百科问答小站 logo
百科问答小站 font logo



澳大利亚报告全球首例奥密克戎变种亚型「难被 PCR 识别,传染性强」,将对全球疫情产生哪些影响? 第1页

  

user avatar   paizhaorushi 网友的相关建议: 
      

谢老铁邀。

卫报和ABC又后知后觉了……

我这边已经在12月6日抢跑了,

不好意思又比主媒早了两天,

比昆士兰卫生署早了一天~

——请品鉴:

简单来说,昆士兰这个Omicron分支已经被命名为BA.2,

相对地,其他的Omicron被命名为BA.1。

之前的Pango编号B.1.1.529已经停用。


BA.1和BA.2在的突变列表区别如下:

↑ 如上图,

  • 第一列是核酸突变,
  • 第二列是突变所在基因,
  • 第三列是对应核酸突变的氨基酸残基变化,
  • 第四列是BA.1特有突变,
  • 第五列是BA.2特有突变,
  • 第六列是两者共有的保守突变,
  • 最后是一列备注。

所以可以看出,

ANU的Peter Collignon老师又在谎报平安了……

这尼玛也叫“基因片段稍有区别”?

BA.2的63个突变里面有27个是特征突变,

这明明应该叫做“基因片段连亲妈都不认识”好吧~


下面咱来撸一撸演化树。

——请品鉴:

↑ 上图是Omicron的(无根)演化树,其中:

主干上的蓝色小圆点都是BA.1;

  • 分支上的两个蓝色小圆点则是BA.2(这张图略过时了,现在应该有8个小圆点了);
  • 大佬Rambaut老师认为,BA.2与BA.1有比较晚近的共同祖先(疑似MRCA?);
  • BA.2和BA.1的分家大概发生在2021年年中;
  • BA.1当中分出来了一支橙色小圆点是尚未走完命名流程的BA.1.1(比BA.1额外多出一个S:R346K突变)。
  • 比BA.2更靠左的那个黄色小圆点,那玩意儿于2021年7月底在豪登省检出,疑似与Omicron有共同祖先(2020年5月左右分的家,比BA.2更早)。

问题就在于,

2021年7月底检出的那个疑似和Omicron有共同祖先的神秘毒株(演化树上的黄色小圆点),

其实已然突变得很厉害了,

或者说全身上下都是阴间突变也不为过。

——请品鉴:

只看刺突蛋白数量的话,足足有21个:

T95I+G142L+V143N+Y144N+N210DEL+L212I+R346K+N440K+N450D+T478K+E484R+N501Y+D614G+P621S+H655Y+I670M+E748Q+S839H+N856K+T859N+T1027I

甩了Delta八条街。

所以我们可以合理假设,

这玩意儿和Omicron的共同祖先,

可能已经经历过一轮偶发快速突变了

或者用人话来说,

就是已经踩中过武林奇遇,

或者已经完成超级赛亚人一段变身了。


而我们已经知道,

BA.1和BA.2的突变列表又甩了上面这奇葩玩意儿十八条街……

所以很有可能,

BA.1和BA.2(或者它们的共同祖先)都是第二轮偶发快速突变的产物。

或者继续用人话来说,

就是BA.1和BA.2(或者它们的共同祖先)已经踩到了第二坨武林奇遇,

已经完成超级赛亚人第二段变身。


所以之前Emma老师接受《Science》采访时的那个说法可能是错的[1]……

——请品鉴:

Omicron并没有从2020年中就开始暗搓搓地躲在平行世界里憋大招,

而是至少冒了两次头。

我们之前没有发现,

只能怪我们监控得还不够严密~


至于说BA.2没有S:69/70DEL,

没法用赛默飞的试剂盒检出SGTF,

这个没啥大不了的。

以色列中央病毒实验室的Shay老师他们,

已经搞出来可以特异性检出Omicron的PCR产品了,

——请品鉴[2]

——引物设计如下:

这玩意儿同时针对S:210DEL, N:29/31DEL,以及ORF1a:3675/3677DEL三处缺失突变。

可以说是万无一失了。


但是……

说句丧气话吧,

靠PCR检测快速揪出Omicron这种走捷径行为,

可能并没有什么卵用。

因为根据多个不同模型预测,

最迟到12月底(很有可能更早),

Omicron就会成为全球主流毒株。

到时候随便碰到一个阳性的都大概率是Omicron……

——比如说,请品鉴:


从现在到月底只有不到20天了,

中间还要放圣诞大假

从头开始生产新试剂盒也来不及了,

还不如两眼一闭,两腿一分,

躺平了吧~


(至于说国内咋办?

国内反正都是100%测序,

完全没影响)

参考

  1. ^ https://www.science.org/content/article/where-did-weird-omicron-come
  2. ^ https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.07.21267293v2.full.pdf

user avatar   rewrgf 网友的相关建议: 
      

所谓“难被 PCR 识别”,并不是核酸检测不出来的意思,而是没有omicron标志性的SGTF,无法快速识别是不是omicron的意思。

貌似现在西方有一种声音,“要与delta共存,但要防控omicron”,这种论调,无疑是荒谬而没有实际操作性的。唯一的结局是转进“与omicron共存”。毕竟21世纪是生物的世纪,病毒传播的自由是21世纪最高的自由。

拜登已经在吹风了。

辉瑞说的很有言语的艺术,“三针辉瑞疫苗对omicron的效果,与两针辉瑞对delta的效果相当”,然后开动宣传机器就行了。至于“两针辉瑞对delta的效果”具体是多少,或者穿透一下这个问题——有多少美利坚耗材会死了或者后遗症,显然拜登和他的团队是不care的,反正是耗材。


user avatar   xing-wei-yi-zhu-zhuan-ye-bo-shi-dao-shi 网友的相关建议: 
      

核酸检测测不出来,就意味着疫情结束。

至于还是会有很多老弱病残因为不明原因的咳嗽发烧挂掉,那不是正常现象吗?比如14亿人口大国印度每年死亡一千万人,因为不明原因再多增加死亡一百万老弱病残,也不令人大惊小怪。

新冠在人类历史上的瘟疫中根本排不上号,这两年造成这么大影响完全是人类自己娇气给作的,当然核酸检测技术的普及是其中必备的条件。


user avatar   lengzhe1984 网友的相关建议: 
      

首先,这个题问的就有问题。

Omicron的新发现的变种,也就是BA.2,这个毒株不是不能被PCR检测到,目前所有的新冠变异毒株都能被PCR核酸检测发现。

现在发现的问题是,想通过PCR快速的区分毒株类型,说实在的这是一个取巧的方式,我们以前并不经常用这种方式。

比如我们平时看报道,都是某地发现了感染者,隔了2天左右,报道会说,经过基因检测,感染的毒株是Delta如何如何。这些都是经过了测序才确认的毒株的分型,PCR是做不到的。

那么为什么说BA.2这个毒株难以被PCR检测分型呢?是因为我们发现的最初版的Omicron毒株,也可以叫BA.1,他有一个S蛋白的69/70的氨基酸缺失突变,而这个刚好可以跟一些检测S蛋白的PCR试剂盒碰上了,也就是说这种特殊的试剂盒可以在检测是否阳性的同时,还能反馈一个是否有69/70的突变,来判断患者是否为Omicron毒株,但这玩意准吗?肯定不准啊,这个要是准了,还测序干啥。

为什么这么说?因为本身这个检测69/70的试剂盒,是以前开发出来检测Alpha毒株的。也就是说,你即便在这个试剂盒里反馈了阳性结果以及69/70的缺失,但你还是不确定这个是Omicron还是Alpha。

我们国内也开发过Delta专用的试剂盒,但为啥大家很少听说呢?因为从Delta大爆发以后,我们遇到的所有输入病例,几乎全是Delta毒株,就突然间没有用武之地了。

所以这并不是什么问题,即便发现了BA.2的这个情况,也只是把以前想图省事的一个方式堵死了而已,如果真的想专门检测BA.2,那依然可以开发专门匹配的试剂盒。但意义有多大呢?

我不理解的是,为什么Delta西方就觉得可以放过,可以躺平,Omicron就要严防死守。你这搞病毒种族歧视呢?瞧不起谁呢?

要么就一起躺平,要不就动态清零,试图人工筛选流行毒株?达尔文棺材板都压不住了好吗?




  

相关话题

  今年会是暖冬还是冷冬? 
  如何看待:黄冈全面排查发现发热病人13000人? 
  如何看待媒体评「限电是一盘大棋」:乱带节奏中产生了不小的「低级红」「高级黑」的效果? 
  随着电影「长津湖」的热映,吴京又被网友逼捐,如何看待此现象? 
  如何看待左氧氟沙星等喹诺酮类药物在美国禁用而国内使用如此普遍?如果禁用那替代药品又是什么? 
  要不要去哈工大新开设的医学部!? 
  如何看待 2021 年 1 月 19 日成都双流金桥检出环境阳性样本,居民夜晚排队核酸检测? 
  国台办回应「民进党当局表示对乌克兰的情况感同身受」,称「完全是自作多情」,这透露了哪些信息? 
  阿富汗潘杰希尔冲突升级,反塔力量称数千塔利班人员被困,距离当地局势稳定还要多久? 
  为什么男性平均寿命远低于女性平均寿命? 

前一个讨论
美国 10 月份贸易逆差大幅下降,出口飙升至历史新高,是什么原因造成的?
下一个讨论
美国 71 岁华裔老人连遭 18 枪遇害,警方初步认定为随机杀人,如何看待美国亚裔不断遭受暴力和歧视?





© 2024-11-24 - tinynew.org. All Rights Reserved.
© 2024-11-24 - tinynew.org. 保留所有权利