我认为印度目前应该不止240种新冠变异体。
一
这实际上涉及到一个数量和比例的问题。
发现变异体(新毒株),并非通过核酸检测,而是对核酸检测确诊阳性的样本在做基因测序。核酸检测和基因测序是两回事,后者会复杂很多。
一个国家发现变异体的多少是一个复杂的问题,包括感染者数量、测序比例、国际入境人数以及疫苗使用情况等都是影响因素。我们把问题简化,只考虑最重要的两点。
简单来说,感染者越多,基因测序比例越大,发现的变异体就会越多。
理论上来说,美国的变异体数量应该是最多的,这点我想不难理解,但实际上美国发现的变异体并不多,原因在于,美国做的病毒样本测序比例很少,这也是广受国际批评的一点。
美国仅仅对0.3%的感染者样本进行基因测序,这个比例远低于很多发达国家和地区,像英国常规对4%的样本做基因测序,澳大利亚更是对将近6成的样本做基因测序。目前在GISAID数据库中,有45%的新冠病毒测序数据来自于英国。
美国拥有世界上最强大的基因测序技术,测的少并非技术水平不行,这跟之前川普时代的防控思维有关。相比之下在发展中国家中,南非的检测还是比较好的,这可能跟多年来南非一直在做HIV防控有关。
二
说完不同国家的测序比例,再说变异体本身。病毒在自然界的演化本身是随机的,大多数变异并不会显著影响到病毒的生物学特性,只有少数突变会导致较大改变,进而影响到疫情发展和我们的防控策略。
比如在全球那么多变异体当中,目前最受关注的变异体有几种
-B.1.1.7:即常说的英国变异体(PS:为什么你会看到一个变异体有不同名字,比如有叫B.1.1.7也有叫501Y.V1的,因为目前国际上还没有统一的命名系统),2020年9月首次出现,携带7个关键突变,目前已经是英国等一些国家的主流毒株,已在70个国家有发现。有研究发现其传播性增强,并且死亡风险也可能有所增加 。
-B.1.351:即常说的南非变异体,和英国变异体似乎差不多时间出现,携带4个关键突变,目前在超过30个国家发现。B.1.351的最大问题是携带疫苗抵抗的突变(E484K),已导致多种疫苗效力降低,甚至导致牛津疫苗几乎无效。
-P.1:即常说的巴西变异体,最早在今年1月份在抵达日本的巴西旅行者身上发现,目前在超过4个国家发现。P.1有17个突变,其中有4个是关键突变,包括南非变异体具有疫苗抵抗的的E484K突变,有研究认为P.1也会导致疫苗效力降低。
目前变异体非常多,但是我们通常只对那些具有传染性、致病性或疫苗抵抗有所改变的变异体进行重点跟踪。
所以回到印度的新闻,基于印度的测序水平以及感染者数量,我认为实际存在的变异体肯定不止240种。
但数量多少并不是最重要的一点,这次的报道「240种变异体」是比较简单的报道,具体这240种变异体是什么、有哪几种具有值得关注的突变,这需要根据详细的测序数据和流行病学研究进行判断。
首先要明确两个概念:新突变病毒与新变异毒株。
新突变病毒就是与以往的新冠病毒序列对比,发现的不同的变异。
新变异毒株则是在不同的群体中,或者超过一定人群比例里,都发现了某种携带有特定突变的病毒毒株,我们才能认为这是一种具有不同特征的不同毒株。
如果做不到这点,只是在一个患者,或者几个患者中发现某一种或者几种特征的突变,则称不上是新毒株,只能叫病毒产生了新的突变。
所以我们说印度这个240个突变,我认为更多的应该是属于新冠变异,而够不上毒株的程度。
去年8月的时候,印度有过一次报道。
当时印度对是在1500多个样本测序进行分析发现了73个毒株的突变,但真正能成为新变种毒株的,只有B.1.112和B.1.99,这两个谱系。那么在这次公布的240个新突变数据里,能成为新变种毒株的,可能也没有几个。
这两个数字是来自国家生物信息中心的统计,我们现在全球数据里,有对58万的新冠进行了测序,在这些序列里,我们就发现了2万6的变异突变。
那么我查了下在这58万多的测序数据里,印度的数据只有5396个。所以我不知道这次的数据是不是从这5000多个数据里的出来的,还是有更多的数据源。
那么现在印度这5300个数据有多少谱系?有125个谱系。
那么有多少个突变?3470个。
但是现在印度的新冠病例有多少?
过千万的感染人数,只有5300多测序结果,那么在那些过万千的感染人数中,还有多少未知的突变?有什么复杂的情况?只有天知道了。
所以印度的变异数字并不是多,而是我们发现的太少了。
新冠病毒RNA有3万个左右的碱基对,其中显然有一部分突变发生在不表达的基因上或者不影响其对应基因的性状,因此能够增殖并向外传播的变异种理论上应该远远超过240种。印度这种有点钱有点地位才能得到核酸检测的地方,病毒在底层人群中可以肆意传播,变异发生的概率也会提高,多发现一些变异不奇怪。
其他的都不怕,就怕在核酸检测和疫苗的强筛选压力下,能够逃过旧变种病毒和疫苗刺激产生的抗体甚至能逃过现有核酸检测试剂盒的变种成为主流,最终和人玩起猫鼠游戏。
2021年2月2日,印度官方宣布新德里有56.13%的居民新冠血清抗体呈阳性。[1]
是的,印度首都地区的居民已经有6成接触过新冠病毒了。
这。。分明是在养蛊啊。
印度的医疗条件呢?
根据世界卫生组织的数据,大多数发达国家的UHC指标(医疗卫生服务覆盖指数)大都超过了80,德国79。我国76,古巴78,朝鲜68,肯尼亚是57,印度是56。[2]
根据Shruti Rajagopalan及团队的估算,印度大约是每千人拥有1.31张病床。对比世界银行的数据,法国是6.5,韩国是11.5,中国是4.2,意大利是3.4,英国是2.9,美国是2.8,伊朗是1.5。[3]
根据印度中央卫生情报局2019年的数据,印度共有1,154,686名注册医生,换算一下也就是每10万人拥有87.21名医生[4],对比世界银行的数据,世界的平均水平是150.5名,我国是178.55名。[3]
根据测算,印度现有ICU床位是87979张,并且只有一小部分可以用于新冠肺炎治疗。[3]
基本上可以认为印度的医疗条件≈肯尼亚的水平。
所以,指望印度能够控制得住疫情,难度很大。
在印度这么低检测率的情况下,新冠累计确诊也达到了10766245例。[1]
要知道,印度也是个超过13亿人口的国家。
基数这么大,变异病毒多也是意料之中的事情。
“王炸”不是浪得虚名。
以上。
印度发现240种变异新冠病毒,先说下这个240种变异。
我们现在知道新冠病毒是由RNA、蛋白质及膜组成,所谓突变是指RNA的序列发生变化。
比如之前的欧洲发现病毒株D614G,就是新冠病毒的RNA序列变化后,新冠病毒刺突蛋白上的第614个氨基酸残基由天冬氨酸(D)变成了甘氨酸(G)。
因此,要知道是否发生了变异,需要从感染者体内分离出完整的病毒并进行测序,做起来比较难(肯定有变异会被忽略,因为不是人人都做,所以应该也不止240个,但不影响结论)。
这种变异是由于RNA复制过程中出了错,绝大多数是没有任何影响或者影响很小的。
可以看国家生物信息中心统计的数据,只是ORF1ab序列发生的RNA变异就快接近2万了,S序列发生的突变也有几千了。
但是被大家广泛关注的只有D614G、E484K、N501Y这几个可能影响了新冠病毒功能的突变。
所以240个数量听起来吓人,真正影响功能的可能很少,还需要等待印度进一步公布结果。
怀疑。
你说印度存在240种变异新冠病毒。
我信。
你说印度发现240种变异新冠病毒。
合着印度的新冠病毒之前都不变异。前天开大会,决定昨天在检测机构附近集体变异。