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如何看待日本发现一种新型变异新冠病毒,目前感染病例累计超过90例,会对目前的疫苗产生影响吗? 第1页

  

user avatar   lengzhe1984 网友的相关建议: 
      

我去查了下这个报道的信源,嗯,果然是海外网。

【日本发现一种新型变异新冠病毒 感染病例累计超90例】据日本共同社18日报道,日本国立传染病研究所当天表示,在日本国内发现了一种新型变异新冠病毒,其毒株与之前在英国、南非等国发现的变异病毒不同。该变异病毒有可能会弱化免疫效果,但感染性并没有增强。日本国立传染病研究所公布的数据显示,截至2月初,关东地区已经累计检测出91例变异新冠病毒感染病例,机场检测中发现2例。(海外网,TY)

我现在对海外网有点过敏,他们每次翻译的国外的疫情报道多多少少都有问题,要不是搞混信源,要不就是报道片面。

谷歌一下你会搜到这个原报道,其中很清楚的写了:

The new strain appears to have originated overseas but is different from other types that have been found sporadically in Japan, according to the National Institute of Infectious Diseases. It has the E484K mutation on the spike protein of the virus that has been found in other variants, which may undermine the effectiveness of vaccines.[1]

根据国立传染病研究所的研究,这种新的突变毒株可能是从国外传播进来的,在日本已经有小范围的传播,这种毒株携带了E484K突变。

所以海外网又成功的把两句话合并在了一起,给人造成一个大新闻的感觉。

正确的报道应该是,日本发现了一种不同于南非B.1.351 和英国B.1.1.7的新型新冠病毒毒株,但在日本新发现毒株上同样发现了南非B.1.351和巴西B.1.1.28具备的E484K突变,该突变会造成新冠病毒的传染性更强,同时还会导致新冠病毒免疫逃逸能力。

真的,疫情相关报道来不得半点马虎。

以下是科普内容:

什么是E484K突变?

在E484K突变中,带负电荷的氨基酸(谷氨酸)被带正电荷的氨基酸(赖氨酸)取代,结构分析表明,由于E484K突变,产生了一个新的ACE2结合位点。这可能使得ACE2和位于RBD的天然结合位点之间产生了明显更强的相互作用。
也就是说E484K突变会使得新冠病毒的传染性更强,同时多篇研究都指出E484K还会导致新冠病毒免疫逃逸能力。
这种突变型在南非B.1.351 / 501Y.V2和巴西B.1.1.28 / P1 / P2变体中都有发现,最让人头疼的是,E484K突变目前被认为是造成康复者血浆中的中和抗体,疫苗产生的抗体对新冠病毒失效/部分失效的主要原因。
比如现在上市的辉瑞和Moderna两种疫苗都对这个突变部分降低了保护力,而即将上市的Novavax重组蛋白疫苗对这种突变的保护力也从对一般病毒的90%以上降低到了60%左右。

日本本土出现的E484K突变,原因也无外乎两种:

第一种,就是病毒重组(Recombination)。这是说某些不同的新冠病毒,在同时感染了一个细胞以后,在他们复制的过程中可能错误的组装了彼此的基因组导致的。比如巴西的的E484K突变病毒,随着人类宿主的活动,传播到了更多的地区,并与当地传播的毒株同时感染了一个宿主,并在复制过程中发生了重组现象,导致当地毒株也获得了这种突变。

第二种,就是平行进化(parallelism)。大概就是说虽然这些病毒本身没什么亲缘关系,但是在某些相似的外界压力下,都在向同一个方向(比如E484K)进化,或者说因为相似的外界压力,使得拥有E484K这种突变的病毒更容易传播和存活。这其实就是我以前提到过的,如果我们开始大规模的接种疫苗,就不得不面对的一种情况。

但不管日本发现的这种突变是来自于国外的传播,还是来自于本土的病毒突变,这可能都是一个必然的趋势。

为什么这么说呢?

根据一篇对巴西的E484K病毒突变的研究论文中分析内容可以发现,[2]在巴西当地的多个亲缘关系较远的毒株中都发现了E484K突变的存在,他们认为这个更多的应该是平行进化造成的结果,也就是说在特定压力条件下,新冠病毒可能会定向的像E484K这个方向突变。

而这个特定压力,我猜测可能是早期临床的疫苗,也有可能是康复者的抗体血清。

就提高病毒适应性而言,E484K突变可能是不同病毒谱系的关键进化事件。

多国相继出现了E484K突变,这可能会是一个必然的趋势。

所以日本出现的这种新的变异类型也没什么好奇怪的,甚至说是一种必然的,而甚至随着全球疫苗接种的步伐推进,未来像E484K这种能逃脱疫苗的突变甚至会成为新冠病毒的主流突变方向。

参考

  1. ^ https://www.jpost.com/health-science/japan-finds-new-covid-19-variant-in-91-patients-659507
  2. ^E484K as an innovative phylogenetic event for viral evolution: Genomic analysis of the E484K spike mutation in SARS-CoV-2 lineages from Brazil https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.01.27.426895v1



  

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