旨殷勤招待。

花了七千多。酒店，出租车，日常饮食，游玩，都是我出钱招待的。

这位总算没有让我花钱又给脸。至少面子是过得去。而且人也挺机灵的。把我妈我爸我姐姐哄得心花怒发。

只是我们两个都知道不可能，做个朋友也好。至少都是江湖场面过得去的人物，不会叫对方花钱又难受。

酒过三巡，我妈又开始了。

然后哪位开始打哈哈。

最后我妈让她给我介绍工作，说无论多少钱，哪怕三五千都好。

她果然开始大义灭亲，说自己父母住自己酒店都全额付款。

我几乎吐血。她小小一个私营酒店的高龄总监，自己明天都不知道在哪里。

我们聊职场，其实她的疑虑更大。压力更大。

而且她并不善于学习，看不透许多东西，也就人际关系还行。

她朋友介绍的几个股票，看了看都是坑货。我推荐的她拿不准。

她还是拿钱去买车了。

将来成就也就那样。适合当朋友。

你让她给我介绍事？

～

其实我妈并不知道我在外面的成就，能力，薪水，与预期。

只知道我多病，离婚，失业。非常担心。

搞出很多啼笑皆非，如果是同事，或者朋友，足够让我觉得是侮辱，而当场翻脸的提案。

什么让我去到月薪二千计件工资的qq文字工作群里求人。

我尼玛肯去指导他们一下都是客气了好不好。

家里资产小千万，我做过几个上亿的产品，你叫我低三下四去求一个小小的总监，文字编辑？

我去求别人，别人会怕好不好。

抛开赚钱不谈，一般的文字编辑，总监，其能力成就，我真是瞧不上。更别说为其打工。

至于薪水。

他们心脏不好，我没告诉她我一天的波动。够这些人996忙活一二年了。

这还是我仅仅拿着一点点本金搞得事情。

至于她找的那些相亲对象。

我最后已经失去了耐心。

直言，你那群同学都老了。而且社会层次都那样。别在意跟你关系如何。最重要的是适合。是配得上这个家庭。

不要找一些不清白不靠谱的人来侍候。看别人脸色。比如前妻那样的。

这个家庭谁来都是衣食无忧。

你儿子其实虽然没有学历，但是身价能力外貌绝对属于及格线以上的。

应该问另一半的助益，不是看她的脸色。

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反正我妈的理论就是这样：

如果别人闹，那肯定是不闹的一方不对。

如果别人给你脸色看，那肯定是你做的不够好。

如果相亲碰到的都是别人的脸色，说明自己还不够谄媚。

所以知乎评论说这样的婆婆好相处。我真是吓出一身冷汗。

此婆只能有一个笨一点的媳妇。

她一辈子的精力智商都花在为别人身上。

她要不是我爸，早被人吃干抹尽了好不好。

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  hang-yin-72-38 网友的相关建议: 
      

没别的意思。

明清时期，由于谥号早已泛滥，所以君王的谥号都是非常夸张的。

但好的一面，是谥号泛滥几百年后，文官总算摸索出了一套谥号规则，方便后世。

协天翊运执中垂谟懋德振武圣孝渊恭端仁宽敏庄俭显皇帝

协天翊运，是清朝君王谥号的标准格式。X天X运，其中天运两字固定不变，每个清代皇帝都有（皇太极除外，他将后金改名大清，登上帝位。他的谥号起手为应天兴国，而不是应天兴运。代表他不是单纯的继任者。）

第一、第三个字选好听的字，当填空题，喜欢什么字就写什么，当然不能和祖宗争。

清朝皇帝的谥号，标准格式为X天X运XXXXXXXXXXXXXXXXXXX皇帝。（部分皇帝除外）

其中X代表的，就是不同的字，虽说不同，但翻来覆去也就好听顺口的几个字。

文、武、神、圣、睿、仁等好听的字眼几乎每人都有。

这些字组合起来，就是描述这位君王生前功业，当然是幻想中的。

我的意思是，这些字描述的场景，是不存在于现实中的。

如果严格按谥号一开始的规则命名，唐、五代十国、宋、辽、金、西夏、元、明、清等朝代的，大部分皇帝，基本谥号都不会太好听。

回归正题

咸丰皇帝的谥号，其实可以拆分成三个部分。

第一部分为前四个字。这一点明朝也一样，都是前四字为规定格式。

协天翊运，没其他意思，代表咸丰是清朝的正统皇帝。

从第五个字开始，到二十二个字，这十八个字，全是废话。

执中垂谟懋德振武圣孝渊恭端仁宽敏庄俭

说好听点，这是从咸丰生前所有经历的事情里，找出闪光点，然后安上好听顺口的字。

这一点从唐朝就开始了，也不好说清朝怎样。

最后三个字，就是咸丰真正的谥号。

前面那么多字，权当没看到就行，看倒数第三个字就行。

显——行见中外曰显；受禄于天曰显；圣德昭临曰显；百辟惟刑曰显；有光前烈曰显；中外仰德曰显；德美宣昭曰显。（至于咸丰皇帝符合哪一条，大家心里有杆秤。）

和咸丰的庙号清文宗加在一起，就是清文宗显皇帝。

清文宗、清显帝、咸丰皇帝，为后人对爱新觉罗·奕詝最广泛的称呼。

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以下为清朝全部君王谥号（溥仪除外，因为没有。）

清太祖爱新觉罗·努尔哈赤：承天广运圣德神功肇纪立极仁孝睿武端毅钦安弘文定业高皇帝。

清太宗 爱新觉罗·皇太极：应天兴国弘德彰武宽温仁圣睿孝敬敏昭定隆道显功文皇帝。

清世祖 爱新觉罗·福临：体天隆运定统建极英睿钦文显武大德弘功至仁纯孝章皇帝。

清圣祖 爱新觉罗·玄烨：合天弘运文武睿哲恭俭宽裕孝敬诚信中和功德大成仁皇帝。

清世宗 爱新觉罗·胤禛：敬天昌运建中表正文武英明宽仁信毅睿圣大孝至诚宪皇帝。

清高宗 爱新觉罗·弘历：法天隆运至诚先觉体元立极敷文奋武钦明孝慈神圣纯皇帝。

清仁宗 爱新觉罗·颙琰：受天兴运敷化绥猷崇文经武光裕孝恭勤俭端敏英哲睿皇帝。

清宣宗 爱新觉罗·旻宁：效天符运立中体正至文圣武智勇仁慈俭勤孝敏宽定成皇帝。

清文宗 爱新觉罗·奕詝：协天翊运执中垂谟懋德振武圣孝渊恭端仁宽敏庄俭显皇帝。

清穆宗 爱新觉罗·载淳：继天开运受中居正保大定功圣智诚孝信敏恭宽明肃毅皇帝。

清德宗 爱新觉罗·载湉：同天崇运大中至正经文纬武仁孝睿智端俭宽勤景皇帝。

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