几个可能的原因:
遗传同质化的同一个大群体内部有着多个互不隶属的语系,其实是挺普遍的现象。举几个例子:
Natufian/Levant_N这种(根据现有证据)只传播了亚非语系一个语系的祖先人群,以及目前普遍的语系分化年代晚于语系使用者遗传多样性形成年代的模式,反倒可能是后起的、早期(新石器之前)不常见的。
目前测得的最早的美洲原住民的古DNA样本(Anzick)年代在一万三千年左右,但美洲原住民跟东亚人分化的时间可能已经达到了二万五千年左右(Moreno-Mayar et al., 2018),这个时间足够在一个大的狩猎采集者人群内部分化出不同的、互不相干的语系了。
对于亚非语系的传播来说,虽然一万五千年的摩洛哥的Taforalt古DNA样本就有Natufian相关成分了,但这些传播可能是远早于亚非语系内部的多样性的。换句话说,可能是后来多次的近东向北非的移民抹去/降低了亚非语系内部的语言多样性,导致现在看到的语言分化其实是晚于人群分化的。
另外,除了古北欧亚人(ANE)和美洲原住民的东亚谱系的混合,Pontus Skoglund老师也发现过亚马逊雨林的美洲原住民特有的安达曼/澳大利亚相关成分(Skoglund et al., 2017),这个成分反映的人群暂时被命名为Y-population。这些不同人群谱系的混合也完全能给美洲原住民带来不同的语系。
在 @Mustafa Xia 老师的回答的基础上补充一点。
首先 @Mustafa Xia 老师谈到的几点,尤其是遗传同质人群内部可能有大量不同语言。比如与早期高加索原住民相关的就有苏米尔语(孤立语言)、南高加索索语系、东北高加索语系、西北高加索语系、印欧语系、赫里安-乌拉图语系这六组不相关的语言。这能在一定程度上解释美洲原住民语言多样性。
另一方面,还要一个容易忽略的点。
地理差异。
欧亚大陆中央空旷的同纬度草原走廊和东亚的稀树大河平原,为技术传播和某些偶尔取得优势的语言的扩展提供了条件,这使早期铜器、铁器技术和文化一出现就在欧亚大陆快速传播,并同时导致了那些更早获得冶炼技术的人群的语言快速向外入侵并取代了各地原住民语言。
欧亚大陆的语言史 https://www.zhihu.com/video/1334978164275974144
从上面的视频中,我们可以看到这种铁器时代早期语言的快速扩张,而那些空白的区域,并不是没有语言,大家都是晚期智人群体都是不可能不说话的,空白的原因是这些地区在金属器时代早期几波语言快速入侵之下,各群体所说的语言还没有留下文字记录就被入侵的语言取代了,这些繁多的语言已经无据可考。
这个过程导致欧亚大陆语言多样性的快速削弱。
是几次多样性快速减少的过程,导致之前几千年已经发展出来的语言消失,而不是几千年时间只发展出了铁器时代存活下来这些语言。
在欧亚大陆的西伯利亚-蒙古高原-诸兴安岭之间以及东南亚地区两块区域,就形成了相当丰富的语言系统,由于中世纪到近代之间的一些国家兼并,西伯利亚-蒙古高原-诸兴安岭之间的语言有大量的相互借词,以至于曾经把她们错误的分类为“阿尔泰语系”乃至“阿尔泰-乌拉尔超语系”,后来学者注意点乌拉尔语系、突厥语族、契丹-蒙古语族、通古斯语族、余扶-日琉超语族、韩语支,以及这个区域其她大量的孤立语言,这些不同层次的语言之间底层词汇都是完全迥异的,认识到她们都是完全相互独立发源的语言系统。
而美洲整体地形纵向跨纬度狭长,能够维持大量人口的地区除了安第斯山脉就是中美洲的热带雨林气候地区。
这些因素极大的阻碍了美洲各地之间的技术传播和语言扩张。
不过可以看到,克丘亚语和艾玛拉语之间存在大量相互借词,以至于克丘亚语和艾玛拉语一度被认为是一个克丘亚-艾玛拉语系,然而后来的进一步底层词汇研究发现两种语言可能是独立发源的,至今在理论层面还没有完全的定论。
伟大的塔万廷苏尤帝国通过直接统治与朝贡已经使这克丘亚语和艾玛拉语两种语言以及周边的马普切语和穆斯卡语有了大量的相互借词和语法相似性,类似于“阿尔泰诸语”之间相互的情况。而塔万廷苏尤在亚马逊雨林边缘也建立了驿站,安第斯山地的神庙女祭司里也有来自亚马逊的人,说明塔万廷苏尤也已经开始经略亚马逊雨林地区。这一时期正处于安第斯山脉铁器技术快速传播的时期,塔万廷苏尤建立了美洲第一个完全中央集权的大帝国,并独立创立了类似埃赫那吞宗教的近似一神教。
而几乎同一时期阿兹特克帝国在即使没有铁矿铁器的情况下也已经在其势力所及之处把除了玛雅语人群以外的群体都同化为了说纳瓦语的群体(但是阿兹特克搞人祭、鲜花战争的习俗导致其故意留着一些已经纳瓦化的部族没有统一,后来西班牙人来的时候这些部族倒戈一起攻击阿兹特克)。
如果没有西班牙殖民者突然打断两个帝国的扩张与统治,美洲大陆各语言在没有新的外来影响的情况下自然发展,也有可能像欧亚大陆一样只留下四五个超级语系。
塔万廷苏尤可能统一整个安第斯山和靠近安第斯山的雨林地区,并辐射整个南美除北部墨西哥湾海岸以外的大部分地区,广修驿道,召集各地居民建立集体农社,统一大部分语言的词汇和基础语法,在已经出现的铁器加持下自主发明轮子技术或接触玛雅人获取轮子技术也是很快就会发生的事,南美洲除了雨林深处少数难以发现的部族,大部分语言都统一词汇和基本语序语法,只剩下少量底层词汇、语法结构用词习惯能使这些语言中少数语言仍然能被区分出来。
而阿兹特克人继续向中美地峡和北美平原两个方向扩张,所到之处各个群体也都会被纳瓦化。
玛雅语的诸城邦则像腓尼基和希腊诸城邦控制地中海一样控制墨西哥湾沿海和诸群岛,使诸群岛玛雅化。
可惜历史无法假设,西班牙殖民者来了以后,原住民被残酷的奴役、屠杀,种植园繁重的劳动加上卫生条件的极速下降导致大量人口不幸死亡。
克丘亚语、艾玛拉语、马普切语、玛雅诸语存活下来,仍然有大量的母语人口,其中以克丘亚语为母语的人口仍有1千多万人,玛雅语系内诸语总共有600多万人,但是却在自己出生的地方被西班牙语群体边缘化。
瓜拉尼语群体依靠参军为国牺牲,被杀的父系几乎只剩西班牙来源,换来了瓜拉尼语成为巴拉圭的并列官方语言。
而纳瓦语则基本上母语人口只剩下西纳双语人口,虽然也有一百万人口,但是双语导致纳瓦语基本缺乏日常使用的机会,成了濒临灭绝的语言。
这些语言自然也没有机会去影响其她的美洲语言。
这样的最终结果就是美洲原住民语言看起来多且差异巨大,而每一种的使用者都不多,想要相互交流还必须用殖民者的西班牙语、葡萄牙语、英语。如果自然发展的话,美洲语言的情况随着铁器时代全面到来可能不会这样,而是变成和欧亚一样。
最后,作为塔万廷苏尤文化的崇敬者,再次祈祷,努力生活到现代的塔万廷苏尤文化未来继续越来越好,再次成为主导文化,克丘亚语和艾玛拉语并成为全球使用者数量、各通用领域前几大的语言。